Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 AC005208.1-201ENST00000435112 599 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 AC079776.3-201ENST00000450665 370 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 HSPE1P6-201ENST00000479457 291 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 RPS3AP43-201ENST00000479743 781 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 LINC01997-201ENST00000494900 429 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 AC093523.1-201ENST00000503268 499 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 LINC02198-201ENST00000504280 810 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 ZCCHC10-207ENST00000509437 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 AC008885.1-201ENST00000514930 301 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 ATF7IP2-206ENST00000543967 998 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 AC128657.1-201ENST00000549459 145 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 MIR5004-201ENST00000579078 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 AL022067.1-201ENST00000602426 454 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 AC007563.2-202ENST00000607591 394 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 AC084824.5-201ENST00000612009 413 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 AL392048.1-201ENST00000613946 534 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 AC004696.1-201ENST00000614345 607 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 AC107308.1-201ENST00000615897 301 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 AC006213.4-201ENST00000616184 634 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 AC079597.1-201ENST00000624306 508 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 AC120349.2-201ENST00000625002 298 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 PROX1-AS1-244ENST00000630355 599 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 AL445259.1-201ENST00000587106 2984 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 SYCP2-201ENST00000357552 5567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 AL450338.1-201ENST00000407987 512 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
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DDX39BQ13838 RAP1BP1-201ENST00000412709 553 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 AC007161.1-201ENST00000418534 1061 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 NDUFB4P7-201ENST00000423198 363 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 ZNF736P7Y-201ENST00000425158 820 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 RNF2P1-201ENST00000442955 1010 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
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DDX39BQ13838 MTCYBP42-201ENST00000444653 1130 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 SPANXN4-202ENST00000446864 431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 GAPDHP27-201ENST00000447427 1020 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 AL078587.1-201ENST00000448580 542 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 GRM7-AS3-209ENST00000458713 454 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 MTND4LP3-201ENST00000468320 276 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 CNOT10-AS1-201ENST00000475395 466 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
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DDX39BQ13838 TMEM251P1-201ENST00000503717 318 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
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DDX39BQ13838 OR5M10-201ENST00000526812 1052 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 AC087897.1-201ENST00000550134 156 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
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DDX39BQ13838 AC253576.2-201ENST00000618815 580 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 AL596245.1-201ENST00000618994 362 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 THOC1-220ENST00000621904 1083 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 C8orf89-203ENST00000625134 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 LRRC77P-213ENST00000637727 880 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 ANKRD26P2-201ENST00000445530 1710 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 MTND5P19-201ENST00000424872 1794 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
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DDX39BQ13838 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 AL356473.1-201ENST00000406203 1408 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 AL353743.1-202ENST00000431724 1695 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 AC005539.1-201ENST00000443768 1479 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 CDR1-202ENST00000625883 1485 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 SNORA63.3-201ENST00000362682 132 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 TXNDC8-202ENST00000374510 455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 RN7SKP58-201ENST00000411010 305 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 UBE2Q2P5Y-201ENST00000413867 207 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 AL592310.1-201ENST00000414330 671 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
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