Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 AC015908.2-202ENST00000585243 756 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
GTF3C1Q12789 LINC01930-201ENST00000602672 870 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
GTF3C1Q12789 AC004542.1-201ENST00000602955 264 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
GTF3C1Q12789 AL353778.1-201ENST00000603149 408 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
GTF3C1Q12789 AC025811.1-201ENST00000604312 472 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
GTF3C1Q12789 AC107294.1-201ENST00000609524 467 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
GTF3C1Q12789 TUSC7.1-201ENST00000610969 165 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
GTF3C1Q12789 AC079416.3-201ENST00000624479 549 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
GTF3C1Q12789 FLG-AS1-207ENST00000628475 497 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
GTF3C1Q12789 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
GTF3C1Q12789 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
GTF3C1Q12789 C6orf10-202ENST00000375015 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
GTF3C1Q12789 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
GTF3C1Q12789 NUP35-201ENST00000295119 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
GTF3C1Q12789 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
GTF3C1Q12789 ADGRG7-202ENST00000475887 2035 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
GTF3C1Q12789 OR2M2-201ENST00000359682 1044 ntAPPRIS P1 BASIC2.68□□□□□ -1.98
GTF3C1Q12789 KRTAP27-1-201ENST00000382835 682 ntAPPRIS P1 BASIC2.68□□□□□ -1.98
GTF3C1Q12789 MTND4P13-201ENST00000402078 1023 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
GTF3C1Q12789 AL139098.1-201ENST00000407291 389 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
GTF3C1Q12789 LIMS1-AS1-201ENST00000411710 477 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
GTF3C1Q12789 RPS15AP6-201ENST00000420703 385 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
GTF3C1Q12789 AL451127.1-201ENST00000422909 624 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
GTF3C1Q12789 MTND1P32-201ENST00000433043 938 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
GTF3C1Q12789 AC108734.1-201ENST00000439549 399 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
GTF3C1Q12789 MTCYBP11-201ENST00000447254 1109 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
GTF3C1Q12789 AL355314.1-201ENST00000453639 316 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
GTF3C1Q12789 SLC16A12-AS1-202ENST00000454270 478 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
GTF3C1Q12789 AL157373.1-201ENST00000456036 276 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
GTF3C1Q12789 PCDH9-AS4-201ENST00000456459 436 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
GTF3C1Q12789 SNORD108-201ENST00000459332 71 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
GTF3C1Q12789 AC026410.2-201ENST00000460281 156 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
GTF3C1Q12789 AC099520.1-203ENST00000506976 464 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
GTF3C1Q12789 POU5F1P7-201ENST00000508759 541 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
GTF3C1Q12789 AC113167.1-201ENST00000512941 570 ntTSL 4 BASIC2.68□□□□□ -1.98
GTF3C1Q12789 AC006499.2-201ENST00000513470 337 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
GTF3C1Q12789 AC027335.1-201ENST00000515377 543 ntTSL 4 BASIC2.68□□□□□ -1.98
GTF3C1Q12789 AP005357.1-201ENST00000520749 476 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
GTF3C1Q12789 MIR7515HG-213ENST00000585872 758 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
GTF3C1Q12789 AC092296.3-201ENST00000589968 249 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
GTF3C1Q12789 AL136981.2-201ENST00000617319 734 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
GTF3C1Q12789 AP000776.1-201ENST00000530032 1663 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
GTF3C1Q12789 AC109315.1-201ENST00000584143 1347 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
GTF3C1Q12789 OR4G11P-202ENST00000642116 1414 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
GTF3C1Q12789 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
GTF3C1Q12789 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
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GTF3C1Q12789 RSL24D1P4-201ENST00000400938 484 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
GTF3C1Q12789 PGAP1-203ENST00000409188 1246 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
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GTF3C1Q12789 AC233981.1-201ENST00000423224 461 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
GTF3C1Q12789 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
GTF3C1Q12789 SPINK8-201ENST00000434006 444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
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GTF3C1Q12789 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
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GTF3C1Q12789 PDCL2-201ENST00000295645 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
GTF3C1Q12789 OR5T2-201ENST00000313264 1248 ntAPPRIS P2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
GTF3C1Q12789 LINC00301-201ENST00000320202 852 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
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GTF3C1Q12789 UBE2D3P4-201ENST00000441973 436 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
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GTF3C1Q12789 AL512658.1-201ENST00000449072 533 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
GTF3C1Q12789 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
GTF3C1Q12789 AL158069.1-201ENST00000454131 455 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
GTF3C1Q12789 FAIM-205ENST00000464668 641 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
GTF3C1Q12789 Z84488.1-201ENST00000476099 530 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
GTF3C1Q12789 AC112178.1-201ENST00000511165 676 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
GTF3C1Q12789 AC026780.1-201ENST00000512237 952 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
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