Protein–RNA interactions for Protein: Q15025

TNIP1, TNFAIP3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP1Q15025 RPL12P26-201ENST00000452430 487 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TNIP1Q15025 AC008481.1-201ENST00000463278 396 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TNIP1Q15025 RPL31P50-201ENST00000471002 296 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TNIP1Q15025 KLHL6-AS1-201ENST00000491676 503 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
TNIP1Q15025 MTCYBP17-201ENST00000503579 789 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TNIP1Q15025 AC079395.1-201ENST00000510981 262 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TNIP1Q15025 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TNIP1Q15025 AC103783.1-201ENST00000520506 373 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TNIP1Q15025 NDUFB9P3-201ENST00000521269 501 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TNIP1Q15025 REXO2-218ENST00000544827 880 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
TNIP1Q15025 AL163153.1-201ENST00000554223 283 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TNIP1Q15025 HSPE1P3-201ENST00000559254 309 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TNIP1Q15025 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
TNIP1Q15025 Z99289.3-201ENST00000605586 594 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TNIP1Q15025 AC243773.3-201ENST00000613270 256 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TNIP1Q15025 AP002791.1-201ENST00000623291 381 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TNIP1Q15025 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
TNIP1Q15025 SCEL-202ENST00000377246 3081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
TNIP1Q15025 AL161457.2-203ENST00000590767 2663 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
TNIP1Q15025 MIS12-201ENST00000381165 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
TNIP1Q15025 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
TNIP1Q15025 RMDN2-205ENST00000407257 2280 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
TNIP1Q15025 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
TNIP1Q15025 AP002907.1-201ENST00000606361 1430 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TNIP1Q15025 RPL7P26-201ENST00000333817 754 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TNIP1Q15025 LBR-202ENST00000338179 3812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
TNIP1Q15025 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TNIP1Q15025 ELAVL2-204ENST00000397312 3805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
TNIP1Q15025 AF228730.1-201ENST00000397972 663 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TNIP1Q15025 RNU2-15P-201ENST00000410692 191 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TNIP1Q15025 RNA5SP229-201ENST00000410809 99 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TNIP1Q15025 AL356968.1-201ENST00000416622 474 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TNIP1Q15025 GRK5-IT1-201ENST00000421206 400 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
TNIP1Q15025 AC092447.3-201ENST00000426027 686 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TNIP1Q15025 PSMA6P3-201ENST00000428242 164 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TNIP1Q15025 LINC00457-201ENST00000428706 413 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
TNIP1Q15025 AL162725.2-201ENST00000430545 748 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
TNIP1Q15025 OR5H14-201ENST00000437310 1080 ntAPPRIS P1 BASIC3.81□□□□□ -1.8
TNIP1Q15025 MTND1P26-201ENST00000440488 538 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TNIP1Q15025 OXR1-205ENST00000442977 2956 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
TNIP1Q15025 HMGB3P8-201ENST00000449709 577 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TNIP1Q15025 MRPS31P2-201ENST00000451581 518 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TNIP1Q15025 RPL21P134-201ENST00000453468 483 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TNIP1Q15025 snoU13.4-201ENST00000458916 104 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TNIP1Q15025 snoU109.4-201ENST00000458953 143 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TNIP1Q15025 RPL23AP14-201ENST00000468281 468 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TNIP1Q15025 RC3H2-207ENST00000471874 749 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
TNIP1Q15025 LINC02032-201ENST00000490465 391 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
TNIP1Q15025 TMEM251P1-201ENST00000503717 318 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TNIP1Q15025 AC096577.1-203ENST00000506386 541 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
TNIP1Q15025 RNU6-583P-201ENST00000516012 92 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TNIP1Q15025 RNY4P37-201ENST00000516225 96 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TNIP1Q15025 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TNIP1Q15025 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TNIP1Q15025 AP003181.1-201ENST00000528811 445 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
TNIP1Q15025 AP002833.1-201ENST00000530572 566 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
TNIP1Q15025 PLCZ1-203ENST00000534932 525 ntTSL 4 BASIC3.81□□□□□ -1.8
TNIP1Q15025 RASSF8-210ENST00000541490 5505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
TNIP1Q15025 AC009511.1-201ENST00000543527 191 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
TNIP1Q15025 AC117377.1-201ENST00000547633 1038 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
TNIP1Q15025 AL160191.1-202ENST00000554008 576 ntTSL 4 BASIC3.81□□□□□ -1.8
TNIP1Q15025 AL355773.1-201ENST00000554458 459 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
TNIP1Q15025 OR4K7P-201ENST00000580232 945 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TNIP1Q15025 MAGOH2P-202ENST00000584384 429 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TNIP1Q15025 uc_338.25-201ENST00000613756 156 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TNIP1Q15025 TTN-AS1-263ENST00000627527 784 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
TNIP1Q15025 FLG-AS1-207ENST00000628475 497 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
TNIP1Q15025 SNORA50A-202ENST00000629536 136 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TNIP1Q15025 D21S2088E-201ENST00000262354 1725 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
TNIP1Q15025 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
TNIP1Q15025 MKLN1-201ENST00000352689 11156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
TNIP1Q15025 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
TNIP1Q15025 OR10AG1-202ENST00000641071 2807 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TNIP1Q15025 PALMD-205ENST00000615664 1844 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TNIP1Q15025 RNU6-621P-201ENST00000364752 109 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TNIP1Q15025 CRP-202ENST00000368110 667 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TNIP1Q15025 SNORD51-201ENST00000384320 80 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TNIP1Q15025 RNU6-712P-201ENST00000410558 100 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TNIP1Q15025 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TNIP1Q15025 AC127526.1-201ENST00000417526 366 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TNIP1Q15025 AC005005.2-201ENST00000420779 380 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TNIP1Q15025 AL451127.1-201ENST00000422909 624 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TNIP1Q15025 AC010099.3-201ENST00000423896 409 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TNIP1Q15025 ATP5F1P1-201ENST00000433775 569 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TNIP1Q15025 AC004485.1-201ENST00000439839 527 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TNIP1Q15025 LRRC70-203ENST00000491184 703 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TNIP1Q15025 AC024022.1-202ENST00000508911 394 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TNIP1Q15025 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TNIP1Q15025 RNU1-61P-201ENST00000516107 151 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TNIP1Q15025 MRPS36P3-201ENST00000519284 130 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TNIP1Q15025 IGHV3-76-201ENST00000522465 295 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TNIP1Q15025 AP002768.1-201ENST00000526741 320 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TNIP1Q15025 AC023538.1-201ENST00000534576 736 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TNIP1Q15025 RAP1B-224ENST00000541216 701 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
TNIP1Q15025 AL160237.1-201ENST00000554526 572 ntTSL 4 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TNIP1Q15025 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TNIP1Q15025 PSMA4-206ENST00000558341 719 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TNIP1Q15025 MTND3P12-201ENST00000559068 328 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TNIP1Q15025 AL157394.1-201ENST00000562983 1224 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TNIP1Q15025 AC022166.2-201ENST00000566030 536 ntTSL 4 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.4 ms