Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 FABP5P13-201ENST00000452144 328 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PTPRKQ15262 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PTPRKQ15262 CFAP44-AS1-202ENST00000498480 686 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
PTPRKQ15262 PGRMC2-203ENST00000503588 818 ntTSL 4 BASIC3□□□□□ -1.93
PTPRKQ15262 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC3□□□□□ -1.93
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PTPRKQ15262 AC007687.1-201ENST00000602704 304 ntBASIC3□□□□□ -1.93
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PTPRKQ15262 RPS7P5-201ENST00000441482 581 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
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PTPRKQ15262 ZNF84-205ENST00000535439 647 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
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PTPRKQ15262 CUBN-201ENST00000377823 705 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPRKQ15262 HMGB1P10-201ENST00000395823 563 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPRKQ15262 RNU2-37P-201ENST00000410695 177 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPRKQ15262 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
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PTPRKQ15262 AC008080.4-202ENST00000440034 1005 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPRKQ15262 TPTE2P6-202ENST00000445572 1007 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
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PTPRKQ15262 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
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PTPRKQ15262 RPL37P6-202ENST00000464216 403 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
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PTPRKQ15262 RPAP2P1-201ENST00000603626 1168 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
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PTPRKQ15262 AC091953.2-201ENST00000623979 160 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PTPRKQ15262 SATB1-AS1-259ENST00000629477 853 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
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PTPRKQ15262 XKRYP3-201ENST00000442113 1116 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PTPRKQ15262 LINC01455-201ENST00000503167 561 ntTSL 4 BASIC2.96□□□□□ -1.94
PTPRKQ15262 AKAP7-208ENST00000537868 1006 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
PTPRKQ15262 AL158801.3-201ENST00000555514 363 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
PTPRKQ15262 AC020895.1-201ENST00000595362 272 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PTPRKQ15262 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PTPRKQ15262 SATB1-AS1-226ENST00000625515 776 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
PTPRKQ15262 MIR4278-201ENST00000636094 69 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PTPRKQ15262 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPRKQ15262 LIPI-204ENST00000614229 1439 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPRKQ15262 RNA5SP189-201ENST00000364920 115 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPRKQ15262 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPRKQ15262 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPRKQ15262 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPRKQ15262 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPRKQ15262 AC007390.1-201ENST00000415722 356 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPRKQ15262 AC073310.1-201ENST00000423226 1033 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPRKQ15262 AL683807.1-202ENST00000432272 382 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
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