Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Length 568 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 SDCBPP1-201ENST00000440192 890 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
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TRAF3Q13114 AL358075.2-201ENST00000452785 339 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
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TRAF3Q13114 AL136097.2-201ENST00000457003 333 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 RPL37P6-202ENST00000464216 403 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 HMGB1P29-201ENST00000505659 499 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 AC006390.1-201ENST00000508068 283 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
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TRAF3Q13114 AC097460.1-201ENST00000514624 590 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 LINC02364-201ENST00000514802 687 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
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TRAF3Q13114 RNU2-46P-201ENST00000517038 113 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 AC099554.1-201ENST00000520032 572 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 AC008489.1-201ENST00000524271 483 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 AC103796.1-201ENST00000530663 358 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 AP003122.4-201ENST00000530980 758 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 CACNA1C-IT2-201ENST00000541871 589 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 LINC02277-201ENST00000553386 453 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 AC023034.1-202ENST00000558153 684 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
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TRAF3Q13114 AC034268.2-201ENST00000571784 482 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 AC015908.2-202ENST00000585243 756 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
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TRAF3Q13114 AC007566.2-201ENST00000603642 413 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 AL360267.1-201ENST00000607309 666 ntTSL 4 BASIC3.64□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 AL355073.2-201ENST00000612106 557 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 MALAT1-206ENST00000612781 234 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 TMEM212-205ENST00000619900 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 AL356321.1-201ENST00000621360 228 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
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TRAF3Q13114 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 USP9Y-201ENST00000338981 10036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 XKR3-201ENST00000331428 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 C2orf78-201ENST00000409561 3045 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 LBR-202ENST00000338179 3812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 MS4A1-212ENST00000534668 3475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 ORC3-201ENST00000257789 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
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TRAF3Q13114 SCEL-202ENST00000377246 3081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
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TRAF3Q13114 CEP170P1-201ENST00000502249 4587 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
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TRAF3Q13114 SCFD1-207ENST00000544052 2058 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 OR6C2-203ENST00000641516 1682 ntAPPRIS P1 BASIC3.62□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 CNGB3-201ENST00000320005 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 SLC16A7-201ENST00000261187 11777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 AC087521.2-201ENST00000499066 2190 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 MACF1-201ENST00000289893 19141 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 TFPI-201ENST00000233156 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 ZNF33CP-201ENST00000432492 2030 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 RGS21-201ENST00000417209 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
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