Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 AC073648.5-201ENST00000603502 305 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 AC091805.2-201ENST00000603848 235 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 AC004853.1-201ENST00000604902 698 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 AC015540.1-201ENST00000615828 501 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 ZRANB2-AS2-221ENST00000624050 629 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 TEX41-280ENST00000629185 591 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 SKP1-209ENST00000522552 1683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 MTND5P29-201ENST00000458676 1807 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 AL353746.1-201ENST00000566293 6881 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 PGGT1B-203ENST00000419445 9545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 IQCG-205ENST00000455191 1981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 SMC1B-201ENST00000357450 4201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 PRRG1-202ENST00000449135 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 AC066616.2-201ENST00000559334 1481 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 RAP2C-AS1-202ENST00000441399 3473 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 PMCH-201ENST00000329406 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 Y_RNA.41-201ENST00000362646 102 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 Y_RNA.46-201ENST00000362695 102 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 SNORD51-201ENST00000384320 80 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 SNORD115.1-201ENST00000391109 76 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 AC136624.1-201ENST00000400791 413 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 AL136116.1-201ENST00000403591 381 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 Z98941.1-201ENST00000407764 100 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 RNU2-66P-201ENST00000410650 161 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 RNU4-78P-201ENST00000410940 126 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 RPS27L-202ENST00000411926 528 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 RPL30P2-201ENST00000414021 291 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 AIMP1P1-201ENST00000418670 937 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 MTCYBP24-201ENST00000420387 1106 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 AC006548.1-201ENST00000427470 102 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 BX890604.2-201ENST00000427883 474 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 HTR2A-AS1-201ENST00000430913 429 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 AC004837.2-201ENST00000435766 731 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 LINC00411-201ENST00000436722 461 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 Z95327.1-201ENST00000446082 482 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 LINC01729-201ENST00000450640 358 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 snoU13.8-201ENST00000458890 104 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 AC084357.1-201ENST00000473404 255 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 MTND2P33-201ENST00000506452 1031 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 AC093752.2-201ENST00000506942 573 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 EPGN-208ENST00000509145 222 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 AC026402.1-201ENST00000513642 170 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 LINC00491-204ENST00000513815 582 ntTSL 4 BASIC3.5□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 MTND4LP31-201ENST00000514859 294 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 RN7SKP116-201ENST00000516902 319 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 RNU4-60P-201ENST00000517239 135 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 LRRTM2-203ENST00000521094 1182 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 AF233439.1-201ENST00000526235 401 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 AP003392.2-201ENST00000527269 208 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 EEF1B2P4-201ENST00000551398 348 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 AL359233.1-201ENST00000554029 364 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 HSPE1P5-201ENST00000561489 272 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 PWRN1-202ENST00000562501 642 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 AC107954.1-201ENST00000565906 727 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 AC007495.1-203ENST00000569025 888 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 AL513324.1-201ENST00000575236 632 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 DEFB131E-202ENST00000602581 683 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 LLPHP1-201ENST00000603571 367 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 AC067959.1-201ENST00000604334 379 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 NDUFA8P1-201ENST00000605525 367 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 AC098614.4-201ENST00000607601 462 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 AL589743.7-201ENST00000612637 233 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 AC138393.3-201ENST00000618397 573 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 AC026585.1-201ENST00000619582 524 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 CR381572.1-201ENST00000625098 102 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 UBE2E2-207ENST00000628311 267 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 CAPZA2-214ENST00000628758 525 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 LINC01002-206ENST00000631772 539 ntTSL 4 BASIC3.5□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 AC099654.13-201ENST00000639774 207 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 CCDC178-205ENST00000406524 3039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 FER-201ENST00000281092 12119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 CCDC146-201ENST00000285871 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 KIF15-203ENST00000425755 3460 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 UBE3A-202ENST00000397954 2873 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 NUFIP2-201ENST00000225388 10850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 MAP3K7-202ENST00000369325 4633 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 Y_RNA.3-201ENST00000362331 103 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 RNY4P24-201ENST00000362735 96 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 PTPRC-202ENST00000367364 1017 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 RGS4-201ENST00000367906 930 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 OR5V1-215ENST00000377154 1266 ntAPPRIS P1 BASIC3.49□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 RNU6-356P-201ENST00000384140 107 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 RNU6-821P-201ENST00000390995 107 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 U3.39-201ENST00000408569 239 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 AC105271.1-202ENST00000411417 445 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 AL359704.1-201ENST00000411586 781 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 AC078974.1-201ENST00000411597 223 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 RPS3AP3-201ENST00000411933 242 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 AC245052.5-201ENST00000416320 649 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 AL159169.1-201ENST00000421119 127 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 AL512656.1-201ENST00000427492 401 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 RPL7P2-201ENST00000427639 268 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 AC010975.2-201ENST00000427781 588 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 AC017083.1-201ENST00000428093 483 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 LINC01724-201ENST00000430519 621 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 AL035258.1-201ENST00000439450 439 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 AC244505.5-201ENST00000443639 207 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 HTR2A-AS1-202ENST00000452352 384 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
GTF2H2Q13888 AL589678.1-201ENST00000452685 561 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.9 ms