Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FSCN1Q16658 RNU6-169P-201ENST00000365336 107 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FSCN1Q16658 SNORA70.4-201ENST00000365509 134 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FSCN1Q16658 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FSCN1Q16658 RNU6-356P-201ENST00000384140 107 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FSCN1Q16658 LIMS1-AS1-201ENST00000411710 477 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
FSCN1Q16658 LINC00301-202ENST00000412599 772 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
FSCN1Q16658 PSMA4-202ENST00000413382 1019 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
FSCN1Q16658 RPL30P16-201ENST00000419341 429 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FSCN1Q16658 AC138024.1-201ENST00000420867 699 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
FSCN1Q16658 GOT2P5-201ENST00000433995 546 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FSCN1Q16658 GPR143P-201ENST00000434155 205 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FSCN1Q16658 HMGB3P12-201ENST00000438745 556 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FSCN1Q16658 AC006011.1-201ENST00000442758 349 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FSCN1Q16658 AC092802.2-202ENST00000444665 371 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
FSCN1Q16658 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FSCN1Q16658 RPL7L1P8-201ENST00000469911 741 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FSCN1Q16658 RPL21P103-201ENST00000479921 488 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FSCN1Q16658 AC020893.1-201ENST00000502452 580 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FSCN1Q16658 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
FSCN1Q16658 AC108517.1-201ENST00000512546 327 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
FSCN1Q16658 RNU6-1281P-201ENST00000516223 105 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FSCN1Q16658 AC104393.1-201ENST00000517495 255 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
FSCN1Q16658 LLPHP1-201ENST00000603571 367 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FSCN1Q16658 Z84480.1-201ENST00000605131 311 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FSCN1Q16658 CERS6-AS1-209ENST00000609766 642 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
FSCN1Q16658 AC245517.5-201ENST00000611529 162 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FSCN1Q16658 AC005086.4-201ENST00000623065 213 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FSCN1Q16658 AL138713.1-201ENST00000624026 2130 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FSCN1Q16658 AC009161.2-201ENST00000624626 138 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FSCN1Q16658 AC012442.3-202ENST00000636742 206 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FSCN1Q16658 TCP11X1-203ENST00000623912 1715 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
FSCN1Q16658 CHD9-221ENST00000615216 10603 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
FSCN1Q16658 DOCK7-218ENST00000635123 6297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
FSCN1Q16658 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
FSCN1Q16658 AC138915.3-201ENST00000562908 1389 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FSCN1Q16658 ABCA8-215ENST00000615593 3264 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
FSCN1Q16658 GPX8-203ENST00000503787 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
FSCN1Q16658 MS4A1-202ENST00000389939 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
FSCN1Q16658 ARHGEF38-202ENST00000420470 5454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
FSCN1Q16658 RNF111-212ENST00000561186 4536 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
FSCN1Q16658 SERPINI2-201ENST00000264677 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
FSCN1Q16658 CR848007.1-201ENST00000442354 1699 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
FSCN1Q16658 TUG1-201ENST00000519077 5673 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
FSCN1Q16658 MFF-206ENST00000392059 1710 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
FSCN1Q16658 OR1S2-201ENST00000302592 978 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
FSCN1Q16658 Y_RNA.89-201ENST00000363031 102 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
FSCN1Q16658 ACEA_U3.1-201ENST00000363057 217 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
FSCN1Q16658 RNU6-877P-201ENST00000383868 107 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
FSCN1Q16658 MIR195-201ENST00000385194 87 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
FSCN1Q16658 AL590704.1-201ENST00000402856 794 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
FSCN1Q16658 AC005162.2-201ENST00000411479 578 ntTSL 4 BASIC4.61□□□□□ -1.67
FSCN1Q16658 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
FSCN1Q16658 AL161631.1-201ENST00000417933 486 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
FSCN1Q16658 AL353193.1-201ENST00000421444 268 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
FSCN1Q16658 AL162414.1-201ENST00000426204 744 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
FSCN1Q16658 AC004875.1-201ENST00000432702 378 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
FSCN1Q16658 TTTY20-201ENST00000434487 259 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
FSCN1Q16658 MTCO3P18-201ENST00000440206 761 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
FSCN1Q16658 RPS17P13-201ENST00000448974 407 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
FSCN1Q16658 AC096554.1-201ENST00000458182 529 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
FSCN1Q16658 CREM-230ENST00000474931 626 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
FSCN1Q16658 DEFB109F-201ENST00000491870 277 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
FSCN1Q16658 AC105343.1-201ENST00000505586 358 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
FSCN1Q16658 AC093297.2-204ENST00000508945 295 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
FSCN1Q16658 RNU6-1220P-201ENST00000517126 108 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
FSCN1Q16658 OR4R3P-201ENST00000525084 838 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
FSCN1Q16658 AL133271.1-201ENST00000538229 291 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
FSCN1Q16658 AP002993.1-201ENST00000538624 210 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
FSCN1Q16658 AC007513.1-201ENST00000548740 379 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
FSCN1Q16658 AL121579.1-201ENST00000555129 305 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
FSCN1Q16658 AC009145.3-201ENST00000567386 476 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
FSCN1Q16658 SLC25A36P1-201ENST00000590111 465 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
FSCN1Q16658 AC008739.3-201ENST00000603262 127 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
FSCN1Q16658 AC010680.4-201ENST00000605334 543 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
FSCN1Q16658 AP001330.5-201ENST00000607176 411 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
FSCN1Q16658 AC008536.2-201ENST00000607284 349 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
FSCN1Q16658 AL354798.1-201ENST00000622505 329 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
FSCN1Q16658 AL356585.4-201ENST00000623078 1229 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
FSCN1Q16658 AC019226.1-201ENST00000625666 515 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
FSCN1Q16658 AP5M1-201ENST00000261558 11737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
FSCN1Q16658 VEPH1-203ENST00000392833 3979 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
FSCN1Q16658 PANK1-203ENST00000342512 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
FSCN1Q16658 AGTR1-202ENST00000402260 2172 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
FSCN1Q16658 TMEM30A-202ENST00000370050 3775 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
FSCN1Q16658 PJA2-202ENST00000361557 4645 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
FSCN1Q16658 MAPK10-206ENST00000395161 4186 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
FSCN1Q16658 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
FSCN1Q16658 MTUS1-228ENST00000544260 3650 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
FSCN1Q16658 SLC10A2-201ENST00000245312 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
FSCN1Q16658 CNTN5-212ENST00000619298 5734 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
FSCN1Q16658 UGT2A3-201ENST00000251566 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
FSCN1Q16658 ARID2-205ENST00000444670 7316 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
FSCN1Q16658 LINC00630-205ENST00000440496 2101 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
FSCN1Q16658 LGI1-210ENST00000629035 2251 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
FSCN1Q16658 CDK14-201ENST00000265741 4953 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
FSCN1Q16658 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
FSCN1Q16658 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
FSCN1Q16658 TRAV23DV6-201ENST00000390451 409 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
FSCN1Q16658 PVALB-202ENST00000404171 422 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
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