Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 AC110751.1-201ENST00000511916 462 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 LINC02315-201ENST00000515218 696 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 RNU6-1129P-201ENST00000515964 104 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 RNU6-1073P-201ENST00000517182 106 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 IGKV2-26-201ENST00000518305 343 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 AC024958.1-201ENST00000519364 902 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 AC090539.1-201ENST00000523907 434 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 MS4A4E-206ENST00000528394 555 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 AC078962.4-201ENST00000546135 254 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 GLIPR1L1-204ENST00000548623 484 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 CYCSP2-201ENST00000558168 301 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 AC009117.2-201ENST00000565374 504 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 AL512347.1-201ENST00000566420 503 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 AC093515.1-201ENST00000567103 445 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 AC099793.1-201ENST00000567538 285 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 AC025272.1-201ENST00000569661 483 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 RPL23AP92-201ENST00000603609 255 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 AC011468.4-201ENST00000603942 409 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 AC025588.3-201ENST00000604182 274 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 AC006023.2-201ENST00000609916 167 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 AC243773.3-201ENST00000613270 256 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 PDCD6IPP1-201ENST00000615124 579 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 KLRF1-207ENST00000617793 1096 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 AC073968.1-201ENST00000618594 637 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 ATXN3L-202ENST00000622204 837 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 AC097520.1-201ENST00000624435 385 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 AC017037.3-201ENST00000625016 472 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 AC116096.1-201ENST00000566804 2314 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 AL079343.1-201ENST00000572358 1771 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 NUP58P1-201ENST00000502546 1738 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 TRAPPC13-208ENST00000505553 1410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 DDX43P2-201ENST00000604753 1354 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 Y_RNA.493-201ENST00000384422 102 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 RNU6-837P-201ENST00000391056 108 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 SNRPEP2-201ENST00000397592 279 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 SLC9B1P2-201ENST00000398120 1184 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 AL031121.1-201ENST00000406553 254 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 RNA5SP229-201ENST00000410809 99 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 PIGPP2-201ENST00000411569 458 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 HSFY4P-201ENST00000415994 1181 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 TRBV24OR9-2-201ENST00000416632 435 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 AL161909.2-201ENST00000417577 409 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 AC012065.2-201ENST00000421295 375 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 AC013402.2-201ENST00000424257 437 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 AL590103.1-201ENST00000434488 307 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 MTND4P6-201ENST00000438297 472 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 HSPE1P28-201ENST00000443139 211 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 LINC01004-201ENST00000445184 686 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 AL589935.1-212ENST00000450998 525 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 AC073486.1-201ENST00000453278 531 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 AL445669.2-201ENST00000454425 421 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 DCLRE1CP1-201ENST00000454630 470 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 AL160287.1-201ENST00000455612 432 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 AC068587.2-201ENST00000478386 781 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 RPS29P2-201ENST00000479278 136 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 TMEM251P1-201ENST00000503717 318 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 AC147055.4-201ENST00000504399 745 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 LINC00492-201ENST00000504436 593 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 FCF1P8-201ENST00000510322 597 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 AC131956.2-201ENST00000510922 512 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 GMPSP1-201ENST00000514075 579 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 AP002428.1-201ENST00000527345 380 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 AP003385.6-201ENST00000531603 374 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 OOSP2-203ENST00000532905 496 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 LINC01405-202ENST00000547607 674 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 AC011611.4-201ENST00000547721 779 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 ZNF321P-202ENST00000550843 495 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 AL160191.1-202ENST00000554008 576 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 AL355102.1-201ENST00000555383 460 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 NR2F2-AS1-208ENST00000560395 441 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 AC002400.1-201ENST00000569310 726 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 AC034268.2-201ENST00000571784 482 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 AC015911.6-201ENST00000588445 457 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 AL669831.4-202ENST00000590817 238 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 AF131215.7-201ENST00000602443 707 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 AL683887.1-201ENST00000603401 287 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 AC025588.4-201ENST00000615802 908 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 Z99129.2-201ENST00000619967 314 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 AC007490.1-201ENST00000624321 703 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 PMS1-215ENST00000447232 2576 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 SPZ1-201ENST00000296739 1868 ntAPPRIS P2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 SYT14-204ENST00000472886 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 OR6C1-202ENST00000642104 2055 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 LRRC49-222ENST00000560158 1898 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 API5P2-201ENST00000397055 1498 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 OR6C75-201ENST00000343399 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 OR5H2-201ENST00000355273 945 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 RNU6-989P-201ENST00000362756 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 NFIB-202ENST00000380924 840 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 TRAJ17-201ENST00000390520 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 RPL31P1-201ENST00000398116 372 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 RPL5P18-201ENST00000406671 891 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
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