Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 AC104850.1-201ENST00000435940 476 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 LINC01423-202ENST00000436845 423 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 SNRPEP8-201ENST00000442866 260 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 AL136380.1-201ENST00000447970 162 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 AL603839.1-201ENST00000453437 432 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 AL589765.1-201ENST00000457548 386 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 AP001992.1-205ENST00000462248 379 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 AC113167.1-201ENST00000512941 570 ntTSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 RNU6-358P-201ENST00000516564 75 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 Y_RNA.704-201ENST00000516851 102 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 RNU6-352P-201ENST00000516908 107 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 AP001999.2-201ENST00000529417 389 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 PTP4A1P6-201ENST00000531034 478 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 AC092470.1-201ENST00000546187 132 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 CYCSP30-201ENST00000546447 172 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 AC123904.2-201ENST00000548059 300 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 AC004943.1-202ENST00000558618 503 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 HSPE1P5-201ENST00000561489 272 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 AC015818.4-201ENST00000580931 353 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 LINC01905-202ENST00000588139 459 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 AC115621.1-201ENST00000604653 858 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 AC121334.2-201ENST00000605387 271 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 AC128687.2-201ENST00000609657 566 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 EFCAB5-213ENST00000638539 168 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 UGT2A3-201ENST00000251566 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 UTP20-201ENST00000261637 9025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 CENPI-202ENST00000372927 3262 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 ZNF99-202ENST00000596209 7817 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 Z73965.1-201ENST00000623412 2297 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 CAPS2-206ENST00000409799 1859 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 ETV1-202ENST00000399357 6096 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 DAZ4-206ENST00000449750 3271 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 KIFAP3-202ENST00000367765 4111 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 ANKRD36C-202ENST00000456556 5428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 XKR3-201ENST00000331428 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 KYNU-201ENST00000264170 15316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 PMCH-201ENST00000329406 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 OR8D1-201ENST00000357821 1026 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 Y_RNA.89-201ENST00000363031 102 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 RNA5SP97-201ENST00000365006 84 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 RHOT1P2-201ENST00000366423 333 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 Y_RNA.481-201ENST00000384373 102 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 MIR93-201ENST00000385024 80 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 MIR708-201ENST00000390708 88 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 RPL32P23-201ENST00000397237 405 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 AL133343.3-201ENST00000413983 469 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 HMGB3P20-201ENST00000417997 600 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 DIAPH3-AS1-201ENST00000422052 428 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 ARPP21-211ENST00000427542 568 ntTSL 4 BASIC4.68□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 AC112518.1-201ENST00000436089 575 ntTSL 4 BASIC4.68□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 LINC00302-201ENST00000444515 302 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 RANP8-201ENST00000444720 713 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 RPL23AP20-201ENST00000447965 421 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 LINC01753-201ENST00000458145 631 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 CREM-230ENST00000474931 626 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 AC023194.1-201ENST00000493084 308 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 RN7SL323P-201ENST00000494712 295 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 SNORA20.3-201ENST00000516880 132 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 RNU4ATAC10P-201ENST00000516967 122 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 AP003469.3-201ENST00000518090 473 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 MTND1P35-201ENST00000526739 508 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 AP002989.1-201ENST00000533459 562 ntTSL 4 BASIC4.68□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 AC010183.2-202ENST00000546791 382 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 AL445363.2-202ENST00000555361 435 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 MEG8-218ENST00000556720 456 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 MIR5685-201ENST00000579080 79 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 AC037487.2-201ENST00000581796 537 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 AL391646.1-201ENST00000603860 190 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 AC063943.3-201ENST00000615562 356 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 AC104985.2-201ENST00000620598 500 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 AP006248.2-201ENST00000623309 592 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 CCT7-217ENST00000626868 249 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 TNNI3K-201ENST00000326637 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 CYP3A7-CYP3A51P-201ENST00000611620 1608 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 AC018529.3-201ENST00000624212 2254 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 AC138915.3-201ENST00000562908 1389 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 AL356489.2-201ENST00000566968 3528 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 RFX7-201ENST00000559447 10426 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 C1D-201ENST00000355848 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 OR5AK2-201ENST00000326855 996 ntAPPRIS P1 BASIC4.67□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 RNU6-282P-201ENST00000365357 103 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 MT-TL1-201ENST00000386347 75 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 SNORA3.3-201ENST00000408712 125 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 RPS15AP40-201ENST00000419621 391 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 AL138799.2-201ENST00000439024 343 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 LINC01317-202ENST00000442026 677 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 RPS17P13-201ENST00000448974 407 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 MAMDC2-AS1-205ENST00000451488 317 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 AC069549.1-201ENST00000451584 499 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 AC020651.1-201ENST00000490324 360 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 AC098799.2-201ENST00000509466 868 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 AC114781.4-201ENST00000513707 639 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 AC093853.1-201ENST00000515689 483 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 SCARNA14-201ENST00000516903 136 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 AC090615.1-201ENST00000577519 154 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 MIR3118-1-201ENST00000581787 76 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.8 ms