Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 CAPN6-201ENST00000324068 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 EYA4-211ENST00000525849 3456 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 ADAM7-202ENST00000380789 3358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 LINC01963-201ENST00000562038 3148 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 OR2A7-202ENST00000641841 2062 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 CEP162-207ENST00000617909 5095 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 PTPRD-205ENST00000397611 8242 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 OR1E2-201ENST00000248384 972 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 RNU1-19P-201ENST00000363306 165 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 SNORA74A-201ENST00000364089 198 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 AL138885.1-201ENST00000405921 675 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 SPATA13-AS1-201ENST00000430733 433 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 LINC02210-201ENST00000444561 288 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 CASP1-203ENST00000446369 948 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 AC083899.1-201ENST00000454465 3819 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 AC105384.2-201ENST00000508433 640 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 RN7SKP234-201ENST00000517173 224 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 AC012339.2-201ENST00000523996 453 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 SOX5-AS1-201ENST00000539583 573 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 DIAPH2-AS1-203ENST00000542084 450 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 LINC01619-209ENST00000552277 571 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 AC091544.7-201ENST00000554000 240 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 RPL23AP87-202ENST00000573039 466 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 FKBP1AP1-201ENST00000594588 318 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 CDC42EP3P1-201ENST00000601004 764 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 HMGB1P50-201ENST00000605814 607 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 AL591516.1-201ENST00000611326 274 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 AC005344.1-201ENST00000613391 459 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 AC083843.2-201ENST00000568248 6253 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 NCOA1-206ENST00000407230 4745 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 TRAPPC13-201ENST00000231526 2715 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 DTNA-229ENST00000598142 2509 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 CAV1-205ENST00000405348 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 CCDC121-201ENST00000324364 2342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 GVINP1-202ENST00000531871 7271 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 CENPI-202ENST00000372927 3262 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 AL672167.1-205ENST00000641112 3080 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 PCDH15-215ENST00000409834 5401 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 SLC26A7-208ENST00000523719 2902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 CSMD3-204ENST00000455883 12485 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 C3orf67-209ENST00000482387 2617 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 TRIQK-206ENST00000518748 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 THAP12P5-201ENST00000405864 2275 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 VPS13C-204ENST00000395898 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 RNU6-178P-201ENST00000384631 104 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 AL021153.1-201ENST00000427360 308 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 PRDX3P3-201ENST00000447765 522 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 MRPS33P2-201ENST00000507850 322 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 LINC02223-202ENST00000511596 578 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 AC097467.3-212ENST00000512269 568 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 OR56A5-202ENST00000532411 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 AC046130.2-201ENST00000537655 794 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 AC092138.1-201ENST00000568659 472 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 AC010761.5-201ENST00000579468 287 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 LINC01835-202ENST00000589345 450 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 IMMP1LP3-201ENST00000604197 224 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 U73479.1-201ENST00000618062 168 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 AC132068.1-201ENST00000623805 459 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 OR56A4-202ENST00000641156 3768 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 AL451142.2-201ENST00000429076 2090 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 ARPP19-208ENST00000566423 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 ADAMDEC1-204ENST00000522298 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 EIF3M-208ENST00000531120 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 GART-205ENST00000381839 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 AC139769.1-204ENST00000472297 1931 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 EOGT-210ENST00000615922 1931 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 TNFSF4-202ENST00000367718 3429 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 RGS21-201ENST00000417209 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 ZNF518B-201ENST00000326756 6894 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 IRF5P1-201ENST00000504852 2164 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 CSDE1-202ENST00000339438 4006 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 RAPGEF4-213ENST00000535187 3707 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 SDR42E1-201ENST00000328945 11566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 TMEM68-218ENST00000617782 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 CCDC62-205ENST00000537566 3537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 DTNA-231ENST00000598774 2418 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 ARHGEF3-203ENST00000413728 3992 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 RN7SKP115-201ENST00000363177 317 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 RNU6-1249P-201ENST00000363237 111 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
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