Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 USP33-201ENST00000357428 4155 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 AC072062.1-210ENST00000628464 1315 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 AL390862.1-201ENST00000635467 1469 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 AL079343.1-201ENST00000572358 1771 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 MBNL1-220ENST00000493459 4205 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 Y_RNA.192-201ENST00000363977 102 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 CYCSP45-201ENST00000402289 315 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 AL592114.1-201ENST00000403842 483 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 GRK5-IT1-201ENST00000421206 400 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 AC004946.1-201ENST00000421825 751 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 LINC00387-201ENST00000422609 458 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 SAR1AP4-201ENST00000429225 591 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 AP002512.3-201ENST00000440231 985 ntAPPRIS P1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 AL645638.1-201ENST00000440519 361 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 AL050303.1-201ENST00000444356 458 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 RPL23AP20-201ENST00000447965 421 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 snoU13.4-201ENST00000458916 104 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 AP001992.1-205ENST00000462248 379 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 RPL21P93-201ENST00000480465 489 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 AC233702.1-201ENST00000482905 502 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 LINC02032-201ENST00000490465 391 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 AC096751.1-202ENST00000502691 1067 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 MTCYBP17-201ENST00000503579 789 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 LINC01861-201ENST00000509568 537 ntTSL 4 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 AC004062.1-201ENST00000509926 645 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 AC131956.2-201ENST00000510922 512 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 AC109445.1-201ENST00000512356 383 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 RNU4ATAC3P-201ENST00000516699 126 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 AC136777.1-201ENST00000517765 369 ntTSL 4 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 LRRTM2-203ENST00000521094 1182 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 AC069120.1-201ENST00000521623 379 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 AC104027.1-201ENST00000521887 300 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 AC008147.1-201ENST00000551284 325 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 SETP7-201ENST00000552169 453 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 LINC00640-203ENST00000556479 576 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 AL352979.2-201ENST00000556988 366 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 AC009117.2-201ENST00000565374 504 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 BNIP3P38-201ENST00000601117 544 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 DUXAP4-201ENST00000603046 613 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 IGKV1OR2-6-201ENST00000603485 277 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 RASSF8-215ENST00000611440 852 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 AL110115.1-201ENST00000614396 364 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 AC002076.2-201ENST00000617362 122 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 FP475955.2-201ENST00000623720 458 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 AC127502.3-201ENST00000636170 1206 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 PEX3-201ENST00000367591 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 CR383658.2-201ENST00000547576 1525 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 NBEAL1-203ENST00000449802 10938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 CD2-201ENST00000369477 478 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 KLRC2-202ENST00000381902 1221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 RNU6-636P-201ENST00000384598 107 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 BX323014.1-201ENST00000412876 237 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 RPL7P30-201ENST00000420888 709 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 AL353678.1-201ENST00000422735 741 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 AL451127.1-201ENST00000422909 624 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 AC019178.2-201ENST00000423595 505 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 DUTP6-201ENST00000425573 462 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 MTATP6P4-201ENST00000427725 675 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 AL590233.1-201ENST00000430017 456 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 ATP5F1P1-201ENST00000433775 569 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 AC084290.1-201ENST00000434995 374 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 AL513412.1-201ENST00000445708 553 ntTSL 4 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 AC008264.1-201ENST00000447612 367 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 AC005297.2-201ENST00000450430 606 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 AC007557.1-201ENST00000451711 541 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 RPL21P134-201ENST00000453468 483 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 OR6K1P-201ENST00000456766 971 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 RPS3AP43-201ENST00000479743 781 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 LRRC70-203ENST00000491184 703 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 COX7A2P2-201ENST00000505291 250 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 AC022118.1-201ENST00000512352 547 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 AP000889.1-201ENST00000530968 660 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 SARNP-203ENST00000552080 726 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 AC023510.1-201ENST00000555862 490 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 AC022662.1-201ENST00000580252 331 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 AC011471.1-201ENST00000585766 187 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 AL670729.3-201ENST00000602345 574 ntTSL 4 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 AC004987.4-201ENST00000603383 338 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 BNIP3P11-201ENST00000603878 563 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 AC009220.3-201ENST00000604318 586 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 UBE2E2-207ENST00000628311 267 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 C6orf10-202ENST00000375015 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CLPPQ16740 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
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