Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 LINC00971-202ENST00000484892 7308 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
VPS72Q15906 CD80-201ENST00000264246 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
VPS72Q15906 OR5T2-201ENST00000313264 1248 ntAPPRIS P2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
VPS72Q15906 C8orf59-201ENST00000321777 325 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
VPS72Q15906 MIR181A1-201ENST00000385026 110 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
VPS72Q15906 MIR708-201ENST00000390708 88 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
VPS72Q15906 SNORA40.3-201ENST00000390964 122 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
VPS72Q15906 SNORD115-47-201ENST00000391226 86 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
VPS72Q15906 ARF4P3-201ENST00000397387 509 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
VPS72Q15906 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
VPS72Q15906 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
VPS72Q15906 HMGB1P11-201ENST00000413899 637 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
VPS72Q15906 RPS23P10-201ENST00000416185 486 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
VPS72Q15906 AIMP1P1-201ENST00000418670 937 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
VPS72Q15906 GLRXP1-201ENST00000423261 334 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
VPS72Q15906 AL356124.2-201ENST00000442449 391 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
VPS72Q15906 RPL26P28-201ENST00000451325 435 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
VPS72Q15906 AC087312.1-201ENST00000471411 480 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
VPS72Q15906 FAM172BP-201ENST00000487497 1089 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
VPS72Q15906 RPL7P24-201ENST00000493052 752 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
VPS72Q15906 AC022483.1-201ENST00000514020 567 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
VPS72Q15906 AC124947.2-202ENST00000552735 133 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
VPS72Q15906 LINC02311-202ENST00000556819 477 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
VPS72Q15906 AL133457.1-201ENST00000564251 987 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
VPS72Q15906 AC015908.2-202ENST00000585243 756 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
VPS72Q15906 AC010928.1-202ENST00000589354 473 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
VPS72Q15906 RNASEH2B-AS1-202ENST00000593369 648 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
VPS72Q15906 AP000860.1-201ENST00000605250 559 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
VPS72Q15906 AC006329.2-201ENST00000611491 394 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
VPS72Q15906 AC025253.1-201ENST00000613623 543 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
VPS72Q15906 AC243585.2-201ENST00000619099 508 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
VPS72Q15906 P2RY12-201ENST00000302632 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
VPS72Q15906 DLX6-AS1-201ENST00000430027 15364 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
VPS72Q15906 CNTRL-201ENST00000238341 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
VPS72Q15906 MFSD8-236ENST00000641509 4050 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
VPS72Q15906 LINC01733-201ENST00000449316 4604 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
VPS72Q15906 NUP205-201ENST00000285968 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
VPS72Q15906 GAB1-203ENST00000505913 2477 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
VPS72Q15906 NUP58P1-201ENST00000502546 1738 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
VPS72Q15906 SPEF2-216ENST00000637569 7350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
VPS72Q15906 OR9H1P-201ENST00000446393 4888 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
VPS72Q15906 TTTY13-201ENST00000330337 659 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
VPS72Q15906 RNU1-15P-201ENST00000353977 144 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
VPS72Q15906 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
VPS72Q15906 RNU5E-5P-201ENST00000365379 116 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
VPS72Q15906 U3.19-201ENST00000390893 196 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
VPS72Q15906 AL450338.1-201ENST00000407987 512 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
VPS72Q15906 RNU6-248P-201ENST00000410720 107 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
VPS72Q15906 RPS27AP14-201ENST00000422868 454 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
VPS72Q15906 AL953862.1-201ENST00000423016 168 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
VPS72Q15906 RPS6P12-201ENST00000432491 726 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
VPS72Q15906 AC025428.1-201ENST00000444137 403 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
VPS72Q15906 RPS3AP17-201ENST00000472594 777 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
VPS72Q15906 PHBP14-201ENST00000512887 367 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
VPS72Q15906 AC110296.1-201ENST00000515680 341 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
VPS72Q15906 RNU6-528P-201ENST00000516926 100 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
VPS72Q15906 AC090857.2-201ENST00000526362 723 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
VPS72Q15906 AP000462.2-203ENST00000540545 715 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
VPS72Q15906 AL121579.1-201ENST00000555129 305 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
VPS72Q15906 LARP7P3-201ENST00000579888 337 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
VPS72Q15906 AC005304.3-201ENST00000581533 511 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
VPS72Q15906 AC091304.9-201ENST00000612091 226 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
VPS72Q15906 AC138649.3-201ENST00000622154 254 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
VPS72Q15906 AC231657.1-201ENST00000624313 397 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
VPS72Q15906 AC006148.1-201ENST00000484322 4310 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
VPS72Q15906 EEF1A1P42-201ENST00000613436 1331 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
VPS72Q15906 SYT16-205ENST00000568344 13978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
VPS72Q15906 RBM39-201ENST00000253363 2488 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
VPS72Q15906 ARF4-206ENST00000489843 1360 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
VPS72Q15906 KANSL1L-209ENST00000457374 2264 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
VPS72Q15906 ATP13A3-211ENST00000619199 5227 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
VPS72Q15906 OR2H1-203ENST00000377136 3024 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
VPS72Q15906 ADGRL2-204ENST00000370715 5585 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
VPS72Q15906 AP5M1-201ENST00000261558 11737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
VPS72Q15906 PKIB-201ENST00000258014 1595 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
VPS72Q15906 RNU6-462P-201ENST00000362659 105 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
VPS72Q15906 MAPK8-202ENST00000374174 739 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
VPS72Q15906 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
VPS72Q15906 C9orf92-201ENST00000380683 359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
VPS72Q15906 RNU6-730P-201ENST00000383954 104 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
VPS72Q15906 RNU6-878P-201ENST00000384578 110 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
VPS72Q15906 SNORD96B-201ENST00000386148 79 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
VPS72Q15906 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
VPS72Q15906 BCL2L15-203ENST00000393320 276 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
VPS72Q15906 AC003985.1-201ENST00000414127 362 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
VPS72Q15906 USP9YP13-201ENST00000417797 480 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
VPS72Q15906 AC012065.2-201ENST00000421295 375 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
VPS72Q15906 TEX41-204ENST00000423031 491 ntTSL 4 BASIC4.93□□□□□ -1.62
VPS72Q15906 ZNF863P-201ENST00000426746 417 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
VPS72Q15906 LINC00189-202ENST00000431661 308 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
VPS72Q15906 AC005019.2-201ENST00000434321 359 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
VPS72Q15906 AC004485.1-201ENST00000439839 527 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
VPS72Q15906 AL078581.2-201ENST00000446392 378 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
VPS72Q15906 AC096666.1-201ENST00000454965 348 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
VPS72Q15906 LARP1BP2-201ENST00000486594 519 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
VPS72Q15906 STMN1P2-201ENST00000508435 439 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
VPS72Q15906 RNU6-583P-201ENST00000516012 92 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
VPS72Q15906 AC009446.1-202ENST00000521131 473 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
VPS72Q15906 AC104316.1-201ENST00000521258 625 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
VPS72Q15906 DEFB131D-201ENST00000526803 184 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.7 ms