Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 FGF1-214ENST00000612258 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 AL137067.2-201ENST00000621202 131 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 AC018628.1-201ENST00000624147 3819 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 AC000095.2-202ENST00000637415 154 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 AL596275.2-206ENST00000641957 626 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 SCN1A-203ENST00000409050 5946 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 LINC00240-204ENST00000607607 5607 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 MYBPC1-214ENST00000549145 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 NOSTRIN-201ENST00000317647 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 ZFP62-201ENST00000502412 3415 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 NTRK3-205ENST00000394480 19984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 ZNF322-205ENST00000471278 2675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 ZNF432-202ENST00000594154 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 CFAP57-204ENST00000528956 3037 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 AC010186.3-201ENST00000537616 2508 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 ZNF480-205ENST00000595962 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 PDCD1LG2-201ENST00000397747 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 TRAPPC13-201ENST00000231526 2715 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 NRCAM-210ENST00000425651 3915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 DHX32-201ENST00000284690 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 NPHP1-204ENST00000417665 2246 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 LINC02141-201ENST00000568279 6586 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 AL079305.1-201ENST00000623159 3008 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 AL355834.1-201ENST00000556602 3965 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 AF127577.6-201ENST00000623352 2191 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 RN7SKP257-201ENST00000364525 309 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 C9orf92-201ENST00000380683 359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 C2orf73-203ENST00000405749 576 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 MIR1266-201ENST00000408125 84 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 RNU6-554P-201ENST00000410466 106 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 TBCAP2-201ENST00000416175 326 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 LINC00276-201ENST00000417751 596 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 RPL7AP14-201ENST00000424041 802 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 RPL7L1P9-201ENST00000431298 745 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 RPS20P1-201ENST00000434853 354 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 GAPDHP37-201ENST00000442317 968 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 AC114752.1-201ENST00000448204 289 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 LINC01072-201ENST00000455848 431 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 AL136126.1-201ENST00000473603 402 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 AC083795.1-201ENST00000491760 320 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 DUTP1-201ENST00000493631 470 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 SNRPCP2-201ENST00000504370 475 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 AC109464.3-201ENST00000509456 204 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 AC010343.2-201ENST00000510162 224 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 AP002989.1-201ENST00000533459 562 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 AP3S2-214ENST00000560940 519 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 AP005380.1-201ENST00000584896 547 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 AC036176.3-201ENST00000602456 418 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 IGKV2OR2-7D-201ENST00000603664 304 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 AL499605.1-201ENST00000604628 403 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 IGKV2OR2-7-201ENST00000604652 304 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 AL589743.6-201ENST00000611025 117 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 MIR6883-201ENST00000614952 78 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 MVP-219ENST00000629059 120 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 BCORP1-202ENST00000441139 3461 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 HHLA2-209ENST00000489514 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 LEPR-208ENST00000616738 5081 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 AP002512.4-202ENST00000641599 4530 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 HIPK1-204ENST00000369555 3966 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 RFX3-204ENST00000382004 9307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 ERAP2-202ENST00000437043 5705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 PLCH1-202ENST00000340059 6168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 ZNF850-202ENST00000591344 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 CLIP4-202ENST00000401605 2322 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 R3HDM1-202ENST00000409478 4272 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 GNS-202ENST00000418919 4877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 LINC01677-205ENST00000635636 2362 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 ZNF112-202ENST00000354340 3654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 LZTFL1-215ENST00000536047 4342 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 ERP27-201ENST00000266397 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 ZFYVE16-206ENST00000510158 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 RNA5SP85-201ENST00000365378 119 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 RNU6-788P-201ENST00000390967 104 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 HSPE1P8-201ENST00000406997 288 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 AL033519.1-201ENST00000407266 307 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 MIR1255A-201ENST00000408338 113 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
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