Protein–RNA interactions for Protein: Q14721

KCNB1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNB1Q14721 USP9YP34-201ENST00000453983 808 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
KCNB1Q14721 Z82190.1-201ENST00000454534 490 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
KCNB1Q14721 AL844175.1-201ENST00000455153 323 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
KCNB1Q14721 RPS20P32-201ENST00000456044 356 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
KCNB1Q14721 MTCO1P42-201ENST00000457379 726 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
KCNB1Q14721 SNORA84-201ENST00000459229 133 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
KCNB1Q14721 snoU109.1-201ENST00000459339 135 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
KCNB1Q14721 FAM172BP-201ENST00000487497 1089 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
KCNB1Q14721 RPL21P129-201ENST00000491732 478 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
KCNB1Q14721 RPL9P6-201ENST00000492764 598 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
KCNB1Q14721 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
KCNB1Q14721 AC116616.1-201ENST00000508815 366 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
KCNB1Q14721 NDUFB4P2-201ENST00000509515 391 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
KCNB1Q14721 AC091133.4-201ENST00000511142 308 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
KCNB1Q14721 AC108727.1-201ENST00000513802 393 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
KCNB1Q14721 AC016065.2-201ENST00000514530 444 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
KCNB1Q14721 RNA5SP208-201ENST00000516156 78 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
KCNB1Q14721 RNA5SP309-201ENST00000516670 106 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
KCNB1Q14721 RNU6-430P-201ENST00000517078 107 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
KCNB1Q14721 AP003781.1-201ENST00000543403 404 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
KCNB1Q14721 UTS2-201ENST00000054668 420 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
KCNB1Q14721 AC009269.4-201ENST00000557828 440 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
KCNB1Q14721 AC007342.4-202ENST00000565189 721 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
KCNB1Q14721 AC044840.1-201ENST00000577641 472 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
KCNB1Q14721 ZNF28-207ENST00000594602 684 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
KCNB1Q14721 AC244505.7-201ENST00000599675 272 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
KCNB1Q14721 SNORA62.6-201ENST00000606322 83 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
KCNB1Q14721 AF250324.2-201ENST00000608299 610 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
KCNB1Q14721 LINC00649-214ENST00000609132 668 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
KCNB1Q14721 AP001506.1-201ENST00000615444 211 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
KCNB1Q14721 AC108479.2-201ENST00000617314 601 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
KCNB1Q14721 AC022306.2-201ENST00000617563 647 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
KCNB1Q14721 C2orf73-202ENST00000398634 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
KCNB1Q14721 SLC2A2-201ENST00000314251 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
KCNB1Q14721 NUP35-203ENST00000409798 1470 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
KCNB1Q14721 PPIP5K2-217ENST00000627916 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
KCNB1Q14721 RNF38-203ENST00000353739 4945 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
KCNB1Q14721 AC130650.2-201ENST00000618736 2403 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
KCNB1Q14721 RGPD1-202ENST00000409776 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.73
KCNB1Q14721 CPB2-201ENST00000181383 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.73
KCNB1Q14721 MACC1-201ENST00000332878 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
KCNB1Q14721 KIF2A-205ENST00000506857 2219 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
KCNB1Q14721 VEPH1-203ENST00000392833 3979 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
KCNB1Q14721 SNORA62.3-201ENST00000365110 153 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
KCNB1Q14721 BCL2L15-203ENST00000393320 276 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
KCNB1Q14721 AL024474.1-201ENST00000404655 591 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
KCNB1Q14721 Y_RNA.604-201ENST00000410574 102 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
KCNB1Q14721 Y_RNA.608-201ENST00000410647 95 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
KCNB1Q14721 RPS3AP3-201ENST00000411933 242 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
KCNB1Q14721 AC022028.1-201ENST00000412054 408 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
KCNB1Q14721 BX890604.2-201ENST00000427883 474 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
KCNB1Q14721 AL139415.2-201ENST00000431968 163 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
KCNB1Q14721 SKP1P1-201ENST00000438081 489 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
KCNB1Q14721 RBMX2P4-201ENST00000441256 376 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
KCNB1Q14721 RPL7P36-201ENST00000444633 681 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
KCNB1Q14721 AP000542.1-201ENST00000448473 371 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
KCNB1Q14721 UTAT33-202ENST00000449177 565 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
KCNB1Q14721 RGS5-217ENST00000451759 835 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
KCNB1Q14721 RN7SL542P-201ENST00000467147 294 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
KCNB1Q14721 ACTR3P3-201ENST00000480448 893 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
KCNB1Q14721 AC093752.2-201ENST00000506942 573 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
KCNB1Q14721 AC063919.1-201ENST00000514281 254 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
KCNB1Q14721 AC107463.1-202ENST00000514526 689 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
KCNB1Q14721 AC110296.1-201ENST00000515680 341 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
KCNB1Q14721 HIGD1AP3-201ENST00000515857 278 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
KCNB1Q14721 SNORA18.6-201ENST00000516792 115 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
KCNB1Q14721 TRIQK-209ENST00000519969 555 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.21□□□□□ -1.74
KCNB1Q14721 AC105031.3-201ENST00000524359 616 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
KCNB1Q14721 DEFB108A-201ENST00000530110 222 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
KCNB1Q14721 AP004242.1-201ENST00000533701 349 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
KCNB1Q14721 AC009511.1-201ENST00000543527 191 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
KCNB1Q14721 AL355922.1-201ENST00000555624 337 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
KCNB1Q14721 LINC02311-202ENST00000556819 477 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
KCNB1Q14721 AC016597.1-201ENST00000564893 528 ntTSL 4 BASIC4.21□□□□□ -1.74
KCNB1Q14721 AC234778.2-201ENST00000566241 354 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
KCNB1Q14721 MIR5685-201ENST00000579080 79 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
KCNB1Q14721 AC090616.5-202ENST00000582111 297 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
KCNB1Q14721 LINC01905-206ENST00000593180 524 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
KCNB1Q14721 YWHAQP7-201ENST00000603536 658 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
KCNB1Q14721 AC090578.1-201ENST00000604955 591 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
KCNB1Q14721 PRKCQ-AS1-207ENST00000607996 531 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
KCNB1Q14721 AL355073.2-201ENST00000612106 557 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
KCNB1Q14721 AL445264.1-201ENST00000621719 171 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
KCNB1Q14721 THOC1-220ENST00000621904 1083 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
KCNB1Q14721 ARAP2-210ENST00000618163 2592 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
KCNB1Q14721 FAP-214ENST00000627638 2569 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
KCNB1Q14721 DOCK7-201ENST00000251157 7084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
KCNB1Q14721 PTER-201ENST00000298942 3448 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
KCNB1Q14721 BAZ2B-204ENST00000392783 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
KCNB1Q14721 CFHR4-204ENST00000608469 1601 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
KCNB1Q14721 ZNF733P-201ENST00000331425 1506 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
KCNB1Q14721 ZNF726-205ENST00000575986 1522 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
KCNB1Q14721 TMCO5A-203ENST00000558158 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
KCNB1Q14721 LINC01828-203ENST00000452716 3250 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
KCNB1Q14721 FNDC3A-202ENST00000398316 5714 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
KCNB1Q14721 OR6C2-201ENST00000322678 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.2□□□□□ -1.74
KCNB1Q14721 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
KCNB1Q14721 FAM24A-201ENST00000368894 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
KCNB1Q14721 AL354864.1-201ENST00000373226 539 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
KCNB1Q14721 MIR23B-201ENST00000384832 97 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.4 ms