Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 AP000770.2-201ENST00000623694 100 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 AL356596.1-201ENST00000624230 379 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 AL121759.2-201ENST00000636173 570 ntTSL 4 BASIC3.6□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 NDST3-201ENST00000296499 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 EVI5-201ENST00000370331 7403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 MT-ND5-201ENST00000361567 1812 ntAPPRIS P1 BASIC3.6□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 SLC35A1-201ENST00000369552 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 AC104454.1-201ENST00000421341 1401 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 UGT2B10-201ENST00000265403 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 PTPN22-207ENST00000528414 3424 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 COMMD8-201ENST00000381571 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 IL1RL1-204ENST00000409584 2693 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 TAB3P1-202ENST00000452645 1634 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 LMNTD1-204ENST00000458174 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 TAS2R14-202ENST00000537503 1858 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 PLG-203ENST00000366924 1166 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 RNU6-723P-201ENST00000383973 107 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 RNU6-1200P-201ENST00000384162 107 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 TRAJ32-201ENST00000390505 66 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 U3.19-201ENST00000390893 196 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 RPS3AP26-201ENST00000398259 784 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 AC093157.1-203ENST00000416329 713 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 TRAPPC2P4-201ENST00000421750 331 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 AL391832.1-201ENST00000423963 423 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 AL357375.1-201ENST00000424274 525 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 AL008629.1-201ENST00000438615 184 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 RABEPKP1-201ENST00000440529 1026 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 ELOCP23-201ENST00000452014 332 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 RPS4XP22-201ENST00000480755 780 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 HMGB1P36-201ENST00000487709 576 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 AP001025.2-201ENST00000490908 477 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 RPL7P23-201ENST00000493874 747 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 AC016933.1-201ENST00000504735 539 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 VN1R104P-201ENST00000505115 1009 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 AC093809.1-201ENST00000509155 340 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 RNU1-61P-201ENST00000516107 151 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 RNU6-528P-201ENST00000516926 100 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 MTERF3-203ENST00000522822 1148 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 CD44-AS1-201ENST00000528869 587 ntTSL 4 BASIC3.59□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 AC026894.1-202ENST00000533843 477 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 ELOCP32-201ENST00000548625 324 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 AC006116.8-203ENST00000587448 465 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 ZFP30-209ENST00000589018 444 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 AC010928.1-202ENST00000589354 473 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 AC013444.2-201ENST00000603317 787 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 AC072039.2-201ENST00000608883 439 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 AL450489.1-201ENST00000612071 468 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 AC009464.1-201ENST00000615731 469 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 AC140725.3-201ENST00000616193 880 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 AC084757.4-201ENST00000616350 526 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 AC009159.2-201ENST00000617603 606 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 BLM-208ENST00000560509 3966 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 PKHD1L1-201ENST00000378402 13076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
ALCAMQ13740 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
ALCAMQ13740 RTKN2-201ENST00000315289 2383 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.84
ALCAMQ13740 AC092447.10-201ENST00000620607 1652 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
ALCAMQ13740 FIGNL1-202ENST00000395556 3485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
ALCAMQ13740 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
ALCAMQ13740 RNA5SP88-201ENST00000365560 109 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ALCAMQ13740 CRP-203ENST00000368111 512 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
ALCAMQ13740 NFIB-202ENST00000380924 840 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
ALCAMQ13740 TAS2R15P-201ENST00000390674 928 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ALCAMQ13740 MTND4P13-201ENST00000402078 1023 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ALCAMQ13740 RNA5SP107-201ENST00000411358 122 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ALCAMQ13740 RPS15AP38-201ENST00000413110 372 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ALCAMQ13740 FGF12-AS1-201ENST00000414920 580 ntTSL 4 BASIC3.58□□□□□ -1.84
ALCAMQ13740 AL022396.1-201ENST00000427011 386 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
ALCAMQ13740 YME1L1P1-201ENST00000429435 297 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ALCAMQ13740 AC008568.1-203ENST00000433406 765 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
ALCAMQ13740 AL117351.1-201ENST00000438864 766 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ALCAMQ13740 AL035701.1-201ENST00000444038 462 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
ALCAMQ13740 DIAPH2-AS1-202ENST00000445414 606 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
ALCAMQ13740 AL357793.2-201ENST00000447056 850 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
ALCAMQ13740 LINC00709-201ENST00000458168 494 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
ALCAMQ13740 RPL23AP62-201ENST00000463396 453 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ALCAMQ13740 RPL30P9-201ENST00000465586 330 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ALCAMQ13740 RN7SL601P-201ENST00000471221 293 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ALCAMQ13740 AC021382.1-201ENST00000483523 359 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ALCAMQ13740 RPL32P34-201ENST00000486380 400 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ALCAMQ13740 AC021678.1-201ENST00000505195 936 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ALCAMQ13740 AC034159.1-201ENST00000513885 583 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ALCAMQ13740 MTND5P4-201ENST00000514978 288 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ALCAMQ13740 AL391156.1-201ENST00000554965 554 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ALCAMQ13740 TIMM9-207ENST00000555930 448 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
ALCAMQ13740 AC136618.2-201ENST00000575091 400 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ALCAMQ13740 AC099811.4-201ENST00000592536 496 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
ALCAMQ13740 BDH2P1-201ENST00000602288 736 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ALCAMQ13740 AC103710.3-201ENST00000608157 948 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ALCAMQ13740 AC024560.3-201ENST00000608482 349 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ALCAMQ13740 MUCL1-205ENST00000619042 243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
ALCAMQ13740 AC012314.7-201ENST00000619693 93 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ALCAMQ13740 NEB-218ENST00000603639 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
ALCAMQ13740 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
ALCAMQ13740 TFEC-201ENST00000265440 6628 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
ALCAMQ13740 CPB2-201ENST00000181383 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
ALCAMQ13740 AP001148.1-201ENST00000624124 2359 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.3 ms