Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 SUB1-211ENST00000512913 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 AC119751.5-201ENST00000514077 770 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC2.28□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 AC011611.4-201ENST00000547721 779 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 AC007610.2-201ENST00000566770 666 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 AC106734.1-201ENST00000568646 663 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 RPL23AP92-201ENST00000603609 255 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 AC004775.1-201ENST00000607389 753 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 CLECL1-204ENST00000621400 611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.28□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.05
TAF1AQ15573 DEFB112-201ENST00000322246 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
TAF1AQ15573 OR5H15-201ENST00000383696 930 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
TAF1AQ15573 MIR7-1-201ENST00000384871 110 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
TAF1AQ15573 MTND4LP20-201ENST00000402379 270 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
TAF1AQ15573 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
TAF1AQ15573 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
TAF1AQ15573 AC064871.1-201ENST00000444562 427 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
TAF1AQ15573 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
TAF1AQ15573 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
TAF1AQ15573 SEMA6A-AS2-201ENST00000508766 482 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
TAF1AQ15573 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
TAF1AQ15573 LINC01609-201ENST00000519506 424 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
TAF1AQ15573 AC104997.1-201ENST00000519761 717 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
TAF1AQ15573 MTCYBP20-201ENST00000524239 1129 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
TAF1AQ15573 AC069228.1-202ENST00000550272 737 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
TAF1AQ15573 AC078814.3-201ENST00000553036 491 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
TAF1AQ15573 TIMM9-209ENST00000556367 572 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
TAF1AQ15573 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
TAF1AQ15573 GOLGA8M-203ENST00000568033 557 ntTSL 4 BASIC2.27□□□□□ -2.05
TAF1AQ15573 AC090912.2-203ENST00000581177 477 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
TAF1AQ15573 AC008543.4-201ENST00000585694 442 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
TAF1AQ15573 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
TAF1AQ15573 AC073968.1-201ENST00000618594 637 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
TAF1AQ15573 AL109659.3-201ENST00000624985 950 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
TAF1AQ15573 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
TAF1AQ15573 BX649567.1-201ENST00000642071 1134 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
TAF1AQ15573 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
TAF1AQ15573 Z99496.1-201ENST00000469424 1477 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TAF1AQ15573 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
TAF1AQ15573 AC123912.3-201ENST00000600907 1367 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TAF1AQ15573 KTN1-223ENST00000555573 1712 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
TAF1AQ15573 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
TAF1AQ15573 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TAF1AQ15573 RNU6-730P-201ENST00000383954 104 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TAF1AQ15573 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TAF1AQ15573 AL162400.1-201ENST00000418091 359 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
TAF1AQ15573 AC234781.2-201ENST00000426370 994 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TAF1AQ15573 OFD1P12Y-201ENST00000427963 1207 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TAF1AQ15573 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TAF1AQ15573 EZH2P1-201ENST00000431167 291 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TAF1AQ15573 OFD1P13Y-201ENST00000431179 1232 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TAF1AQ15573 ATP5F1P1-201ENST00000433775 569 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TAF1AQ15573 AC072062.1-204ENST00000437897 1132 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
TAF1AQ15573 LINC00113-203ENST00000442550 572 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
TAF1AQ15573 C1orf143-201ENST00000443836 762 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
TAF1AQ15573 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TAF1AQ15573 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TAF1AQ15573 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TAF1AQ15573 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TAF1AQ15573 TRIQK-207ENST00000519069 598 ntTSL 4 BASIC2.26□□□□□ -2.05
TAF1AQ15573 AC113145.1-201ENST00000522408 412 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
TAF1AQ15573 AP000889.2-201ENST00000532684 490 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TAF1AQ15573 LINC02460-201ENST00000543558 536 ntTSL 4 BASIC2.26□□□□□ -2.05
TAF1AQ15573 AC126177.3-201ENST00000551839 688 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TAF1AQ15573 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TAF1AQ15573 AC025588.3-201ENST00000604182 274 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TAF1AQ15573 AL160394.1-201ENST00000624765 724 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TAF1AQ15573 AL356118.1-201ENST00000635272 1078 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TAF1AQ15573 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TAF1AQ15573 PABPC1P9-201ENST00000426076 1612 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TAF1AQ15573 AC097714.1-201ENST00000511272 1647 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TAF1AQ15573 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
TAF1AQ15573 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.26□□□□□ -2.05
TAF1AQ15573 C9orf72-202ENST00000379997 1873 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
TAF1AQ15573 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
TAF1AQ15573 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
TAF1AQ15573 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
TAF1AQ15573 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
TAF1AQ15573 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
TAF1AQ15573 SDAD1P2-201ENST00000441308 2028 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TAF1AQ15573 AC006020.1-201ENST00000420179 1854 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TAF1AQ15573 APCS-201ENST00000255040 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
TAF1AQ15573 C1orf185-201ENST00000371759 915 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
TAF1AQ15573 RNU6-1151P-201ENST00000384684 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TAF1AQ15573 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TAF1AQ15573 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TAF1AQ15573 UBE2V1P9-201ENST00000414760 368 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TAF1AQ15573 AF241725.1-201ENST00000416182 480 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
TAF1AQ15573 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
TAF1AQ15573 OR4K11P-201ENST00000431829 904 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TAF1AQ15573 LINC01307-201ENST00000439146 474 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
TAF1AQ15573 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TAF1AQ15573 AL592182.1-201ENST00000440897 250 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
TAF1AQ15573 PDCD10-214ENST00000487947 716 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
TAF1AQ15573 AC090543.1-201ENST00000492168 485 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.2 ms