Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 MIR589-201ENST00000385238 99 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC4.06□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 TRAJ58-201ENST00000390481 63 ntAPPRIS P1 BASIC4.06□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 RNU6-328P-201ENST00000390887 106 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 AL391417.1-201ENST00000404100 426 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 DDX39BP1-205ENST00000422507 192 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 AL450992.2-201ENST00000434182 506 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 LINC01754-201ENST00000437920 750 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 LINC00704-202ENST00000443994 418 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 AC073850.1-201ENST00000449243 255 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 CREM-238ENST00000488741 651 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 COX6B1P2-201ENST00000489624 230 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 AC005726.1-201ENST00000494679 427 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 AC016559.2-201ENST00000510759 359 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 RNU6-470P-201ENST00000515954 104 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 RNU6-120P-201ENST00000516077 103 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 RN7SKP66-201ENST00000516681 231 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 IGHVII-44-2-201ENST00000517728 250 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 AC099520.1-208ENST00000518276 472 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC4.06□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 AL160237.1-201ENST00000554526 572 ntTSL 4 BASIC4.06□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 AC009554.1-201ENST00000559251 399 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 AC091073.1-201ENST00000559620 666 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 SMG1P7-203ENST00000573141 619 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 MIR3691-201ENST00000578066 90 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 COX6CP3-201ENST00000580869 223 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 AC007922.3-201ENST00000581648 543 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 AC009271.1-202ENST00000588803 492 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 AC020634.1-201ENST00000608701 549 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 RASSF8-215ENST00000611440 852 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 AL627230.1-201ENST00000613077 211 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 AC068870.2-201ENST00000620635 389 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 AC025034.2-201ENST00000623264 286 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 AP002799.1-201ENST00000623552 423 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 LINC00706-201ENST00000628989 699 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 FGF13-202ENST00000315930 19519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 GLCE-201ENST00000261858 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 UGT2B7-201ENST00000305231 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 SRSF11-201ENST00000370949 3034 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 ANO6-205ENST00000441606 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 NUDT12-202ENST00000507423 1781 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 IPO11-203ENST00000409534 1725 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 FKTN-204ENST00000448551 1700 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 OTOGL-204ENST00000547103 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 THAP12P4-201ENST00000528321 2266 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 UBA6-AS1-203ENST00000500538 3352 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 ABCA13-204ENST00000435803 17184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 AC022893.2-201ENST00000564832 3296 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 ABCB5-202ENST00000404938 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 MED13-201ENST00000397786 10465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 RGS10-201ENST00000369101 738 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 SNORA24.1-201ENST00000384401 135 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 RNU6-278P-201ENST00000390945 109 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 AL645927.1-201ENST00000396783 406 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 NDUFS5P1-201ENST00000405668 289 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 RN7SKP106-201ENST00000410832 272 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 RPL7P46-201ENST00000425129 740 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 MTCO3P45-201ENST00000443036 613 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 GEMIN8P3-201ENST00000445417 720 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 AC096644.1-201ENST00000446169 390 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 AL162388.1-201ENST00000450912 352 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 NDUFAF4P3-201ENST00000456468 525 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 RNU6-1218P-201ENST00000458990 108 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 AC046136.1-201ENST00000459855 533 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 RN7SL329P-201ENST00000467740 299 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 AC097484.1-201ENST00000471148 389 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 AC092451.1-201ENST00000480211 153 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 AC008953.1-201ENST00000497334 318 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 AC093767.1-201ENST00000504523 156 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 HIGD1AP13-201ENST00000509878 289 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 RNU6-347P-201ENST00000516658 105 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 AC105031.1-201ENST00000518550 476 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 AP000827.1-201ENST00000527814 258 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 AC013799.1-201ENST00000531157 348 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
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