Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
PDE6HQ13956 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
PDE6HQ13956 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PDE6HQ13956 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PDE6HQ13956 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PDE6HQ13956 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PDE6HQ13956 AC004014.1-201ENST00000413406 538 ntTSL 4 BASIC1.7□□□□□ -2.14
PDE6HQ13956 AC099677.1-201ENST00000420575 175 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PDE6HQ13956 PNRC2P1-201ENST00000423940 420 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PDE6HQ13956 AC023590.1-204ENST00000434023 431 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
PDE6HQ13956 AC010105.1-201ENST00000437290 385 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
PDE6HQ13956 AC010157.1-201ENST00000440589 527 ntTSL 4 BASIC1.7□□□□□ -2.14
PDE6HQ13956 RPS3AP12-201ENST00000443616 753 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PDE6HQ13956 PLCB1-IT1-202ENST00000451443 251 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
PDE6HQ13956 RPL23AP23-201ENST00000452590 471 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PDE6HQ13956 AC004872.1-201ENST00000456062 469 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
PDE6HQ13956 RPS20P24-201ENST00000457473 361 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PDE6HQ13956 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PDE6HQ13956 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
PDE6HQ13956 LINC02100-201ENST00000512978 238 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
PDE6HQ13956 AC104233.2-201ENST00000518922 414 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
PDE6HQ13956 CDKL3-207ENST00000521755 586 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
PDE6HQ13956 OR4R1P-201ENST00000529879 463 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PDE6HQ13956 AHI1-217ENST00000534469 680 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
PDE6HQ13956 AKIRIN1P1-201ENST00000547384 544 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PDE6HQ13956 ETFRF1-202ENST00000553788 708 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
PDE6HQ13956 AC090618.1-201ENST00000571972 585 ntTSL 2 BASIC1.7□□□□□ -2.14
PDE6HQ13956 AP005057.1-201ENST00000583827 574 ntTSL 4 BASIC1.7□□□□□ -2.14
PDE6HQ13956 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
PDE6HQ13956 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PDE6HQ13956 BX322635.1-201ENST00000605804 496 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PDE6HQ13956 CLECL1-204ENST00000621400 611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
PDE6HQ13956 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
PDE6HQ13956 AC098679.5-201ENST00000624394 571 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PDE6HQ13956 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
PDE6HQ13956 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
PDE6HQ13956 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
PDE6HQ13956 MTCO1P6-201ENST00000481192 1384 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PDE6HQ13956 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC1.7□□□□□ -2.14
PDE6HQ13956 GABRG2-221ENST00000639683 3600 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
PDE6HQ13956 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.69□□□□□ -2.14
PDE6HQ13956 AC130650.2-201ENST00000618736 2403 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PDE6HQ13956 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
PDE6HQ13956 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PDE6HQ13956 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
PDE6HQ13956 GNG5P1-201ENST00000255500 204 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PDE6HQ13956 C2orf76-201ENST00000334816 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
PDE6HQ13956 OR5H15-201ENST00000383696 930 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PDE6HQ13956 RNU6-1005P-201ENST00000384519 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PDE6HQ13956 MIR525-201ENST00000384978 85 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PDE6HQ13956 CYCSP45-201ENST00000402289 315 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PDE6HQ13956 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
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PDE6HQ13956 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
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PDE6HQ13956 AC107081.1-201ENST00000414975 361 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PDE6HQ13956 ZNF92P1Y-201ENST00000415010 1191 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PDE6HQ13956 MORF4L1P6-201ENST00000418771 268 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PDE6HQ13956 AC005005.2-201ENST00000420779 380 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
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PDE6HQ13956 OR6K5P-201ENST00000447050 945 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PDE6HQ13956 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PDE6HQ13956 SETP11-201ENST00000473027 690 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PDE6HQ13956 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PDE6HQ13956 NSMCE2-206ENST00000519010 848 ntTSL 2 BASIC1.69□□□□□ -2.14
PDE6HQ13956 RPL7P20-201ENST00000520308 745 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
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PDE6HQ13956 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PDE6HQ13956 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC1.69□□□□□ -2.14
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PDE6HQ13956 UBE2Q2P2-203ENST00000613592 761 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PDE6HQ13956 AC012409.2-201ENST00000619812 751 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
PDE6HQ13956 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PDE6HQ13956 AL160394.1-201ENST00000624765 724 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PDE6HQ13956 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PDE6HQ13956 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC1.69□□□□□ -2.14
PDE6HQ13956 AC025263.3-201ENST00000622965 1396 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PDE6HQ13956 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
PDE6HQ13956 AC008432.1-201ENST00000615912 1320 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PDE6HQ13956 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
PDE6HQ13956 MDM2-203ENST00000299252 966 ntTSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
PDE6HQ13956 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PDE6HQ13956 SNORD82-201ENST00000365530 70 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PDE6HQ13956 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PDE6HQ13956 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC1.68□□□□□ -2.14
PDE6HQ13956 ANAPC10P1-201ENST00000395991 556 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PDE6HQ13956 AC009237.2-201ENST00000421358 284 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PDE6HQ13956 AL390962.1-201ENST00000421507 526 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
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