Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 AC021736.1-201ENST00000521143 563 ntTSL 4 BASIC4.45□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 HMGN1P28-201ENST00000521340 364 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 MTND4LP18-201ENST00000526864 291 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 MAL2-203ENST00000534619 578 ntTSL 4 BASIC4.45□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 SOX5-AS1-201ENST00000539583 573 ntTSL 4 BASIC4.45□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 AC135279.1-201ENST00000543493 504 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 AC010183.2-202ENST00000546791 382 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 AL391156.1-201ENST00000554965 554 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 ROCK1P1-201ENST00000573767 549 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 MIR4425-201ENST00000580572 84 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 AC092653.1-201ENST00000608509 531 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 AP002826.1-201ENST00000608835 315 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 AC068831.8-201ENST00000620171 435 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 AC068724.3-201ENST00000625906 87 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 AC068137.4-201ENST00000638485 296 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 AC119674.1-207ENST00000641355 633 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 SPAG17-201ENST00000336338 6924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 GABRG2-222ENST00000639975 3662 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 C6orf10-203ENST00000442822 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 STXBP4-201ENST00000376352 15590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 ELAVL2-204ENST00000397312 3805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 AC007256.1-201ENST00000392253 2765 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 HDX-202ENST00000373177 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 CRB1-201ENST00000367397 9023 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 ZNF117-203ENST00000610793 1374 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 RGPD4-201ENST00000408999 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 RNU5F-6P-201ENST00000362979 116 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 SPRR2D-203ENST00000368757 800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 CGA-201ENST00000369582 729 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 CCNG1P1-201ENST00000406783 885 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 Z93403.1-201ENST00000411879 895 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 RPL7P8-201ENST00000411964 730 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 ATP5A1P2-201ENST00000412323 255 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 AC106873.1-201ENST00000420664 459 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 AL033504.1-201ENST00000427015 773 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 AL157359.2-201ENST00000440372 784 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 UBE2D3P4-201ENST00000441973 436 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 TPT1P14-201ENST00000448018 505 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 AC097262.1-201ENST00000452559 548 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 RPS4XP2-201ENST00000458402 793 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 RN7SL132P-201ENST00000478131 296 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 AC006499.5-201ENST00000505037 514 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 AC118465.1-201ENST00000513820 1271 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 RNU1-61P-201ENST00000516107 151 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 AC087373.1-201ENST00000524920 491 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 AP001804.3-201ENST00000525146 880 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 AC006518.2-202ENST00000544947 297 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 LINC01405-202ENST00000547607 674 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 CERS3-AS1-202ENST00000560718 432 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 AL035425.2-201ENST00000563887 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.44□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 AC091489.2-201ENST00000566263 604 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 AL157938.2-203ENST00000589540 931 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 AP001972.3-202ENST00000603012 375 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 AC080013.6-201ENST00000606185 215 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 AC093591.3-201ENST00000634516 308 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 SPTY2D1-AS1-205ENST00000635674 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 MFSD8-236ENST00000641509 4050 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 KNTC1-204ENST00000436959 2412 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 AF117829.1-206ENST00000621883 3802 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 AC007823.1-201ENST00000569932 1566 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 POLK-204ENST00000504026 1484 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 LTN1-207ENST00000614971 7756 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 SERPINI2-201ENST00000264677 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 CFHR4-201ENST00000251424 1292 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 SNORD9-201ENST00000362566 104 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 RNU6-432P-201ENST00000384196 109 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 MIR591-201ENST00000385290 95 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 MTND1P21-201ENST00000412991 285 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 Z99497.1-201ENST00000421282 135 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 AC233728.2-201ENST00000425348 757 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 LINC00392-201ENST00000430033 557 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 AL158071.1-201ENST00000430315 461 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 AC109583.1-201ENST00000432156 268 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 GACAT1-202ENST00000441383 540 ntTSL 4 BASIC4.43□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 CLEC4E-202ENST00000446457 701 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 EPS15P1-201ENST00000448836 336 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 LINC00374-201ENST00000454780 800 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 AC026355.2-201ENST00000456755 723 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 SETP11-201ENST00000473027 690 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 MTND3P7-201ENST00000474435 343 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 AC021205.2-201ENST00000480069 347 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 AC109464.2-201ENST00000510242 943 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 MTCO1P49-201ENST00000523429 802 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 AC026894.1-202ENST00000533843 477 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 AC092747.1-201ENST00000538920 351 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 AC018410.2-201ENST00000540410 610 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 AC069228.1-202ENST00000550272 737 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 OR4T1P-201ENST00000554933 911 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 AC055876.1-202ENST00000567053 138 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 COX6CP3-201ENST00000580869 223 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 AL110115.1-201ENST00000614396 364 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 YWHAEP7-201ENST00000617508 639 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 PLCE1P1-201ENST00000622094 305 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 AP003355.3-201ENST00000623465 114 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 AL159972.1-201ENST00000625150 448 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 AC019226.1-201ENST00000625666 515 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 184.7 ms