Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 AKAP14-201ENST00000334356 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 C1orf146-201ENST00000370373 871 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 FAM107B-204ENST00000378465 1052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 SUGT1P1-201ENST00000379514 476 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 AC062039.1-201ENST00000414394 565 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 BX664727.1-201ENST00000416024 466 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 NDUFB4P7-201ENST00000423198 363 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 AC019178.2-201ENST00000423595 505 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 Z93242.1-201ENST00000427102 353 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 BLOC1S2P1-201ENST00000428431 301 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 OR4K11P-201ENST00000431829 904 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 LINC01052-201ENST00000437777 496 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 AL109741.2-201ENST00000455561 343 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 PDCD10-207ENST00000471885 764 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 AC147055.4-201ENST00000504399 745 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 AC096577.1-203ENST00000506386 541 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 AC121161.1-201ENST00000510606 652 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC2.37□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 IL18-204ENST00000528832 795 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 AC118942.1-202ENST00000529081 578 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 OOSP2-203ENST00000532905 496 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 AC006518.2-201ENST00000542513 940 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 AC078962.4-201ENST00000546135 254 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 AC004943.1-202ENST00000558618 503 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 MIR3944-201ENST00000581277 108 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 ZFP30-209ENST00000589018 444 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 AP001542.2-201ENST00000593141 364 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 RPAP2P1-201ENST00000603626 1168 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 AL121904.1-201ENST00000611894 948 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 MIR8084-201ENST00000614105 89 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 OR8K3-202ENST00000623845 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.37□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 C8orf89-203ENST00000625134 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 CRYM-AS1-204ENST00000637983 556 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 AC009975.2-201ENST00000635306 1429 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 RNU6-657P-201ENST00000383904 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 U6.112-201ENST00000384129 70 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 RNA5SP171-201ENST00000391071 115 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 MTND4P13-201ENST00000402078 1023 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 AL356131.1-201ENST00000405826 414 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 SPA17P1-201ENST00000416656 452 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 CCDC58P2-201ENST00000417131 366 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 THAP5P1-201ENST00000439089 262 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 AC092393.1-201ENST00000439625 742 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 RPL26P6-201ENST00000440913 438 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 VN1R10P-201ENST00000447106 875 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 SEPT14P24-201ENST00000447236 180 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 AL500527.1-201ENST00000448532 255 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 AC098820.1-201ENST00000453157 512 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 AC092757.1-201ENST00000467293 467 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 AC117440.1-201ENST00000474107 571 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 RPS17P11-201ENST00000474297 293 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 AC008885.1-201ENST00000514930 301 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 KLRF1-203ENST00000537723 598 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 LINC02562-201ENST00000561705 785 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 AC079148.1-201ENST00000565944 819 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 AC007333.2-201ENST00000569998 559 ntTSL 4 BASIC2.36□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 AC116003.2-201ENST00000579278 748 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 AC083760.1-201ENST00000589621 670 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 DUXAP11-201ENST00000603858 526 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 BNIP3P11-201ENST00000603878 563 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 AL035411.2-201ENST00000604022 421 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 AC007563.2-202ENST00000607591 394 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 AC009039.2-201ENST00000624524 529 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 AP003399.1-201ENST00000637534 361 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 SCFD1-207ENST00000544052 2058 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 P2RY12-201ENST00000302632 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 AL022578.1-201ENST00000439330 1433 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TNXAQ16473 AC005832.2-201ENST00000538921 1430 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129 ms