Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 SLC4A8-202ENST00000358657 11731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXC1Q12948 AC092958.1-201ENST00000467198 2569 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXC1Q12948 WDCP-201ENST00000295148 3817 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXC1Q12948 RNU6-147P-201ENST00000383983 107 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXC1Q12948 AF186996.5-201ENST00000418098 904 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXC1Q12948 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXC1Q12948 STXBP5-AS1-204ENST00000431143 644 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXC1Q12948 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXC1Q12948 FRG2FP-204ENST00000453982 852 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXC1Q12948 C1orf105-204ENST00000460397 462 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXC1Q12948 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXC1Q12948 EDDM3DP-201ENST00000554692 434 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXC1Q12948 AC023034.1-202ENST00000558153 684 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXC1Q12948 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXC1Q12948 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXC1Q12948 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXC1Q12948 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXC1Q12948 AC126915.2-201ENST00000610957 190 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXC1Q12948 AC135584.1-201ENST00000624438 333 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXC1Q12948 SGMS2-201ENST00000359079 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXC1Q12948 CARD6-201ENST00000254691 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXC1Q12948 MARCH6-201ENST00000274140 9569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXC1Q12948 USP7-202ENST00000381886 3587 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXC1Q12948 CACNA1E-209ENST00000621551 14886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXC1Q12948 AC100778.3-201ENST00000580060 1750 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXC1Q12948 LINC01684-203ENST00000453784 2908 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXC1Q12948 AC005332.9-201ENST00000620266 2921 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXC1Q12948 TCEANC2-201ENST00000234827 10436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXC1Q12948 BBIP1-207ENST00000448814 2119 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 LRRC37B-202ENST00000341671 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 BRD8-204ENST00000411594 2967 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 AP001541.1-201ENST00000623322 1904 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 ECT2L-201ENST00000367682 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 TLR10-207ENST00000613579 3801 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 GRIA2-202ENST00000296526 5621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 GTF2H5-201ENST00000607778 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 TCF7L2-219ENST00000542695 4136 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 AC011604.2-201ENST00000381541 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 MSL2-202ENST00000434835 2272 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 ZNF573-208ENST00000536220 2257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 ZC3H12C-202ENST00000453089 9542 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 CTNNA2-202ENST00000361291 3071 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 MMRN1-202ENST00000394980 5217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 YPEL5-201ENST00000261353 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 CAST-203ENST00000338252 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 TXNRD1-203ENST00000397736 3832 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 SF3B1-202ENST00000409915 600 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 RNA5SP89-201ENST00000410300 108 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 RANP8-201ENST00000444720 713 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 AC073587.1-201ENST00000447093 876 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 AC020890.1-201ENST00000491837 504 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 AC092916.1-201ENST00000497896 411 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 RNU6-347P-201ENST00000516658 105 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 ZNF667-AS1-207ENST00000592146 668 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 MTFR1-203ENST00000458689 2500 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 KIF20A-205ENST00000508792 2935 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 ATP13A5-201ENST00000342358 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 GRIK1-201ENST00000327783 3179 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 SPATA31C1-201ENST00000420021 3895 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 LRRC63-203ENST00000595396 2327 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 HELLS-204ENST00000371332 2675 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 MAGI2-222ENST00000636039 5671 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 CERS3-203ENST00000538112 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 IL21-AS1-201ENST00000417927 3748 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 SLCO1B1-201ENST00000256958 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 F13B-201ENST00000367412 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 C3orf67-AS1-202ENST00000482372 2203 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 MEPE-209ENST00000560249 2206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 ZNF227-208ENST00000589005 2943 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 AC105235.1-201ENST00000623208 1816 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 TTC3-201ENST00000354749 9084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 PROM1-201ENST00000447510 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 ZNF521-201ENST00000361524 4871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 MUC5AC-201ENST00000621226 17448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 AC092821.2-201ENST00000545710 2042 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 AC007842.1-201ENST00000597336 2039 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 MAPK10-287ENST00000641217 3037 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 BDNF-203ENST00000395978 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 LRRC37A3-203ENST00000339474 2589 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 CNTRL-207ENST00000373855 7660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 RNA5SP305-201ENST00000362665 119 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 RNU6-989P-201ENST00000362756 107 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 RNA5SP391-201ENST00000363456 119 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 AL356289.2-201ENST00000455238 292 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 RN7SL738P-201ENST00000470264 297 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 RPL32P33-201ENST00000487023 394 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 AC073964.1-201ENST00000558938 308 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
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