Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 TIMM9-209ENST00000556367 572 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 FRG2DP-202ENST00000566967 323 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 AL139395.1-201ENST00000603662 160 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 AC010591.1-201ENST00000603941 649 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 ACTR3BP1-201ENST00000605584 1247 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 SOX2-OT-255ENST00000630150 649 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 CASC19-284ENST00000642142 1868 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 MS4A1-201ENST00000345732 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 USP26-201ENST00000370832 3642 ntAPPRIS P1 BASIC4.38□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 IQCB2P-201ENST00000401788 1633 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 PRKAA2-202ENST00000610361 9280 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 TRDN-206ENST00000628709 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 ITCH-207ENST00000535650 2940 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 C9orf153-204ENST00000613665 1738 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 FAM169A-203ENST00000510496 5810 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 DHX40P1-201ENST00000588725 1412 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 ZNF568-216ENST00000619231 3797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 LINC02471-203ENST00000641941 4752 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 CNTN5-209ENST00000528682 3800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 C9orf72-203ENST00000380003 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 AL591441.1-201ENST00000618108 2247 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 AC009313.2-201ENST00000417893 1941 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 AP001486.2-201ENST00000561652 5113 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 EMSY-207ENST00000525919 4074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 MGA-207ENST00000566586 14439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 CFHR3-205ENST00000471440 1965 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 CYP3A7-CYP3A51P-201ENST00000611620 1608 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 OR5P1P-201ENST00000299512 925 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 RNA5-8SP7-201ENST00000363443 155 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 Y_RNA.255-201ENST00000364581 97 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 LINC00587-201ENST00000374801 590 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 SNORA70F-201ENST00000384142 135 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 MT-TR-201ENST00000387439 65 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 RNU1-82P-201ENST00000390851 165 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 AL138785.1-201ENST00000425821 331 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 GPR143P-201ENST00000434155 205 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 RPS26P40-201ENST00000435209 294 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 LINC01729-201ENST00000450640 358 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 AL031668.1-201ENST00000451556 603 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 SNRPGP5-201ENST00000456003 220 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 RPL37P3-201ENST00000456825 293 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
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TUBA3CQ13748 snoU13.1-201ENST00000459157 104 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 RPL7P22-201ENST00000466005 733 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 AK3P4-201ENST00000504283 583 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 MFAP3L-206ENST00000506110 548 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 TTC39CP1-201ENST00000512513 755 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 AC108043.1-201ENST00000512696 574 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 PCAT4-202ENST00000514836 373 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 AL160262.1-201ENST00000522264 254 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 AC136424.2-201ENST00000522582 563 ntTSL 4 BASIC4.37□□□□□ -1.71
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TUBA3CQ13748 AL132780.1-201ENST00000548819 556 ntTSL 4 BASIC4.37□□□□□ -1.71
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TUBA3CQ13748 MIR5096-201ENST00000583713 70 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 AC017100.2-201ENST00000584628 355 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 AC016866.2-201ENST00000585251 502 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 BBIP1P1-201ENST00000602999 279 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
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TUBA3CQ13748 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
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TUBA3CQ13748 LINC01197-202ENST00000555332 3568 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 RMST-202ENST00000541282 2099 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
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TUBA3CQ13748 ZC3H7A-202ENST00000396516 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 OR4S2-202ENST00000641692 2211 ntAPPRIS P1 BASIC4.37□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 ADGRL2-201ENST00000319517 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 ABCC9-201ENST00000261200 8293 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 N4BP2L2-201ENST00000267068 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 AC092125.1-201ENST00000562568 1995 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 TARID-205ENST00000607033 2960 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 SNCA-213ENST00000618500 3022 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 RNU6-853P-201ENST00000364306 107 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 AL356057.3-201ENST00000402607 340 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 AC003092.1-201ENST00000415536 639 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 AL031663.1-201ENST00000437445 219 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 FO393401.1-201ENST00000453914 600 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 AL445524.1-204ENST00000454631 458 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 RPS20P32-201ENST00000456044 356 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 ST13P14-201ENST00000474095 734 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 AC078785.3-201ENST00000476607 425 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 AL136537.1-202ENST00000501725 430 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 BACH1-IT1-201ENST00000504298 821 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 AC008243.1-202ENST00000506527 481 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 AL033397.2-201ENST00000508884 547 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
TUBA3CQ13748 AC109454.3-201ENST00000512748 669 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
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