Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 SNORA62.3-201ENST00000365110 153 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 CUBN-201ENST00000377823 705 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 RNU6-1242P-201ENST00000391052 103 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 CYCSP19-201ENST00000411715 316 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 AC013410.2-201ENST00000422627 201 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 NANOGP5-201ENST00000424456 877 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 AL353148.1-204ENST00000426752 477 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 MTCYBP45-201ENST00000435243 565 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 MTCO2P25-201ENST00000447065 681 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 AC034195.1-202ENST00000451031 610 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 AL353691.1-201ENST00000451332 387 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 LINC01075-201ENST00000455977 370 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 RPL23AP31-201ENST00000456160 467 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 AC108751.4-201ENST00000462931 1001 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 AC109925.1-201ENST00000478069 331 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 LINC02469-201ENST00000506460 741 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 ADGRL3-AS1-204ENST00000509461 481 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 XKRY-201ENST00000510392 1100 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 AC006499.2-201ENST00000513470 337 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 AC023632.4-201ENST00000517783 191 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 FAM60DP-201ENST00000524174 632 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 KLRC2-204ENST00000536833 771 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 AF111169.4-202ENST00000553507 262 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 AC106785.1-201ENST00000565935 262 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 AC009704.1-201ENST00000583702 331 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 SNORD84-203ENST00000584275 78 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 MIR3922-201ENST00000585192 84 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 MIR7515HG-213ENST00000585872 758 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 AP001269.3-201ENST00000588718 329 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 BNIP3P11-201ENST00000603878 563 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 AC080013.4-201ENST00000607624 649 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 AC034229.5-201ENST00000624258 185 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 AL034408.1-202ENST00000636088 415 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 OR5H6-202ENST00000641416 1032 ntAPPRIS P1 BASIC2.71□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.71□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC2.71□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 ZNF682-207ENST00000595736 1710 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 MUC15-201ENST00000281268 2968 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 OR4G11P-202ENST00000642116 1414 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 NPVF-201ENST00000222674 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 RNA5SP50-201ENST00000363731 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.192-201ENST00000363977 102 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 RNU1-33P-201ENST00000364249 162 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 RNU4-68P-201ENST00000364314 141 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 MIR200C-201ENST00000384980 68 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 RPS3AP26-201ENST00000398259 784 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 MTND4P13-201ENST00000402078 1023 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 AC007463.1-201ENST00000416534 734 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 AL513175.2-201ENST00000422071 443 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 AC092648.1-201ENST00000425870 423 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 LINC01052-201ENST00000437777 496 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 AL645638.1-201ENST00000440519 361 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 MRPL50P4-201ENST00000446432 475 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 MAST4-AS1-201ENST00000451496 777 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 OFD1P7Y-201ENST00000454643 1155 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 AC117440.1-201ENST00000474107 571 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 LRRC70-203ENST00000491184 703 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 AC114981.1-201ENST00000503897 678 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 AC105914.1-201ENST00000511798 226 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 AC108467.1-201ENST00000515623 672 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 SCARNA13-201ENST00000516672 275 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 RNU1-45P-201ENST00000517191 141 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 IGKV3OR22-2-201ENST00000517943 313 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 AF279873.4-202ENST00000521714 511 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 CCDC7-207ENST00000535327 700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 AC063948.1-201ENST00000547360 379 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 CR383656.7-201ENST00000548164 174 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 AL355836.1-201ENST00000555951 870 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 NCAPGP2-201ENST00000557911 754 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 AC066613.1-202ENST00000560727 630 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 AC009117.2-201ENST00000565374 504 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 AC009271.1-202ENST00000588803 492 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 VN1R78P-201ENST00000597393 564 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 DUXAP3-201ENST00000603616 594 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 AC024933.1-201ENST00000608472 348 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 AC018692.3-201ENST00000623929 123 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 AC090897.3-201ENST00000636973 1157 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 PEX3-201ENST00000367591 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 AC097714.1-201ENST00000511272 1647 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 AC025750.1-201ENST00000399891 379 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 HMGB1P17-201ENST00000403495 628 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
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