Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 AC078889.1-201ENST00000536412 523 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
SS18Q15532 LINC02384-206ENST00000541707 904 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
SS18Q15532 EEF1B2P4-201ENST00000551398 348 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SS18Q15532 LINC02410-201ENST00000553095 393 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
SS18Q15532 GTF2IP8-201ENST00000560687 584 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SS18Q15532 SULT1C2P1-202ENST00000562418 459 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SS18Q15532 LIVAR-201ENST00000578633 384 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
SS18Q15532 AP005433.1-202ENST00000580845 521 ntTSL 4 BASIC1.88□□□□□ -2.11
SS18Q15532 AC124312.4-201ENST00000605533 310 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SS18Q15532 THOC1-220ENST00000621904 1083 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
SS18Q15532 AC093875.1-201ENST00000623688 504 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SS18Q15532 OR51F1-202ENST00000624103 939 ntAPPRIS ALT1 BASIC1.88□□□□□ -2.11
SS18Q15532 CNBD1-202ENST00000518476 1594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
SS18Q15532 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
SS18Q15532 OR5H2-201ENST00000355273 945 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SS18Q15532 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
SS18Q15532 HTN3-201ENST00000381057 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
SS18Q15532 U3.29-201ENST00000391296 212 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SS18Q15532 CYCSP45-201ENST00000402289 315 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SS18Q15532 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SS18Q15532 FAT1P1-201ENST00000406588 507 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SS18Q15532 RNU6-575P-201ENST00000411326 105 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SS18Q15532 RPS27L-202ENST00000411926 528 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
SS18Q15532 AC007463.1-201ENST00000416534 734 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
SS18Q15532 LINC01040-201ENST00000425048 666 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
SS18Q15532 AL158840.1-202ENST00000425754 694 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
SS18Q15532 AP001599.1-201ENST00000426771 361 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
SS18Q15532 AL691515.1-201ENST00000432976 733 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
SS18Q15532 AC129850.1-201ENST00000436203 508 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SS18Q15532 AC019330.1-202ENST00000440609 504 ntTSL 4 BASIC1.87□□□□□ -2.11
SS18Q15532 AL671855.1-201ENST00000446875 1203 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SS18Q15532 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
SS18Q15532 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SS18Q15532 MGAT4A-209ENST00000495056 683 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
SS18Q15532 AC069439.2-201ENST00000496403 789 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
SS18Q15532 AC093523.1-201ENST00000503268 499 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
SS18Q15532 AC091860.1-201ENST00000505723 432 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SS18Q15532 MLLT10P2-201ENST00000506434 249 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SS18Q15532 RPL37P25-201ENST00000507308 276 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SS18Q15532 AC015468.3-201ENST00000518967 417 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
SS18Q15532 AC078962.4-201ENST00000546135 254 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
SS18Q15532 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
SS18Q15532 AC093510.2-201ENST00000562820 896 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SS18Q15532 AC009163.5-201ENST00000575421 637 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SS18Q15532 MIR4666A-201ENST00000580160 79 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
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SS18Q15532 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
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SS18Q15532 YPEL5P2-201ENST00000605553 359 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SS18Q15532 AP005229.2-201ENST00000609980 697 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SS18Q15532 BX664608.1-201ENST00000610519 487 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SS18Q15532 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SS18Q15532 CR381653.2-201ENST00000624041 768 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SS18Q15532 C8orf89-203ENST00000625134 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
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SS18Q15532 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
SS18Q15532 TUBD1-214ENST00000592426 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
SS18Q15532 GDI2P1-201ENST00000429312 1336 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SS18Q15532 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SS18Q15532 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
SS18Q15532 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
SS18Q15532 APOH-201ENST00000205948 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
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SS18Q15532 KCNQ5-IT1-201ENST00000445310 563 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SS18Q15532 MRPL50P4-201ENST00000446432 475 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SS18Q15532 TEX41-209ENST00000451478 452 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SS18Q15532 RPL23AP31-201ENST00000456160 467 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SS18Q15532 AP000852.1-201ENST00000472460 573 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SS18Q15532 AC073359.1-201ENST00000486545 521 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SS18Q15532 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SS18Q15532 LINC01997-201ENST00000494900 429 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
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SS18Q15532 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SS18Q15532 RNU6-334P-201ENST00000517072 102 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SS18Q15532 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SS18Q15532 C8orf22-204ENST00000522267 739 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SS18Q15532 AP001317.1-201ENST00000531194 960 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SS18Q15532 PDZD9-203ENST00000537222 1068 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SS18Q15532 AL355836.1-201ENST00000555951 870 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SS18Q15532 LINC02328-203ENST00000557195 682 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
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