Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 AC005062.1-204ENST00000415499 743 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 SDCBPP3-201ENST00000419629 891 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 AL021026.1-201ENST00000422841 658 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 AC091286.1-201ENST00000431233 461 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 POU6F2-AS1-201ENST00000433519 381 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC2.37□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 THAP5P1-201ENST00000439089 262 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 AC122718.1-201ENST00000439448 744 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 LINC00302-201ENST00000444515 302 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 AL133547.1-201ENST00000448546 220 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 AL390783.1-203ENST00000457058 248 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 RN7SL542P-201ENST00000467147 294 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 IGKV2D-30-201ENST00000474213 395 ntAPPRIS P1 BASIC2.37□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 RPL21P13-201ENST00000488305 481 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 LINC02032-201ENST00000490465 391 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 AC109445.1-201ENST00000512356 383 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 AC104619.2-201ENST00000514293 646 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 RNU6-528P-201ENST00000516926 100 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 AC026403.1-201ENST00000518938 295 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 AC109466.1-211ENST00000519327 496 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC2.37□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 COX6CP8-201ENST00000522620 226 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 AP001804.3-201ENST00000525146 880 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 AP002992.1-202ENST00000530842 551 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 OR6C7P-201ENST00000547875 934 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 AC012170.2-201ENST00000560380 667 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
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ERCC8Q13216 MTND1P8-201ENST00000571424 950 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 ZNF415P1-201ENST00000582279 1166 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
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ERCC8Q13216 AC245297.2-201ENST00000610119 565 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 AC016597.2-201ENST00000613256 341 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 Metazoa_SRP.117-201ENST00000615106 292 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 AL357080.1-201ENST00000617394 239 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 AC039056.2-201ENST00000622261 511 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 AL078595.3-201ENST00000623815 1166 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 PCBP1-AS1-348ENST00000629506 667 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 AC008505.1-205ENST00000637847 703 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 Z83843.1-201ENST00000604070 3685 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 MT-ND5-201ENST00000361567 1812 ntAPPRIS P1 BASIC2.37□□□□□ -2.03
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ERCC8Q13216 AC008957.1-201ENST00000510740 478 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
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ERCC8Q13216 RNU6-714P-201ENST00000516963 103 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
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ERCC8Q13216 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 AC022360.2-202ENST00000517308 407 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 LINC02143-201ENST00000519929 520 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 NECAB1-205ENST00000522820 811 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 ZFPM2-AS1-207ENST00000524045 987 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC2.36□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 AC104237.1-201ENST00000527443 539 ntTSL 4 BASIC2.36□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 LINC00508-201ENST00000538901 194 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 AC022509.2-201ENST00000540392 699 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 AC007619.1-201ENST00000544086 412 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 AL132780.1-202ENST00000548322 591 ntTSL 4 BASIC2.36□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 AC125611.2-201ENST00000551907 647 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 AL133370.1-201ENST00000554679 537 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 RPL21P12-201ENST00000559810 515 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 MMP2-AS1-201ENST00000565307 593 ntTSL 4 BASIC2.36□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 AC090615.1-201ENST00000577519 154 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 MIR2682-201ENST00000580305 110 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
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