Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 OR1AA1P-201ENST00000419597 916 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 RPL17P36-201ENST00000420302 549 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 SDCBPP2-201ENST00000424643 885 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 AL929288.1-201ENST00000426262 746 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 UTS2B-203ENST00000427544 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 AL138759.1-201ENST00000432120 645 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 ARHGEF7-AS1-201ENST00000435037 321 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 RPS29P7-201ENST00000439662 171 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 PGBD4P3-201ENST00000440731 581 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 AC011897.1-201ENST00000450715 346 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 MTCO3P20-201ENST00000454926 688 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 AL583843.1-201ENST00000456070 346 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 NDUFAF4P3-201ENST00000456468 525 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 AC023598.1-201ENST00000472521 361 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 GAPDHP39-201ENST00000481866 979 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 VN1R105P-201ENST00000486595 910 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 AC008629.1-202ENST00000504820 525 ntTSL 4 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 CCDC34P1-201ENST00000507441 517 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 RPL7L1P13-201ENST00000511702 739 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 MIR2116-201ENST00000517221 80 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 NRG1-IT1-202ENST00000521463 742 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 AC022695.3-201ENST00000523385 478 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 AC243972.3-201ENST00000539655 198 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 LINC02300-201ENST00000549742 665 ntTSL 4 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 AC093249.1-201ENST00000567049 203 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 AL032819.1-201ENST00000568554 379 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 LINC01899-201ENST00000580323 312 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 AC103987.2-201ENST00000583436 417 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 AC009977.1-201ENST00000586015 570 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 AL391646.1-201ENST00000603860 190 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 AC004908.2-201ENST00000609090 574 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 AC243829.4-202ENST00000610845 410 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 AC243756.2-201ENST00000618406 463 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 TEX41-265ENST00000627785 704 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 SLC38A2-209ENST00000551374 2802 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 ANKRD28-215ENST00000624145 6383 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 DMXL2-202ENST00000449909 7465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 GPR34-202ENST00000378142 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 AC025125.1-201ENST00000624743 1922 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 NCOA1-202ENST00000348332 6895 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 SGMS2-201ENST00000359079 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 NCOA1-203ENST00000395856 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 ERCC6-202ENST00000374127 1782 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 CCDC158-202ENST00000434846 1728 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 AMY2A-201ENST00000414303 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 TPTE2-201ENST00000255310 1562 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 DNAH12-201ENST00000311202 1555 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 NR3C1-202ENST00000343796 7286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 AL031985.3-201ENST00000565390 2449 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 GDI2P1-201ENST00000429312 1336 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 PARP15-206ENST00000493645 1311 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 DAZ4-202ENST00000382314 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 STARD6-201ENST00000307844 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 AL359704.1-201ENST00000411586 781 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 AC108032.1-201ENST00000416706 207 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 AL160162.1-202ENST00000417654 244 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 AL590378.1-201ENST00000426818 303 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
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CCDC142Q17RM4 SNRPFP4-201ENST00000456366 242 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 RPL37P3-201ENST00000456825 293 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 AC093278.1-201ENST00000494700 600 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 AC005920.2-201ENST00000509833 332 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
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CCDC142Q17RM4 AC098868.1-201ENST00000512628 624 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
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CCDC142Q17RM4 RNU7-143P-201ENST00000516781 65 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 RNU6-352P-201ENST00000516908 107 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 RNU6-794P-201ENST00000517261 64 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
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CCDC142Q17RM4 HSPA8P13-201ENST00000523715 472 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
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CCDC142Q17RM4 AL512310.1-201ENST00000548639 172 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 LINC02386-202ENST00000551287 564 ntTSL 4 BASIC4.32□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 AC004943.1-202ENST00000558618 503 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 GTF2IP8-201ENST00000560687 584 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 AC018638.8-201ENST00000588755 281 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 AC105094.2-203ENST00000590357 555 ntTSL 4 BASIC4.32□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 BNIP3P23-201ENST00000599655 511 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 AC243960.4-201ENST00000600532 288 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 AL356515.1-201ENST00000611081 415 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 AC104010.1-201ENST00000616889 150 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 ALG13-230ENST00000623189 458 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 FAM111A-201ENST00000361723 3592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 ZNF616-201ENST00000330123 2563 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 GTF2H2B-203ENST00000508065 1432 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 AJ009632.2-204ENST00000635621 1401 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 KCNU1-201ENST00000399881 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 PIGN-229ENST00000638936 4233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 CACNB4-257ENST00000637547 7658 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 ORC4-216ENST00000540442 6472 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 ENSAP3-201ENST00000312710 333 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 U3.15-201ENST00000365398 212 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 KRTAP19-8-201ENST00000382822 318 ntAPPRIS P1 BASIC4.31□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
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