Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 MIR5697-201ENST00000578045 78 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 AL390208.1-201ENST00000605885 644 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 AC006566.1-201ENST00000608943 513 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 AL589743.7-201ENST00000612637 233 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 AC073968.1-201ENST00000618594 637 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 OR5T1-201ENST00000641368 1118 ntAPPRIS P1 BASIC3.93□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 POSTN-209ENST00000541179 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 NUFIP2-201ENST00000225388 10850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 PTPN12-206ENST00000435495 2526 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 CNOT6L-201ENST00000504123 8843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 AL592437.2-201ENST00000421655 2434 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 C6orf10-205ENST00000527965 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 TFEC-203ENST00000393485 2704 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 PPIG-207ENST00000448752 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 UBA5-201ENST00000264991 2850 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 MFSD8-233ENST00000641482 4860 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 THEMIS-201ENST00000368248 3866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 DTHD1-202ENST00000456874 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 AC092447.10-201ENST00000620607 1652 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 MT-TC-201ENST00000387405 66 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 AL022329.2-201ENST00000413494 660 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 ELOCP17-201ENST00000414751 326 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 AL078581.1-201ENST00000419134 340 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 BBS9-205ENST00000425508 1252 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 RWDD4P2-201ENST00000426392 563 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 AC004975.1-201ENST00000428733 208 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 C21orf91-OT1-202ENST00000430815 717 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 OR2B8P-201ENST00000432841 938 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 TRAPPC2P9-201ENST00000434556 343 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 ZNF385D-AS2-201ENST00000436306 424 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 RSU1P2-202ENST00000437884 485 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 AC091862.1-201ENST00000438016 1100 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 AC127537.2-201ENST00000439258 465 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 GDI2P2-201ENST00000445131 608 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 AP000542.1-201ENST00000448473 371 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 LINC01206-205ENST00000490001 949 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 MFAP3L-206ENST00000506110 548 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 AC109454.3-201ENST00000512748 669 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 NPM1P41-201ENST00000512920 831 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 RN7SKP13-201ENST00000515933 244 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 RN7SKP289-201ENST00000517244 295 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 FBXO3-AS1-202ENST00000533046 386 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 AC024224.1-201ENST00000538284 609 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 GLYCAM1-202ENST00000546607 553 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 AL352984.1-201ENST00000556949 276 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 AC007224.1-201ENST00000564410 144 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 AC037471.2-201ENST00000564941 598 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 AC010546.1-201ENST00000569391 485 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 AC137800.2-201ENST00000574375 120 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 AC003687.1-201ENST00000578040 427 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 MTND1P15-201ENST00000579262 949 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 MIR3682-201ENST00000581338 84 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 MIR7515HG-213ENST00000585872 758 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 FBXW7-AS1-201ENST00000605147 372 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 AC091965.4-201ENST00000607691 587 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 AC103710.1-201ENST00000610003 901 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 AC131902.3-201ENST00000611767 581 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 AC008250.2-201ENST00000615261 205 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 AP001506.1-201ENST00000615444 211 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 AC099669.2-201ENST00000616549 437 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 AL603839.4-201ENST00000624658 1005 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 KIF15-203ENST00000425755 3460 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 UBE2D3-233ENST00000618836 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 AL049780.3-201ENST00000624612 1583 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 AL049555.1-201ENST00000562834 1933 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 ZBTB37-201ENST00000367701 19128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 PABPC1P7-201ENST00000413177 1513 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 TNFAIP8-203ENST00000415806 1990 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 PCDH15-218ENST00000437009 6804 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 MME-211ENST00000492661 2854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 CKAP5-201ENST00000312055 6532 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 NFIB-202ENST00000380924 840 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 RNU6-730P-201ENST00000383954 104 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 RNU5A-6P-201ENST00000384136 116 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 AL356421.1-201ENST00000403255 413 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 RNU2-15P-201ENST00000410692 191 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 AC125238.1-201ENST00000448842 249 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 RPL7P52-201ENST00000449200 742 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 Z82190.1-201ENST00000454534 490 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 AC096666.1-201ENST00000454965 348 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 MTCO1P42-201ENST00000457379 726 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 RPS20P24-201ENST00000457473 361 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 SRRM1P2-201ENST00000464531 1192 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 AC103987.1-201ENST00000473394 348 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 AC025518.1-201ENST00000479856 347 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 SAR1B-204ENST00000502539 708 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 AC114967.1-201ENST00000504890 259 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 TRAPPC13-208ENST00000505553 1410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 AL136537.1-201ENST00000508199 538 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 AC092542.1-201ENST00000513155 355 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 AC093677.1-201ENST00000514414 678 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 RN7SKP234-201ENST00000517173 224 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 RRAS2-210ENST00000534746 993 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 AL355922.1-201ENST00000555624 337 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 AC092120.1-201ENST00000562211 420 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 HNRNPCP4-201ENST00000571636 900 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 MIR4528-201ENST00000577763 90 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PKP1Q13835 ZNF573-209ENST00000585724 453 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
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