Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 AC233702.9-201ENST00000581528 203 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 AL596245.1-201ENST00000618994 362 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 AC007546.1-201ENST00000619452 559 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 AC244100.1-202ENST00000621554 382 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 CDK1-201ENST00000316629 1733 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 DCX-202ENST00000358070 9405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 SCRG1-201ENST00000296506 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 OBSCN-205ENST00000422127 24060 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 SYT14-206ENST00000537238 5208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 RLIM-201ENST00000332687 8317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 TRAPPC13-208ENST00000505553 1410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 LCA5L-218ENST00000485895 2551 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 NECAB1-202ENST00000521366 2908 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 SDC2-204ENST00000519914 1318 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 CXCL9-201ENST00000264888 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 CDH17-201ENST00000027335 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 LTA4H-202ENST00000413268 1908 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 AL592148.3-201ENST00000608771 2646 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 KIAA1456-203ENST00000524591 9587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 AC008079.2-201ENST00000623543 20396 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 INTU-201ENST00000335251 13233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 ZNF33A-201ENST00000307441 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 OR8H2-203ENST00000641311 3092 ntAPPRIS P2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 AL162394.1-201ENST00000413271 419 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 AL158839.1-201ENST00000413943 575 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 OR6C66P-201ENST00000414917 930 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 DPYD-AS1-201ENST00000422980 533 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 AL122034.1-201ENST00000427609 497 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 SNRPEP4-201ENST00000435815 279 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 UBE2V1P13-201ENST00000436983 439 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 AL033380.1-201ENST00000442781 421 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 AC095032.1-201ENST00000444810 527 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 GEMIN8P3-201ENST00000445417 720 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 TMEM212-AS1-201ENST00000449106 427 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 AL391427.1-201ENST00000451575 425 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 APOA2-207ENST00000470459 416 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 RPL23AP11-201ENST00000475260 469 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 RPL7P43-201ENST00000478876 753 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 AC017037.1-201ENST00000508460 471 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 AC024587.2-201ENST00000509458 805 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 RNU6-566P-201ENST00000516790 107 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 AP001781.1-201ENST00000530977 207 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 SAMD15-202ENST00000533095 412 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 AL445074.1-201ENST00000555362 318 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 AC134312.3-201ENST00000566155 213 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 MIR4277-201ENST00000578298 84 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 MIR4716-201ENST00000579628 84 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 AC069061.3-201ENST00000582254 823 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 MIR4697-201ENST00000582977 78 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 AC005357.2-201ENST00000586473 583 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 AC011477.5-201ENST00000586571 259 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 LINC00904-201ENST00000604453 471 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 AL592436.1-201ENST00000605135 558 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 AC083809.1-201ENST00000615051 472 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 OBSCN-210ENST00000570156 26925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 CNTN5-207ENST00000527185 4303 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 SLC4A10-203ENST00000415876 5578 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 ERC2-201ENST00000288221 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 ATP13A4-203ENST00000392443 4016 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 AC104623.2-202ENST00000623477 4002 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 TRIM69-201ENST00000329464 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 ZNF137P-201ENST00000456718 1920 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 AL122126.1-201ENST00000546905 1318 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 SSR1-202ENST00000397511 3248 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 BBX-206ENST00000415149 8930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 TMEM154-201ENST00000304385 10698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 DTNA-229ENST00000598142 2509 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 ZFPM2-203ENST00000517361 3300 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 ASAH2-204ENST00000447815 2311 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 PARD3-204ENST00000374768 799 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 RNU2-29P-201ENST00000410423 189 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 RN7SKP58-201ENST00000411010 305 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 AC007738.1-201ENST00000413892 348 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 AC092811.1-201ENST00000428642 397 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 RPL12P46-201ENST00000436610 195 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 TPT1P12-201ENST00000448968 492 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 AL162591.2-201ENST00000449634 317 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 RPL36AP41-201ENST00000493820 306 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 HMGB1P21-201ENST00000502313 581 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 MTCYBP40-201ENST00000509390 1135 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 RNU6-1213P-201ENST00000517075 94 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 RANP9-201ENST00000519957 271 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 AC079098.1-202ENST00000523150 573 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 AC011979.2-201ENST00000527568 352 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 AC079598.1-201ENST00000548691 554 ntTSL 4 BASIC4.94□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 SETP2-201ENST00000553886 926 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 MIR4680-201ENST00000580906 66 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
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