Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 LINC00644-201ENST00000555156 295 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 PARP1P2-201ENST00000556806 195 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 ITFG1-AS1-202ENST00000565694 494 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 DSCR9-205ENST00000585273 751 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 AC011944.2-201ENST00000624440 683 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 AP000843.1-201ENST00000624880 701 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 U2.22-201ENST00000636441 106 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
GRIK5Q16478 LRRC37A-203ENST00000496930 3860 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
GRIK5Q16478 MUC17-201ENST00000306151 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
GRIK5Q16478 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
GRIK5Q16478 AL158163.1-201ENST00000603915 1649 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
GRIK5Q16478 PHACTR2-207ENST00000427704 9531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
GRIK5Q16478 RNMT-202ENST00000383314 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
GRIK5Q16478 SPINK5-202ENST00000359874 3656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
GRIK5Q16478 AC103740.1-201ENST00000558888 7427 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
GRIK5Q16478 MIA3-203ENST00000344922 8142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
GRIK5Q16478 FKTN-204ENST00000448551 1700 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
GRIK5Q16478 TM4SF1-202ENST00000472441 3115 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
GRIK5Q16478 IL7R-201ENST00000303115 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
GRIK5Q16478 LINC00862-201ENST00000367355 1417 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
GRIK5Q16478 FIGN-201ENST00000333129 9536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
GRIK5Q16478 HYKK-206ENST00000569878 4097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
GRIK5Q16478 EMSY-205ENST00000524767 4116 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
GRIK5Q16478 AC064875.1-201ENST00000425974 1942 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
GRIK5Q16478 CCDC91-201ENST00000381259 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
GRIK5Q16478 ETV1-208ENST00000420159 6231 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
GRIK5Q16478 ADCY10-201ENST00000367848 5055 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
GRIK5Q16478 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
GRIK5Q16478 SRGAP1-201ENST00000355086 23331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
GRIK5Q16478 CBX5-201ENST00000209875 11528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
GRIK5Q16478 CDC42BPA-204ENST00000366767 9320 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
GRIK5Q16478 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
GRIK5Q16478 OR56B2P-202ENST00000641377 2453 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
GRIK5Q16478 RPL34-AS1-202ENST00000507248 3713 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
GRIK5Q16478 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
GRIK5Q16478 RNU6ATAC5P-201ENST00000388104 126 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
GRIK5Q16478 RNU6-278P-201ENST00000390945 109 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
GRIK5Q16478 DSTNP4-201ENST00000399472 474 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
GRIK5Q16478 AL359643.1-201ENST00000404109 423 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
GRIK5Q16478 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
GRIK5Q16478 AL513365.2-201ENST00000423060 529 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
GRIK5Q16478 AC092162.1-201ENST00000432828 434 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
GRIK5Q16478 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
GRIK5Q16478 RPL7P52-201ENST00000449200 742 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
GRIK5Q16478 GSTA11P-201ENST00000452866 669 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
GRIK5Q16478 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
GRIK5Q16478 RNU6ATAC28P-201ENST00000459249 118 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
GRIK5Q16478 AC011276.1-201ENST00000469688 323 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
GRIK5Q16478 AC021382.1-201ENST00000483523 359 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
GRIK5Q16478 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
GRIK5Q16478 AP000859.1-201ENST00000525536 307 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
GRIK5Q16478 AF233439.1-201ENST00000526235 401 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
GRIK5Q16478 AC013799.1-201ENST00000531157 348 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
GRIK5Q16478 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
GRIK5Q16478 AP001972.3-202ENST00000603012 375 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
GRIK5Q16478 LINC00904-201ENST00000604453 471 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
GRIK5Q16478 AC012603.1-201ENST00000606424 528 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
GRIK5Q16478 RASSF8-215ENST00000611440 852 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
GRIK5Q16478 AP001486.3-201ENST00000615334 372 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
GRIK5Q16478 AC092608.2-201ENST00000624427 218 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
GRIK5Q16478 KIAA1524-208ENST00000625495 147 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
GRIK5Q16478 U3.53-201ENST00000628922 216 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
GRIK5Q16478 PLCXD3-201ENST00000328457 7538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
GRIK5Q16478 DPP8-203ENST00000341861 8699 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
GRIK5Q16478 DSC2-202ENST00000280904 12325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
GRIK5Q16478 GABRA2-206ENST00000507460 5812 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
GRIK5Q16478 PEX5L-202ENST00000392649 8540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
GRIK5Q16478 NOSTRIN-206ENST00000444448 2537 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
GRIK5Q16478 DNAH8-201ENST00000327475 14360 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
GRIK5Q16478 SCFD1-207ENST00000544052 2058 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
GRIK5Q16478 CDC14A-206ENST00000635056 2056 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
GRIK5Q16478 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
GRIK5Q16478 STIL-204ENST00000396221 4558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
GRIK5Q16478 EXO1-208ENST00000518483 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
GRIK5Q16478 AC133552.1-201ENST00000569988 4007 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
GRIK5Q16478 PTPRZ1-201ENST00000393386 8175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
GRIK5Q16478 MUC12-206ENST00000536621 16321 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
GRIK5Q16478 LINGO2-201ENST00000308675 3031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
GRIK5Q16478 DSCR8-201ENST00000357704 552 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
GRIK5Q16478 RNA5SP258-201ENST00000362750 119 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
GRIK5Q16478 RNU1-35P-201ENST00000362782 153 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
GRIK5Q16478 RNU6-490P-201ENST00000362985 107 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
GRIK5Q16478 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
GRIK5Q16478 DSCR8-202ENST00000400477 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
GRIK5Q16478 CCDC126-203ENST00000410069 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
GRIK5Q16478 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
GRIK5Q16478 AL109947.1-201ENST00000423747 382 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
GRIK5Q16478 RAC1P6-201ENST00000423911 575 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
GRIK5Q16478 RPL7P28-201ENST00000437739 740 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
GRIK5Q16478 RPL23AP89-201ENST00000439324 255 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
GRIK5Q16478 FHP1-201ENST00000442741 703 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
GRIK5Q16478 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
GRIK5Q16478 AC073073.1-201ENST00000493920 463 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
GRIK5Q16478 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
GRIK5Q16478 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
GRIK5Q16478 AC135001.1-201ENST00000544546 283 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
GRIK5Q16478 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
GRIK5Q16478 AL354984.3-201ENST00000604803 325 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.2 ms