Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYL9

TMOD3, Tropomodulin-3, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3Q9NYL9 ZNF415-207ENST00000595193 2479 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
TMOD3Q9NYL9 TFEC-201ENST00000265440 6628 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
TMOD3Q9NYL9 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
TMOD3Q9NYL9 FKTN-209ENST00000602661 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
TMOD3Q9NYL9 LRRC39-204ENST00000620882 1951 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
TMOD3Q9NYL9 RNU5D-1-201ENST00000363299 116 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TMOD3Q9NYL9 SNORD56.3-201ENST00000363507 71 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TMOD3Q9NYL9 RNU6-560P-201ENST00000364007 108 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TMOD3Q9NYL9 TXNDC8-202ENST00000374510 455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
TMOD3Q9NYL9 KLRC2-202ENST00000381902 1221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
TMOD3Q9NYL9 SNORA51.6-201ENST00000384151 125 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TMOD3Q9NYL9 Y_RNA.493-201ENST00000384422 102 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TMOD3Q9NYL9 AP000567.1-201ENST00000406413 156 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TMOD3Q9NYL9 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TMOD3Q9NYL9 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TMOD3Q9NYL9 AC068533.2-201ENST00000411872 306 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TMOD3Q9NYL9 TOMM22P1-201ENST00000418578 312 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TMOD3Q9NYL9 AC013402.2-201ENST00000424257 437 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
TMOD3Q9NYL9 AF212831.1-201ENST00000430064 377 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
TMOD3Q9NYL9 ARF4P2-201ENST00000430209 526 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TMOD3Q9NYL9 ZRANB2-AS2-204ENST00000430605 213 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
TMOD3Q9NYL9 AL683807.1-202ENST00000432272 382 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
TMOD3Q9NYL9 Z80107.1-201ENST00000436830 412 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TMOD3Q9NYL9 MTCO1P48-201ENST00000448024 1096 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TMOD3Q9NYL9 NECAP1P2-201ENST00000455668 727 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TMOD3Q9NYL9 TRBV26-201ENST00000456572 344 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TMOD3Q9NYL9 HMGN2P16-201ENST00000456802 261 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TMOD3Q9NYL9 AC078883.3-201ENST00000458314 512 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
TMOD3Q9NYL9 AC005410.1-202ENST00000460347 485 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TMOD3Q9NYL9 PABPC1P3-201ENST00000469174 459 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TMOD3Q9NYL9 MDM2-217ENST00000478070 692 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
TMOD3Q9NYL9 CCNG1-203ENST00000504553 732 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
TMOD3Q9NYL9 AC008243.1-202ENST00000506527 481 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
TMOD3Q9NYL9 AC117522.3-201ENST00000507974 584 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TMOD3Q9NYL9 OTUD4-208ENST00000509620 864 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
TMOD3Q9NYL9 MTCO3P44-201ENST00000510977 541 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TMOD3Q9NYL9 AC079160.1-201ENST00000513489 739 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
TMOD3Q9NYL9 AC013509.1-201ENST00000524269 339 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
TMOD3Q9NYL9 AC090502.2-201ENST00000549267 280 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TMOD3Q9NYL9 AC125611.1-201ENST00000549563 229 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TMOD3Q9NYL9 AC087311.2-201ENST00000549660 320 ntTSL 4 BASIC3.64□□□□□ -1.83
TMOD3Q9NYL9 AC084879.2-201ENST00000551656 369 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
TMOD3Q9NYL9 LSM6P2-201ENST00000552208 177 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TMOD3Q9NYL9 AADACP1-206ENST00000561502 1193 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TMOD3Q9NYL9 AC234778.2-201ENST00000566241 354 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TMOD3Q9NYL9 AGGF1P5-201ENST00000567900 919 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TMOD3Q9NYL9 AP005433.1-202ENST00000580845 521 ntTSL 4 BASIC3.64□□□□□ -1.83
TMOD3Q9NYL9 AP001269.3-201ENST00000588718 329 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TMOD3Q9NYL9 AL450336.1-201ENST00000605180 586 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TMOD3Q9NYL9 AC092954.1-201ENST00000609121 445 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TMOD3Q9NYL9 AC008083.4-201ENST00000615076 444 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TMOD3Q9NYL9 C17orf112-201ENST00000623702 835 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
TMOD3Q9NYL9 AC006963.1-201ENST00000624003 1052 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TMOD3Q9NYL9 ZNF382-210ENST00000639288 834 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
TMOD3Q9NYL9 ARID2-206ENST00000457135 4356 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
TMOD3Q9NYL9 THEMIS-201ENST00000368248 3866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
TMOD3Q9NYL9 NUP35-203ENST00000409798 1470 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
TMOD3Q9NYL9 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TMOD3Q9NYL9 RNU6-216P-201ENST00000363282 104 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TMOD3Q9NYL9 XGY1-201ENST00000381172 446 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TMOD3Q9NYL9 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TMOD3Q9NYL9 AL583834.1-201ENST00000406943 343 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TMOD3Q9NYL9 RNU4-78P-201ENST00000410940 126 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TMOD3Q9NYL9 SSR1P2-201ENST00000415208 787 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TMOD3Q9NYL9 ELOCP9-201ENST00000418624 239 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TMOD3Q9NYL9 MRPS36P1-201ENST00000421291 307 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TMOD3Q9NYL9 AL589946.1-201ENST00000421465 420 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
TMOD3Q9NYL9 AL391069.1-201ENST00000422153 358 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
TMOD3Q9NYL9 GTF2IP23-201ENST00000423746 351 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TMOD3Q9NYL9 AC073641.1-201ENST00000425192 429 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
TMOD3Q9NYL9 MYL8P-204ENST00000431574 518 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TMOD3Q9NYL9 AC084290.1-201ENST00000434995 374 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TMOD3Q9NYL9 AC007327.1-201ENST00000447461 264 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TMOD3Q9NYL9 AC004022.1-201ENST00000447766 1066 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TMOD3Q9NYL9 RPS24P6-201ENST00000452670 400 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TMOD3Q9NYL9 OFD1P7Y-201ENST00000454643 1155 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TMOD3Q9NYL9 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TMOD3Q9NYL9 AL049830.2-201ENST00000480072 201 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TMOD3Q9NYL9 AC108734.3-201ENST00000481241 1165 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TMOD3Q9NYL9 AC073359.1-201ENST00000486545 521 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
TMOD3Q9NYL9 AC108729.1-201ENST00000487812 947 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TMOD3Q9NYL9 THAP6-203ENST00000502620 582 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
TMOD3Q9NYL9 MND1-203ENST00000504860 638 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
TMOD3Q9NYL9 AC020699.1-201ENST00000505161 445 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TMOD3Q9NYL9 AC091917.1-201ENST00000506330 566 ntTSL 4 BASIC3.63□□□□□ -1.83
TMOD3Q9NYL9 LINC02364-201ENST00000514802 687 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
TMOD3Q9NYL9 RNU6-1231P-201ENST00000517185 103 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TMOD3Q9NYL9 AC022390.1-201ENST00000517854 434 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
TMOD3Q9NYL9 AC067817.1-201ENST00000518535 356 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
TMOD3Q9NYL9 ZFAND1-217ENST00000521895 885 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
TMOD3Q9NYL9 AP001189.2-201ENST00000527320 189 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TMOD3Q9NYL9 CARD18-202ENST00000530950 652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
TMOD3Q9NYL9 AC026894.1-202ENST00000533843 477 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
TMOD3Q9NYL9 SMILR-201ENST00000533992 553 ntTSL 4 BASIC3.63□□□□□ -1.83
TMOD3Q9NYL9 AC005832.3-201ENST00000537929 631 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TMOD3Q9NYL9 AC093025.1-201ENST00000547795 569 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
TMOD3Q9NYL9 SYF2P1-201ENST00000550658 413 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TMOD3Q9NYL9 AF099810.1-201ENST00000554219 525 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
TMOD3Q9NYL9 AC011509.1-201ENST00000589512 164 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
TMOD3Q9NYL9 AC069304.2-201ENST00000605154 435 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.6 ms