Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 AF015720.1-201ENST00000412240 349 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXD3Q9UJU5 AL162384.1-201ENST00000437881 499 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXD3Q9UJU5 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXD3Q9UJU5 RPL23AP31-201ENST00000456160 467 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXD3Q9UJU5 RPS23P2-201ENST00000463671 415 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXD3Q9UJU5 RPL32P33-201ENST00000487023 394 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXD3Q9UJU5 APOOP4-201ENST00000513530 597 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXD3Q9UJU5 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXD3Q9UJU5 AC012400.1-201ENST00000518452 381 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXD3Q9UJU5 AC022882.1-201ENST00000532142 501 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXD3Q9UJU5 SLC48A1-205ENST00000547002 751 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXD3Q9UJU5 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXD3Q9UJU5 DSCR9-205ENST00000585273 751 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXD3Q9UJU5 AC009271.1-202ENST00000588803 492 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXD3Q9UJU5 AC006272.2-201ENST00000594725 163 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXD3Q9UJU5 CDC42EP3P1-201ENST00000601004 764 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXD3Q9UJU5 HCG18-243ENST00000602498 327 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXD3Q9UJU5 AP000569.1-201ENST00000607953 591 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXD3Q9UJU5 SSX9-202ENST00000608568 580 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXD3Q9UJU5 AC107294.1-201ENST00000609524 467 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXD3Q9UJU5 Metazoa_SRP.43-201ENST00000616394 271 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXD3Q9UJU5 ST8SIA4-201ENST00000231461 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXD3Q9UJU5 ZNF559-201ENST00000317221 2732 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXD3Q9UJU5 ZNF615-213ENST00000602063 4094 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXD3Q9UJU5 OR10D3-203ENST00000641546 3566 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXD3Q9UJU5 AC087473.1-201ENST00000561320 2471 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXD3Q9UJU5 AC009962.1-201ENST00000567327 3813 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXD3Q9UJU5 NBPF20-205ENST00000622803 3689 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXD3Q9UJU5 MAPK10-304ENST00000641341 3984 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXD3Q9UJU5 ZNF347-202ENST00000452676 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXD3Q9UJU5 CD86-204ENST00000469710 1604 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXD3Q9UJU5 ZNF227-208ENST00000589005 2943 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXD3Q9UJU5 CHM-201ENST00000357749 5442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXD3Q9UJU5 TMEM251-201ENST00000283534 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXD3Q9UJU5 OR5J2-201ENST00000312298 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXD3Q9UJU5 TNP2-201ENST00000312693 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXD3Q9UJU5 AC106870.1-201ENST00000359823 200 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXD3Q9UJU5 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXD3Q9UJU5 U3.7-201ENST00000363668 216 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXD3Q9UJU5 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXD3Q9UJU5 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXD3Q9UJU5 TRAJ25-201ENST00000390512 60 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXD3Q9UJU5 AL138885.1-201ENST00000405921 675 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXD3Q9UJU5 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXD3Q9UJU5 LINC00894-201ENST00000413076 403 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXD3Q9UJU5 AC004882.2-201ENST00000420180 244 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXD3Q9UJU5 AL354766.1-201ENST00000423396 542 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXD3Q9UJU5 OR2AH1P-201ENST00000425717 928 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXD3Q9UJU5 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXD3Q9UJU5 RPL23AP2-201ENST00000471227 466 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXD3Q9UJU5 HSPE1P6-201ENST00000479457 291 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXD3Q9UJU5 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXD3Q9UJU5 DUTP1-201ENST00000493631 470 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXD3Q9UJU5 AC138965.1-202ENST00000502354 547 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXD3Q9UJU5 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXD3Q9UJU5 AC140125.3-201ENST00000505248 547 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXD3Q9UJU5 SLC25A15P5-201ENST00000508033 253 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXD3Q9UJU5 AC091435.2-201ENST00000514586 565 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXD3Q9UJU5 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXD3Q9UJU5 ST3GAL3-233ENST00000531816 344 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXD3Q9UJU5 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXD3Q9UJU5 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXD3Q9UJU5 AC092078.1-201ENST00000558370 325 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXD3Q9UJU5 LINC02563-201ENST00000579474 277 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXD3Q9UJU5 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXD3Q9UJU5 AC099669.2-201ENST00000616549 437 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXD3Q9UJU5 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXD3Q9UJU5 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXD3Q9UJU5 ZNF107-205ENST00000613690 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXD3Q9UJU5 ZNF615-201ENST00000376716 4048 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXD3Q9UJU5 RAB30-212ENST00000533486 9929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXD3Q9UJU5 TOPBP1-201ENST00000260810 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXD3Q9UJU5 GALNT11-203ENST00000422997 2371 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXD3Q9UJU5 TPTE2-205ENST00000400230 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXD3Q9UJU5 DECR1-215ENST00000522161 1766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXD3Q9UJU5 GTPBP10-201ENST00000222511 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXD3Q9UJU5 ZNF33B-208ENST00000613419 5843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXD3Q9UJU5 AL365440.1-201ENST00000436135 2167 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXD3Q9UJU5 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXD3Q9UJU5 CEACAM1-201ENST00000161559 3519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXD3Q9UJU5 DMTF1-204ENST00000413276 3548 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXD3Q9UJU5 FRAS1-207ENST00000512123 15624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXD3Q9UJU5 OR5A2-203ENST00000641673 9444 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXD3Q9UJU5 RNMT-201ENST00000262173 6051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXD3Q9UJU5 KDM4C-214ENST00000536108 3406 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXD3Q9UJU5 CLVS1-205ENST00000519846 3622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXD3Q9UJU5 NKAIN2-204ENST00000545433 3052 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXD3Q9UJU5 RNA5SP319-201ENST00000362768 119 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXD3Q9UJU5 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXD3Q9UJU5 SNORA74A-201ENST00000364089 198 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXD3Q9UJU5 RNA5SP30-201ENST00000365552 115 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXD3Q9UJU5 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXD3Q9UJU5 AC108032.1-201ENST00000416706 207 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXD3Q9UJU5 EIF4A1P7-201ENST00000421800 1220 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXD3Q9UJU5 VTI1BP4-201ENST00000427516 527 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXD3Q9UJU5 AL353693.1-201ENST00000429567 442 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXD3Q9UJU5 AL158071.1-201ENST00000430315 461 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXD3Q9UJU5 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXD3Q9UJU5 AC100832.1-201ENST00000471945 383 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXD3Q9UJU5 RN7SL184P-201ENST00000488308 297 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.8 ms