Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 LINC01405-202ENST00000547607 674 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 GAPLINC-202ENST00000579007 643 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 AC008738.1-201ENST00000590117 375 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 AC007566.2-201ENST00000603642 413 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 AC008162.1-201ENST00000604718 254 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 AL670379.4-201ENST00000605279 254 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 MIR7155-201ENST00000615925 56 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 AC091905.4-201ENST00000623432 202 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 AC087632.1-216ENST00000625619 487 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 LINC00706-201ENST00000628989 699 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 WDR75-207ENST00000631047 270 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 MAPK10-338ENST00000641647 3362 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 AC008079.2-201ENST00000623543 20396 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 SDHC-202ENST00000367975 13566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 CSMD3-204ENST00000455883 12485 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 CLVS1-205ENST00000519846 3622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 MMRN1-202ENST00000394980 5217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 ASTE1-208ENST00000514044 2504 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 RBM5-214ENST00000469838 2716 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 IL1RL1-201ENST00000233954 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 SAMD12-202ENST00000409003 8866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 DNAJC16-210ENST00000616884 5882 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 PLS1-211ENST00000497002 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 DOCK9-207ENST00000442173 7643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 MPDZ-204ENST00000381022 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 AC008758.3-201ENST00000507003 1829 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 CCNT1-205ENST00000618666 6915 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 DCLK1-204ENST00000379893 4612 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 ATRX-202ENST00000395603 10218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 PSG7-202ENST00000446844 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 CARD16-202ENST00000375706 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 LZIC-201ENST00000377213 945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 SNORD51-201ENST00000384320 80 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 NDUFS5P1-201ENST00000405668 289 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 AL449043.1-202ENST00000427318 582 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 AC093151.1-201ENST00000427711 313 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
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RTN1Q16799 AC009478.1-201ENST00000429816 562 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
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RTN1Q16799 PSMD10P3-201ENST00000437000 448 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 AC000111.2-201ENST00000448200 210 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
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RTN1Q16799 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
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RTN1Q16799 ZBTB38-220ENST00000514251 7683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 ZEB1-208ENST00000542815 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 PATJ-213ENST00000613764 4172 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 SPART-201ENST00000355182 4820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 INTS6P1-201ENST00000504674 2530 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 RIMS1-212ENST00000517827 3065 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
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RTN1Q16799 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 RNU11-4P-201ENST00000391149 133 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 AL357515.1-201ENST00000402967 542 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 CCDC126-203ENST00000410069 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 RNU2-50P-201ENST00000410494 143 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 HNRNPDLP1-201ENST00000412834 550 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 RPL31P2-201ENST00000413849 377 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 TBCAP2-201ENST00000416175 326 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 RPL9P9-201ENST00000418824 636 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 RNA5SP392-201ENST00000516905 112 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 AC009812.2-201ENST00000517657 457 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 FBXO3-AS1-202ENST00000533046 386 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 AC005868.1-201ENST00000536421 331 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 AC024909.1-201ENST00000549278 599 ntTSL 4 BASIC5.73□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 DYNLL1P4-201ENST00000549314 266 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 AC073525.1-201ENST00000549762 543 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
RTN1Q16799 AL121576.1-201ENST00000556055 276 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
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