Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 AC017015.1-201ENST00000477387 286 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
BECN1Q14457 ACTR3P3-201ENST00000480448 893 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
BECN1Q14457 AC093879.2-201ENST00000513645 427 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
BECN1Q14457 AC110760.3-202ENST00000515177 371 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
BECN1Q14457 IGKV3OR22-2-201ENST00000517943 313 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
BECN1Q14457 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
BECN1Q14457 AC026991.1-201ENST00000520815 463 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
BECN1Q14457 AP001372.4-201ENST00000524889 472 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
BECN1Q14457 MYL12A-202ENST00000536605 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
BECN1Q14457 AC084819.1-201ENST00000537293 424 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
BECN1Q14457 AC022509.2-201ENST00000540392 699 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
BECN1Q14457 AL162311.1-201ENST00000553046 601 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
BECN1Q14457 MEG8-215ENST00000555354 469 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
BECN1Q14457 NR2F2-AS1-208ENST00000560395 441 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
BECN1Q14457 MYL12A-209ENST00000580887 899 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
BECN1Q14457 AL162713.1-201ENST00000604480 262 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
BECN1Q14457 AC090186.1-201ENST00000605991 572 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
BECN1Q14457 AF230666.1-202ENST00000608375 870 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
BECN1Q14457 TUSC7.1-201ENST00000610969 165 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
BECN1Q14457 RASSF8-215ENST00000611440 852 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
BECN1Q14457 C9orf153-205ENST00000617985 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
BECN1Q14457 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
BECN1Q14457 AC002550.2-201ENST00000621246 394 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
BECN1Q14457 AC104971.4-201ENST00000622763 249 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
BECN1Q14457 PCBP1-AS1-348ENST00000629506 667 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
BECN1Q14457 ZFYVE16-202ENST00000505560 6599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
BECN1Q14457 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
BECN1Q14457 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
BECN1Q14457 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
BECN1Q14457 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
BECN1Q14457 FAM214A-216ENST00000619572 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
BECN1Q14457 DCLRE1A-202ENST00000369305 4241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
BECN1Q14457 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
BECN1Q14457 PEX3-201ENST00000367591 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
BECN1Q14457 ESD-201ENST00000378697 1079 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
BECN1Q14457 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC3.77□□□□□ -1.81
BECN1Q14457 TRAJ32-201ENST00000390505 66 ntAPPRIS P1 BASIC3.77□□□□□ -1.81
BECN1Q14457 SNORA48.8-201ENST00000391324 134 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
BECN1Q14457 MRPL30-202ENST00000409145 562 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
BECN1Q14457 AL161909.2-201ENST00000417577 409 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
BECN1Q14457 YPEL5P1-201ENST00000419731 367 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
BECN1Q14457 MTND1P32-201ENST00000433043 938 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
BECN1Q14457 PCDH9-AS3-201ENST00000434073 479 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
BECN1Q14457 MIR548XHG-203ENST00000437492 853 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
BECN1Q14457 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
BECN1Q14457 AC072062.1-204ENST00000437897 1132 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
BECN1Q14457 RABEPKP1-201ENST00000440529 1026 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
BECN1Q14457 RPL23AP35-201ENST00000451906 501 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
BECN1Q14457 RBMY2UP-201ENST00000453474 324 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
BECN1Q14457 SNRPG-206ENST00000454893 527 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
BECN1Q14457 AC110751.1-201ENST00000511916 462 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
BECN1Q14457 LINC02484-201ENST00000513843 546 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
BECN1Q14457 RNU6-714P-201ENST00000516963 103 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
BECN1Q14457 LINC01608-201ENST00000523557 544 ntTSL 4 BASIC3.77□□□□□ -1.81
BECN1Q14457 LINC01481-201ENST00000552998 629 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
BECN1Q14457 AL163153.1-201ENST00000554223 283 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
BECN1Q14457 OR4K8P-201ENST00000578842 1048 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
BECN1Q14457 LINC01515-204ENST00000595269 402 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
BECN1Q14457 AL109653.1-201ENST00000603091 248 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
BECN1Q14457 AL136981.2-201ENST00000617319 734 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
BECN1Q14457 AL161637.1-201ENST00000622380 412 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
BECN1Q14457 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
BECN1Q14457 AC009975.2-201ENST00000635306 1429 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
BECN1Q14457 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
BECN1Q14457 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
BECN1Q14457 AC010733.2-201ENST00000589496 5702 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
BECN1Q14457 AL513185.3-201ENST00000433335 1300 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
BECN1Q14457 AC092447.10-201ENST00000620607 1652 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
BECN1Q14457 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
BECN1Q14457 CGA-201ENST00000369582 729 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
BECN1Q14457 CD80-202ENST00000383669 771 ntTSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
BECN1Q14457 MS4A4E-201ENST00000398984 479 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
BECN1Q14457 MIR1290-201ENST00000408735 78 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
BECN1Q14457 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
BECN1Q14457 AC107081.2-201ENST00000425779 802 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
BECN1Q14457 AL390023.1-201ENST00000428836 262 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
BECN1Q14457 SNRPEP4-201ENST00000435815 279 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
BECN1Q14457 PCCA-AS1-203ENST00000455958 356 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
BECN1Q14457 SNORD121B-201ENST00000458838 81 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
BECN1Q14457 AC107021.1-202ENST00000480247 555 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
BECN1Q14457 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
BECN1Q14457 AC112695.1-201ENST00000504213 592 ntTSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
BECN1Q14457 CSN1S1-204ENST00000507772 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
BECN1Q14457 AC017037.2-201ENST00000513850 890 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
BECN1Q14457 RN7SKP265-201ENST00000516448 223 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
BECN1Q14457 RNU6-528P-201ENST00000516926 100 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
BECN1Q14457 AC104393.1-201ENST00000517495 255 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
BECN1Q14457 DEFB108D-201ENST00000527787 222 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
BECN1Q14457 AC103798.1-201ENST00000532562 376 ntTSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
BECN1Q14457 HIGD1AP1-201ENST00000550979 275 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
BECN1Q14457 MTND1P24-201ENST00000552175 861 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
BECN1Q14457 AC092718.6-202ENST00000563072 408 ntTSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
BECN1Q14457 AC106785.1-201ENST00000565935 262 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
BECN1Q14457 AC007673.1-201ENST00000590604 1100 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
BECN1Q14457 SOX2-OT-224ENST00000595313 716 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
BECN1Q14457 VN1R92P-201ENST00000598511 928 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
BECN1Q14457 AL133507.1-201ENST00000605269 557 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
BECN1Q14457 DLEU1_2.1-201ENST00000617920 342 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
BECN1Q14457 AL121759.2-201ENST00000636173 570 ntTSL 4 BASIC3.76□□□□□ -1.81
BECN1Q14457 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.8 ms