Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 AL691497.1-201ENST00000443270 449 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 AL162151.2-201ENST00000448875 158 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 HMGN2P7-201ENST00000456186 273 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 SNORD97-201ENST00000459187 142 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 RPS27AP17-201ENST00000463344 455 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 AL049874.1-201ENST00000489560 388 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 AC008958.1-201ENST00000511047 682 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 RN7SKP13-201ENST00000515933 244 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 RNU6-405P-201ENST00000516637 110 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 AC100782.1-201ENST00000520778 590 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 AC021736.1-201ENST00000521143 563 ntTSL 4 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 AC113192.1-201ENST00000527270 321 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 AP000442.2-202ENST00000531311 601 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 DAZAP2-209ENST00000549732 601 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 NDUFB1-204ENST00000555441 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 AC012213.3-201ENST00000577199 777 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 AC005154.1-222ENST00000579024 341 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 AC069061.2-202ENST00000580280 357 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 AC068790.2-201ENST00000602601 557 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 AC073648.5-201ENST00000603502 305 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 AC012531.5-201ENST00000611375 151 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 AL356130.2-201ENST00000612554 404 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 AL138721.1-201ENST00000616756 179 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 AC092683.2-203ENST00000618807 788 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 AC244196.2-201ENST00000621184 411 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 OR10AG1-202ENST00000641071 2807 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 PLAG1-201ENST00000316981 7322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 AC027290.2-201ENST00000623210 18662 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 IFI16-208ENST00000448393 2245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 GABRG2-208ENST00000638552 3710 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 FIGNL1-202ENST00000395556 3485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 AF127577.6-201ENST00000623352 2191 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 SLAIN1-203ENST00000351546 2394 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 ELAVL2-204ENST00000397312 3805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 RPA3-203ENST00000401447 414 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 RNA5SP146-201ENST00000410743 123 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 MTCO3P41-201ENST00000414801 328 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 AL356095.1-201ENST00000417217 199 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 NBDY-202ENST00000423617 543 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 AC012442.1-201ENST00000436885 529 ntTSL 4 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 AC012671.1-201ENST00000451912 203 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 AC098820.1-201ENST00000453157 512 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 NANOGP10-201ENST00000453325 895 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 AC092264.1-201ENST00000456002 713 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 RPL7L1P8-201ENST00000469911 741 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 AC108022.1-201ENST00000493466 478 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 MRPL36-203ENST00000505818 595 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 Y_RNA.655-201ENST00000515919 96 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 TRAV8-5-201ENST00000537369 341 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 SYF2P1-201ENST00000550658 413 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 SLC12A1-210ENST00000561031 735 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 HSPE1P5-201ENST00000561489 272 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 AP005671.1-201ENST00000581798 463 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 AC053481.4-201ENST00000583164 216 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 MIR4293-201ENST00000584305 78 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 LINC01909-202ENST00000584919 815 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
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PTPROQ16827 AC110801.1-201ENST00000623590 212 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 AC055839.1-201ENST00000634467 498 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 LINC00622-201ENST00000562811 1570 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 KCNJ13-201ENST00000233826 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 MAPK10-235ENST00000638225 8941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 MANEA-201ENST00000358812 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 FLG-AS1-205ENST00000445097 2857 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 PRO1804-201ENST00000623780 2050 ntBASIC4.71□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 OR5H14-202ENST00000641380 7323 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 C8orf34-203ENST00000348340 3571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 OR6C70-201ENST00000327335 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 SNORA20.2-201ENST00000383922 131 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 AL121834.1-202ENST00000404494 277 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 AL117381.1-201ENST00000412972 374 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 AC092155.1-202ENST00000416111 932 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 AC108032.1-201ENST00000416706 207 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 PDSS1P1-201ENST00000422953 1114 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 AL590783.1-201ENST00000424138 456 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 RPL23AP25-201ENST00000430973 463 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 BTF3P10-201ENST00000433415 495 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 NDUFB4P9-201ENST00000511646 388 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 EGFLAM-AS2-202ENST00000514377 539 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 AL160262.1-201ENST00000522264 254 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 AP003392.2-201ENST00000527269 208 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 LINC02390-201ENST00000541404 560 ntTSL 4 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 ZNF415P1-201ENST00000582279 1166 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 AL157786.1-204ENST00000594870 506 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 AC079587.1-201ENST00000603846 277 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 AP000860.1-201ENST00000605250 559 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 MIR6867-201ENST00000610636 67 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 AL110115.1-201ENST00000614396 364 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 MIR6875-201ENST00000617506 72 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 AC007546.1-201ENST00000619452 559 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 LGALS13-204ENST00000621475 494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 AF117829.1-206ENST00000621883 3802 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 AC007546.2-201ENST00000623996 360 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 ARL15-202ENST00000504924 2486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 ARL15-207ENST00000620747 2486 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
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