Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 MTCO2P8-201ENST00000412213 658 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 MTATP6P27-201ENST00000416987 621 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 SSXP9-201ENST00000417503 292 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 LINC00387-201ENST00000422609 458 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 AC109583.1-201ENST00000432156 268 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 AL354977.1-201ENST00000438147 679 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 AC006333.1-202ENST00000440504 555 ntTSL 4 BASIC2.69□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 AL050303.1-201ENST00000444356 458 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 RPL23AP20-201ENST00000447965 421 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 GJE1-201ENST00000450456 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 NDUFA6-201ENST00000470753 475 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 NAA50-206ENST00000493454 964 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 MSMO1-203ENST00000504317 1026 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 LINC02379-201ENST00000505741 300 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 ARL4AP2-201ENST00000507378 601 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 AC093534.2-201ENST00000511418 420 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 AC008700.1-201ENST00000512571 654 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 AC093677.1-201ENST00000514414 678 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 AC136777.1-201ENST00000517765 369 ntTSL 4 BASIC2.69□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 AC021736.1-201ENST00000521143 563 ntTSL 4 BASIC2.69□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 AC022861.1-201ENST00000522981 663 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 AL133271.1-201ENST00000538229 291 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 LINC01405-202ENST00000547607 674 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 AC053481.3-201ENST00000577881 843 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 AL022099.1-201ENST00000604551 712 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 AC106052.1-201ENST00000608029 497 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 AC131235.4-201ENST00000609288 620 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 STARD13-AS-239ENST00000609588 982 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 OR8H2-202ENST00000618136 1038 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.69□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 AC073052.2-202ENST00000622296 775 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 FP475955.2-201ENST00000623720 458 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 SATB1-AS1-269ENST00000630766 591 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 OR10AG1-202ENST00000641071 2807 ntAPPRIS P1 BASIC2.69□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 AC106754.1-201ENST00000562632 1513 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 ADAMTS9-AS1-207ENST00000594810 3609 ntTSL 4 BASIC2.68□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 RNU6-343P-201ENST00000364709 104 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 RNU6-621P-201ENST00000364752 109 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 MIR490-201ENST00000384865 128 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 RPL23AP29-201ENST00000397284 453 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 AL592310.1-201ENST00000414330 671 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 RPS29P4-201ENST00000414733 161 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 AC106883.1-201ENST00000418805 562 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 TIMM9P2-201ENST00000419324 266 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 AL137014.1-201ENST00000420490 1226 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 AL451127.1-201ENST00000422909 624 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 AC233728.2-201ENST00000425348 757 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 ATP5F1P1-201ENST00000433775 569 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 AL445259.1-202ENST00000434768 379 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC2.68□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 SNRPEP4-201ENST00000435815 279 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 RPL21P134-201ENST00000453468 483 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 AC092155.2-201ENST00000454675 477 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 RNU7-136P-201ENST00000458819 69 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 PGRMC2-204ENST00000503872 1028 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 AC021146.8-201ENST00000507455 733 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 CBX3P3-201ENST00000508108 532 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 AC079395.1-201ENST00000510981 262 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 AC022360.2-202ENST00000517308 407 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 AC026403.1-201ENST00000518938 295 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 AC022690.1-201ENST00000526681 550 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 DEFB130C-201ENST00000528518 237 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 AL512347.1-201ENST00000566420 503 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 OR4K8P-201ENST00000578842 1048 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 OR4K7P-201ENST00000580232 945 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 AC037487.2-201ENST00000581796 537 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 AC011458.1-201ENST00000604034 617 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 AC004853.1-201ENST00000604902 698 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 AL390208.1-201ENST00000605885 644 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 MESTIT1_2.1-201ENST00000616328 235 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 AC006111.3-201ENST00000622137 383 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 AC116618.1-201ENST00000634617 774 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC2.68□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 ZNF639-206ENST00000484866 1730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 AC006378.2-201ENST00000623178 2476 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 STATH-202ENST00000381060 534 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.465-201ENST00000384293 102 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 RNU6-906P-201ENST00000384700 70 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113 ms