Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 MIR8080-201ENST00000622224 89 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPREP23469 UBE2E2-207ENST00000628311 267 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPREP23469 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPREP23469 RUVBL2-214ENST00000640699 153 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPREP23469 PTPRD-214ENST00000540109 6210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPREP23469 KIAA1328-201ENST00000280020 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPREP23469 TGIF1-208ENST00000472042 2214 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPREP23469 TRIP12-204ENST00000389045 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPREP23469 AC007557.3-201ENST00000418591 3135 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPREP23469 GTF2IP4-201ENST00000453092 2054 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPREP23469 CAPN6-201ENST00000324068 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPREP23469 CEACAM1-201ENST00000161559 3519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPREP23469 ALB-209ENST00000503124 1741 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPREP23469 CUBN-202ENST00000377833 11949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPREP23469 KRTAP24-1-201ENST00000340345 1650 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPREP23469 PHC3-214ENST00000494943 5030 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPREP23469 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPREP23469 AC140479.2-201ENST00000421567 3130 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPREP23469 APBB2-230ENST00000543538 6992 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPREP23469 CALN1-203ENST00000395276 9189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPREP23469 TTI1-203ENST00000449821 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPREP23469 SLC2A3P1-201ENST00000519666 1451 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPREP23469 ALG10B-201ENST00000308742 10253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPREP23469 LINC01179-201ENST00000507838 2163 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPREP23469 AC232271.1-201ENST00000602455 2715 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPREP23469 NBPF26-202ENST00000611287 2701 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPREP23469 NBPF14-211ENST00000621070 2701 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPREP23469 CYP3A7-201ENST00000336374 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPREP23469 MCM10-202ENST00000378714 4547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPREP23469 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPREP23469 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPREP23469 AC009804.1-201ENST00000400949 179 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPREP23469 AC004882.2-201ENST00000420180 244 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPREP23469 OR6D1P-201ENST00000436165 939 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPREP23469 AC091179.1-201ENST00000461606 579 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPREP23469 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPREP23469 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPREP23469 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPREP23469 AC016065.2-201ENST00000514530 444 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPREP23469 AC087369.1-201ENST00000520775 996 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPREP23469 AP006245.1-201ENST00000522549 120 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPREP23469 AC136777.2-201ENST00000522979 358 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPREP23469 FKBP1BP1-201ENST00000553366 325 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPREP23469 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPREP23469 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPREP23469 MIR7155-201ENST00000615925 56 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPREP23469 MIR6837-201ENST00000620884 64 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPREP23469 RWDD2A-201ENST00000369724 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPREP23469 NBPF20-205ENST00000622803 3689 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPREP23469 ZBTB38-222ENST00000637056 6056 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPREP23469 AL591135.1-201ENST00000401578 5914 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPREP23469 RABGAP1L-208ENST00000392064 6282 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPREP23469 PTPRT-201ENST00000356100 12480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPREP23469 PTPRT-202ENST00000373184 12483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPREP23469 PTPRT-203ENST00000373187 12453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPREP23469 KCNJ1-204ENST00000392665 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPREP23469 AC025470.1-201ENST00000510053 2032 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPREP23469 PSD3-204ENST00000440756 11690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPREP23469 TTC39C-201ENST00000304621 2304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPREP23469 OR7C1-204ENST00000642000 11290 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPREP23469 DSC2-201ENST00000251081 4826 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPREP23469 CEP85L-201ENST00000360290 1736 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPREP23469 FCER1G-201ENST00000289902 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPREP23469 RNU1-130P-201ENST00000363930 160 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPREP23469 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPREP23469 TRAV16-201ENST00000390444 329 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPREP23469 ESRRG-208ENST00000391890 5542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPREP23469 HIST1H3PS1-201ENST00000404612 417 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPREP23469 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPREP23469 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPREP23469 AL133173.1-201ENST00000423458 397 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPREP23469 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPREP23469 Z92846.1-201ENST00000456203 268 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPREP23469 RN7SL583P-201ENST00000475692 287 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPREP23469 AC008953.1-201ENST00000497334 318 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPREP23469 AC231760.1-201ENST00000498002 260 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPREP23469 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPREP23469 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPREP23469 MIR4700-201ENST00000578311 74 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPREP23469 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPREP23469 LINC01835-202ENST00000589345 450 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPREP23469 AC005702.2-201ENST00000591035 481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPREP23469 ZNF667-AS1-207ENST00000592146 668 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPREP23469 AC006077.1-201ENST00000604746 343 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPREP23469 AC006329.2-201ENST00000611491 394 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPREP23469 PLCE1-AS2-211ENST00000613585 542 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPREP23469 TUG1_2.1-201ENST00000614234 87 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPREP23469 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPREP23469 MIR4679-1-201ENST00000637619 75 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPREP23469 SYCP2L-207ENST00000543878 2436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPREP23469 ADGRE1-202ENST00000312053 3128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPREP23469 LIN7C-202ENST00000524596 4290 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPREP23469 ZNF559-ZNF177-201ENST00000434737 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPREP23469 AL031119.1-201ENST00000404707 1879 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPREP23469 RNF150-202ENST00000420921 3673 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPREP23469 AL160286.3-201ENST00000569644 3294 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTPREP23469 AC116158.1-201ENST00000560231 2129 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PTPREP23469 SELENOI-205ENST00000613142 8126 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTPREP23469 AC009962.1-201ENST00000567327 3813 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PTPREP23469 HHLA2-209ENST00000489514 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
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