Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 RPL30P2-201ENST00000414021 291 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 AC004160.1-205ENST00000428967 577 ntTSL 4 BASIC3.69□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 FTH1P6-201ENST00000430768 320 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 AL359081.1-201ENST00000432083 615 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 AL590999.1-206ENST00000437947 436 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 AC091862.1-201ENST00000438016 1100 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 AC092641.1-201ENST00000440229 772 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 RPL7P36-201ENST00000444633 681 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 COX6CP2-201ENST00000444980 225 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 GDI2P2-201ENST00000445131 608 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 MTND1P29-201ENST00000448112 647 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 AC006480.1-201ENST00000449887 378 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 SNRPGP9-201ENST00000456025 225 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 snoU13.8-201ENST00000458890 104 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 snoU109.4-201ENST00000458953 143 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 AC034234.1-202ENST00000508696 339 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 TXNP6-201ENST00000510190 310 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 AC109454.3-201ENST00000512748 669 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 RNU6-714P-201ENST00000516963 103 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 AC009623.2-201ENST00000522524 465 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 AC007458.1-201ENST00000542812 373 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 AL121576.1-201ENST00000556055 276 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 AC069029.1-201ENST00000558736 263 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 MIR548AB-201ENST00000584917 84 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 AC012065.4-201ENST00000602445 679 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 AC010591.1-201ENST00000603941 649 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 AC068276.1-201ENST00000605793 379 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 AC025048.6-202ENST00000627667 438 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 PCBP1-AS1-348ENST00000629506 667 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 LINC01002-206ENST00000631772 539 ntTSL 4 BASIC3.69□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 MGAT4C-202ENST00000548651 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 SEMA3D-201ENST00000284136 6265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 ARHGAP28-202ENST00000314319 5415 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 AC011124.1-201ENST00000521221 1762 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 SYT14-208ENST00000637265 13567 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 CEP170-202ENST00000366542 6828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 CCDC178-205ENST00000406524 3039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 RNF111-206ENST00000559209 5278 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 AC006378.2-201ENST00000623178 2476 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 RAD21-210ENST00000523986 2506 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 AL049781.1-201ENST00000623195 3585 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 AKAP14-201ENST00000334356 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 RNA5SP50-201ENST00000363731 107 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 AL137856.1-202ENST00000418238 422 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 AC244098.2-201ENST00000422068 99 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 AL391336.1-201ENST00000424678 484 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 AC017083.1-201ENST00000428093 483 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 AC097713.2-201ENST00000430199 356 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 AL355340.1-201ENST00000433085 344 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 RSU1P2-202ENST00000437884 485 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 AP002512.3-201ENST00000440231 985 ntAPPRIS P1 BASIC3.68□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 FAM103A2P-201ENST00000444122 354 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 MTCO1P42-201ENST00000457379 726 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 AC096554.1-201ENST00000458182 529 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 RN7SL601P-201ENST00000471221 293 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 ST13P14-201ENST00000474095 734 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 RAP1BP2-201ENST00000478270 544 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 RPL32P34-201ENST00000486380 400 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 LINC02469-201ENST00000506460 741 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 GMPSP1-201ENST00000514075 579 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 AC104233.2-201ENST00000518922 414 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 AC009597.1-201ENST00000521215 584 ntTSL 4 BASIC3.68□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 AC069120.1-201ENST00000521623 379 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 AC008489.1-201ENST00000524271 483 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 AC239802.1-201ENST00000531288 406 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 UNC13C-202ENST00000539562 938 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 AC018410.2-201ENST00000540410 610 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 AC027288.1-203ENST00000552167 567 ntTSL 4 BASIC3.68□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 NDUFAF4P1-201ENST00000559425 519 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 AC099489.2-201ENST00000574976 260 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 AC091691.2-201ENST00000581940 567 ntTSL 4 BASIC3.68□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 AC055876.5-201ENST00000605667 259 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 U7.8-201ENST00000619968 63 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 AL591441.2-201ENST00000620059 535 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 OR1C1-202ENST00000641256 3719 ntAPPRIS P1 BASIC3.68□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 MFSD8-236ENST00000641509 4050 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 MCF2-203ENST00000370576 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 AL390237.1-201ENST00000404226 1415 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 AC092104.1-201ENST00000497346 1441 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 IQCH-201ENST00000335894 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 CCDC110-202ENST00000393540 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 MS4A14-201ENST00000300187 2997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 ADAM29-211ENST00000514159 3010 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.67□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 SPA17-201ENST00000227135 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 TEX43-201ENST00000357147 464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 RNY3P10-201ENST00000384764 102 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 RNU6-837P-201ENST00000391056 108 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 SOD2P1-201ENST00000396543 562 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 RN7SKP142-201ENST00000411236 328 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 AC004870.3-202ENST00000412996 432 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 AL031779.1-201ENST00000415663 330 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 AC092832.1-201ENST00000422934 400 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 AC004870.4-201ENST00000424359 360 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 CYCSP4-201ENST00000429682 331 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
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