Protein–RNA interactions for Protein: Q14517

FAT1, Protocadherin Fat 1, humanhuman

Predictions only

Length 4,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAT1Q14517 Y_RNA.30-201ENST00000362572 97 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
FAT1Q14517 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
FAT1Q14517 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
FAT1Q14517 AC069257.1-202ENST00000425275 422 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
FAT1Q14517 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
FAT1Q14517 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
FAT1Q14517 MTND4LP16-201ENST00000440828 295 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
FAT1Q14517 DENND6A-AS1-201ENST00000470427 364 ntTSL 2 BASIC1.01□□□□□ -2.25
FAT1Q14517 AC092989.1-201ENST00000481235 277 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
FAT1Q14517 DIAPH2-AS1-203ENST00000542084 450 ntTSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
FAT1Q14517 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
FAT1Q14517 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
FAT1Q14517 AL589740.1-205ENST00000635561 565 ntTSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
FAT1Q14517 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC1.01□□□□□ -2.25
FAT1Q14517 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.01□□□□□ -2.25
FAT1Q14517 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.01□□□□□ -2.25
FAT1Q14517 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC1.01□□□□□ -2.25
FAT1Q14517 SNORA31-201ENST00000362607 130 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
FAT1Q14517 SAR1A-201ENST00000373236 437 ntTSL 1 (best) BASIC1.01□□□□□ -2.25
FAT1Q14517 LINC02546-202ENST00000528119 801 ntTSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
FAT1Q14517 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
FAT1Q14517 AC241377.1-201ENST00000619797 406 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
FAT1Q14517 AC008568.2-201ENST00000623862 2313 ntBASIC1□□□□□ -2.25
FAT1Q14517 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1□□□□□ -2.25
FAT1Q14517 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC1□□□□□ -2.25
FAT1Q14517 BNIP3P2-201ENST00000441221 577 ntBASIC1□□□□□ -2.25
FAT1Q14517 AC096992.1-201ENST00000459808 709 ntBASIC1□□□□□ -2.25
FAT1Q14517 PARPBP-212ENST00000543784 992 ntTSL 2 BASIC1□□□□□ -2.25
FAT1Q14517 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC1□□□□□ -2.25
FAT1Q14517 AC012150.2-201ENST00000621300 544 ntBASIC1□□□□□ -2.25
FAT1Q14517 CFL2-202ENST00000341223 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
FAT1Q14517 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC1□□□□□ -2.25
FAT1Q14517 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC1□□□□□ -2.25
FAT1Q14517 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC1□□□□□ -2.25
FAT1Q14517 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC1□□□□□ -2.25
FAT1Q14517 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
FAT1Q14517 AC022790.1-201ENST00000522872 204 ntBASIC1□□□□□ -2.25
FAT1Q14517 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC1□□□□□ -2.25
FAT1Q14517 C11orf65-206ENST00000529391 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1□□□□□ -2.25
FAT1Q14517 AC007513.1-201ENST00000548740 379 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
FAT1Q14517 MUCL1-205ENST00000619042 243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
FAT1Q14517 AP003499.2-201ENST00000624100 483 ntBASIC1□□□□□ -2.25
FAT1Q14517 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
FAT1Q14517 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
FAT1Q14517 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC1□□□□□ -2.25
FAT1Q14517 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC1□□□□□ -2.25
FAT1Q14517 HMGB1P26-201ENST00000452520 628 ntBASIC1□□□□□ -2.25
FAT1Q14517 AC109486.1-201ENST00000486833 374 ntBASIC1□□□□□ -2.25
FAT1Q14517 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC1□□□□□ -2.25
FAT1Q14517 LINC02378-201ENST00000540399 1003 ntTSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
FAT1Q14517 AC103987.3-201ENST00000582071 292 ntBASIC1□□□□□ -2.25
FAT1Q14517 AP005137.2-201ENST00000609238 400 ntBASIC1□□□□□ -2.25
FAT1Q14517 AC243773.3-201ENST00000613270 256 ntBASIC1□□□□□ -2.25
FAT1Q14517 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC1□□□□□ -2.25
FAT1Q14517 MTCO3P30-201ENST00000426425 670 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
FAT1Q14517 HMGB1P12-201ENST00000438594 598 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
FAT1Q14517 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
FAT1Q14517 AC006026.1-201ENST00000444025 1803 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
FAT1Q14517 RPS27P5-201ENST00000444247 244 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
FAT1Q14517 AL023584.2-201ENST00000454411 444 ntTSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
FAT1Q14517 TIPARP-AS1-202ENST00000478005 554 ntTSL 4 BASIC0.99□□□□□ -2.25
FAT1Q14517 TRAPPC13-208ENST00000505553 1410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC0.99□□□□□ -2.25
FAT1Q14517 AC109464.2-201ENST00000510242 943 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
FAT1Q14517 GYPA-208ENST00000512064 441 ntTSL 1 (best) BASIC0.99□□□□□ -2.25
FAT1Q14517 SDHAF2-205ENST00000537782 559 ntTSL 4 BASIC0.99□□□□□ -2.25
FAT1Q14517 AC079362.1-201ENST00000546865 525 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
FAT1Q14517 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
FAT1Q14517 AC023813.2-201ENST00000564321 469 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
FAT1Q14517 AC015908.2-202ENST00000585243 756 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
FAT1Q14517 AL359094.1-202ENST00000629917 1113 ntTSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
FAT1Q14517 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC0.99□□□□□ -2.25
FAT1Q14517 FER-201ENST00000281092 12119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.99□□□□□ -2.25
FAT1Q14517 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC0.99□□□□□ -2.25
FAT1Q14517 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
FAT1Q14517 RPL23AP39-201ENST00000415533 405 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
FAT1Q14517 AC025043.1-201ENST00000558047 625 ntTSL 2 BASIC0.99□□□□□ -2.25
FAT1Q14517 AC012531.5-201ENST00000611375 151 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
FAT1Q14517 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
FAT1Q14517 MEIG1-202ENST00000407572 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.99□□□□□ -2.25
FAT1Q14517 AL138787.2-202ENST00000479395 385 ntTSL 2 BASIC0.99□□□□□ -2.25
FAT1Q14517 RPL23AP55-201ENST00000498163 452 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
FAT1Q14517 FABP5P6-201ENST00000510588 409 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
FAT1Q14517 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
FAT1Q14517 GLYCAM1-201ENST00000546596 285 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
FAT1Q14517 AL049838.1-201ENST00000563647 981 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
FAT1Q14517 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
FAT1Q14517 AC012321.1-201ENST00000561622 1588 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
FAT1Q14517 SEPT7P7-201ENST00000420492 1301 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
FAT1Q14517 AL162414.1-201ENST00000426204 744 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
FAT1Q14517 CD69-203ENST00000536709 1020 ntTSL 2 BASIC0.99□□□□□ -2.25
FAT1Q14517 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC0.99□□□□□ -2.25
FAT1Q14517 AC010678.1-201ENST00000614118 713 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
FAT1Q14517 MIR7973-1-201ENST00000614683 76 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
FAT1Q14517 SCEL-205ENST00000535157 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.99□□□□□ -2.25
FAT1Q14517 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.98□□□□□ -2.25
FAT1Q14517 CKAP2P1-201ENST00000555477 2049 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
FAT1Q14517 BTBD10P2-201ENST00000404779 676 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
FAT1Q14517 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC0.98□□□□□ -2.25
FAT1Q14517 LINC01040-201ENST00000425048 666 ntTSL 2 BASIC0.98□□□□□ -2.25
FAT1Q14517 GNGT1-202ENST00000428834 731 ntTSL 3 BASIC0.98□□□□□ -2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.7 ms