Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 Y_RNA.493-201ENST00000384422 102 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 SNORD116-23-201ENST00000384645 92 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 RNU6-298P-201ENST00000390888 96 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 U3.42-201ENST00000408746 214 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 AC233981.1-201ENST00000423224 461 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 LINC01318-201ENST00000423593 597 ntTSL 4 BASIC3.25□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 ANKRD10-IT1-201ENST00000426991 800 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 RPL31P54-201ENST00000429803 370 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 RN7SL20P-201ENST00000488827 297 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 AC093752.1-206ENST00000511823 336 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 AC011586.1-201ENST00000521055 458 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 FAM60DP-201ENST00000524174 632 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 LINC02448-201ENST00000548613 583 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 AL512310.1-201ENST00000548639 172 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 MRPL42-208ENST00000552217 920 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 AC022069.1-201ENST00000582910 658 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 AP000238.1-201ENST00000608759 426 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 AP005137.2-201ENST00000609238 400 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 C17orf112-201ENST00000623702 835 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 SGO1P2-201ENST00000429458 1589 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 SAMSN1-202ENST00000400564 1382 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 LUZP2-208ENST00000620308 4981 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 MTND4P9-201ENST00000507819 1346 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 MIR30E-201ENST00000362104 92 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 RNU6-921P-201ENST00000384361 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 RNU4-78P-201ENST00000410940 126 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 RPL32P35-201ENST00000415214 394 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 AL449283.1-202ENST00000418249 604 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 USP9YP21-201ENST00000420603 432 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 C1DP1-201ENST00000426049 402 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 ABCC13-201ENST00000429114 611 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 B3GNT2P1-201ENST00000434960 952 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 RPS12P18-201ENST00000442381 270 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 AL365204.2-201ENST00000446754 687 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 COX6CP18-201ENST00000448769 222 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 AL162389.1-201ENST00000449233 177 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 OR6K1P-201ENST00000456766 971 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 RC3H2-207ENST00000471874 749 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 ST13P14-201ENST00000474095 734 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 AC113347.4-201ENST00000506032 685 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 AC048346.1-201ENST00000510247 144 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 LINC02353-201ENST00000515181 849 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 snoZ278.1-201ENST00000517059 112 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 IGKV2D-36-201ENST00000518643 226 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 PKIA-AS1-203ENST00000522807 692 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 AL353699.1-201ENST00000529078 365 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 AC118942.1-202ENST00000529081 578 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 AC087623.1-201ENST00000533301 377 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 LINC02399-201ENST00000547094 400 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 AC087897.1-201ENST00000550134 156 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 YWHAZP1-201ENST00000556286 722 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 AC122134.1-202ENST00000569111 1201 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 AC091691.2-201ENST00000581940 567 ntTSL 4 BASIC3.24□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 AC016493.1-201ENST00000586106 688 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 AC018645.2-201ENST00000609151 472 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 NEAT1-205ENST00000616315 483 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 DLG2-AS1_1.1-201ENST00000622319 213 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 AP003476.1-201ENST00000623984 516 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 TPTE2-202ENST00000382978 1677 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 LINC01625-201ENST00000454788 1690 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 AC092447.7-201ENST00000422212 1621 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 CCDC169-201ENST00000239859 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 UBE2Q2P1-202ENST00000354771 883 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 RNU6-582P-201ENST00000362989 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 RNU6-236P-201ENST00000363886 106 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 CCDC169-203ENST00000379862 624 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 MIR217-201ENST00000384817 110 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 RNA5SP31-201ENST00000411144 127 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 AL669831.5-220ENST00000412115 581 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 BTF3P8-201ENST00000414577 526 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 MTCYBP32-201ENST00000427945 1084 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 AC114973.1-201ENST00000429057 632 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 AC010157.1-201ENST00000440589 527 ntTSL 4 BASIC3.23□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 AL590664.1-201ENST00000448065 339 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 MUC7-203ENST00000456088 2479 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC3.23□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 MGAT4A-209ENST00000495056 683 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 AC008427.1-201ENST00000503102 655 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 AC104057.1-201ENST00000515547 497 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 RNU6-885P-201ENST00000516607 104 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.4 ms