Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 DSCR9-205ENST00000585273 751 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 LINC01905-206ENST00000593180 524 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 AL020997.2-201ENST00000602607 184 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 AL596245.1-201ENST00000618994 362 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 AC139792.3-201ENST00000623525 224 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 AL158835.3-201ENST00000625908 565 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 NCOA1-202ENST00000348332 6895 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 LINC02393-202ENST00000614177 1993 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 DGKI-204ENST00000453654 12928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 FNBP1L-206ENST00000604705 1830 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 SAGE4P-201ENST00000442271 3381 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 PTP4A1-205ENST00000626021 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 CASC19-280ENST00000642102 1351 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 SCFD1-207ENST00000544052 2058 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 ZNF962P-201ENST00000443465 3140 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 MS4A1-201ENST00000345732 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 PPHLN1-208ENST00000449194 1583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 F2RL2-201ENST00000296641 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 OR5V1-215ENST00000377154 1266 ntAPPRIS P1 BASIC4.66□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 BTBD10P2-201ENST00000404779 676 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 RNA5SP306-201ENST00000411087 107 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 PSMA4-202ENST00000413382 1019 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 AC004987.3-201ENST00000413879 771 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 RPL17P36-201ENST00000420302 549 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 AL033504.1-201ENST00000427015 773 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 AL035410.1-201ENST00000427409 427 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 UTS2B-203ENST00000427544 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 RPL7P2-201ENST00000427639 268 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 AL356124.2-201ENST00000442449 391 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 AC073486.1-201ENST00000453278 531 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 AC055764.1-201ENST00000454526 473 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 snoU13.8-201ENST00000458890 104 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 AC022034.3-201ENST00000471393 478 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 ALDH7A1P3-201ENST00000492517 345 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 AL139099.1-201ENST00000497398 403 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 AC097372.3-201ENST00000503593 522 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 AC008957.1-201ENST00000510740 478 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 RNA5SP154-201ENST00000516193 111 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 AC090985.1-201ENST00000554440 480 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 AL139317.3-202ENST00000555689 528 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 AL355097.1-201ENST00000555889 539 ntTSL 4 BASIC4.66□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 CHEK2P2-203ENST00000566448 670 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 AC005730.3-201ENST00000583067 366 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 MIR4719-201ENST00000585233 84 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 AL049634.3-201ENST00000604968 457 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 AC055876.5-201ENST00000605667 259 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 ADPRM-204ENST00000609540 1138 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 AL020991.1-201ENST00000612314 373 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 AC099669.2-201ENST00000616549 437 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 AL591424.2-201ENST00000617023 128 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 AC099654.5-201ENST00000636479 350 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 ZNF33CP-201ENST00000432492 2030 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 MTND5P33-201ENST00000571250 1450 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 FAM126B-202ENST00000418596 9333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 POSTN-202ENST00000379743 3196 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 IQCH-201ENST00000335894 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 SYTL2-213ENST00000525702 2727 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 PLS3-203ENST00000420625 3150 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 GABRB2-203ENST00000393959 7191 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 UBE3AP2-201ENST00000429033 2259 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 OR5J1P-201ENST00000313544 939 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 RNU5E-1-201ENST00000362477 120 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 SNORD82-201ENST00000365530 70 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 RNU6-877P-201ENST00000383868 107 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 MIR30B-201ENST00000384850 88 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 FGFR1OP2P1-201ENST00000395943 500 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 AL603766.1-201ENST00000407763 664 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 RN7SKP159-201ENST00000410657 292 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 AMD1P2-201ENST00000412936 992 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 AL049734.2-201ENST00000441066 616 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 AC092755.1-201ENST00000441746 97 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 AL359073.1-201ENST00000448036 403 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 RPL7P52-201ENST00000449200 742 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 LINC01546-201ENST00000457435 674 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 RPL23AP41-201ENST00000484754 458 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 TNFAIP8-205ENST00000504642 711 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 AC010587.1-201ENST00000505809 469 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 LINC02283-201ENST00000511634 474 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 AC016065.2-201ENST00000514530 444 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 AC018437.2-201ENST00000517369 389 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 AC008083.1-201ENST00000547748 663 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 AC009396.3-201ENST00000555680 354 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 HMGB3P26-201ENST00000560051 582 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 AL356432.3-201ENST00000568952 465 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 AC011825.2-201ENST00000583138 553 ntTSL 4 BASIC4.65□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 AC008946.1-201ENST00000599756 421 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 AC068790.5-201ENST00000602741 355 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 PRKCQ-AS1-207ENST00000607996 531 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 GPR171-203ENST00000617554 960 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 AC091953.2-201ENST00000623979 160 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 SPTY2D1-AS1-205ENST00000635674 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 MYOZ2-201ENST00000307128 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 NUP58P1-201ENST00000502546 1738 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 MLIP-AS1-201ENST00000434196 1534 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 IPO8P1-201ENST00000455509 3109 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
UBE3CQ15386 ORC4-216ENST00000540442 6472 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.6 ms