Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 TRIM36-201ENST00000282369 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 RPL26-201ENST00000293842 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 TRAJ35-201ENST00000390502 59 ntAPPRIS P1 BASIC3.11□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 CLK1-203ENST00000409769 1192 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 CCDC126-203ENST00000410069 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 HNMT-204ENST00000410115 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 GCG-202ENST00000418842 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 AC106873.1-201ENST00000420664 459 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 AC092047.1-201ENST00000424997 240 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 NOTCH2P1-201ENST00000443481 624 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 AL139275.2-201ENST00000444731 539 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 CBWD4P-201ENST00000445695 655 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 BMI1P1-201ENST00000445879 941 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 PTENP1-201ENST00000447117 1215 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 RPL23AP20-201ENST00000447965 421 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 AC011897.1-201ENST00000450715 346 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 DSTNP2-201ENST00000504533 515 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 RNA5SP216-201ENST00000516111 123 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 AC103853.1-201ENST00000520588 649 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 ZFPM2-AS1-207ENST00000524045 987 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 AP000462.1-201ENST00000535704 818 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 AC012170.2-201ENST00000560380 667 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 AC006960.3-201ENST00000561845 705 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 RN7SL600P-201ENST00000581811 299 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 TEX41-238ENST00000604253 709 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 AC106052.1-201ENST00000608029 497 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 AC103710.4-201ENST00000609301 899 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 BX323046.1-201ENST00000610145 535 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 AC097478.2-201ENST00000610572 514 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 AC005962.2-201ENST00000611427 652 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 BIRC6-AS2-201ENST00000623382 589 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 AC079597.1-201ENST00000624306 508 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 VPS8-228ENST00000628962 207 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 OR52H1-202ENST00000641796 1061 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 GPRC6A-202ENST00000368549 2622 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 EVI2B-202ENST00000577894 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 AL138713.1-201ENST00000624026 2130 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 MBNL3-204ENST00000370853 2661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 RTN4-208ENST00000404909 4102 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 RLIMP1-201ENST00000339626 1680 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 AL590084.2-201ENST00000401481 382 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 MTND4P13-201ENST00000402078 1023 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 SLC8A1-AS1-201ENST00000413479 800 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 LINC00276-201ENST00000417751 596 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 AC106883.1-201ENST00000418805 562 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 LINC00411-201ENST00000436722 461 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 COX7BP2-201ENST00000437976 242 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 GJE1-201ENST00000450456 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 DCLRE1CP1-201ENST00000454630 470 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 AL445524.1-204ENST00000454631 458 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 RPS23P7-201ENST00000466210 444 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 MTND4LP3-201ENST00000468320 276 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 THAP6-205ENST00000504190 1004 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 LINC02213-202ENST00000506021 774 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 ABCA17P-206ENST00000512848 467 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 RNU1-143P-201ENST00000516296 146 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 AC008415.1-201ENST00000522189 734 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 AC092112.1-201ENST00000538329 640 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 LINC00944-203ENST00000542248 548 ntTSL 4 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 GTF2IP22-201ENST00000554443 182 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 NUFIP2-202ENST00000579665 559 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 AC020895.1-201ENST00000595362 272 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
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CBX3Q13185 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 AL592221.1-201ENST00000605266 382 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
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CBX3Q13185 U1.23-201ENST00000610293 146 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 RNU1-68P-201ENST00000615382 146 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 AC079684.1-201ENST00000621405 437 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 U1.39-201ENST00000621562 146 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 MIR6830-201ENST00000636015 70 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 TEX30-201ENST00000376019 1689 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 MME-211ENST00000492661 2854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 KCNH7-204ENST00000618399 3713 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 RNU6-462P-201ENST00000362659 105 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 RNU6-223P-201ENST00000362830 107 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 MS4A4E-202ENST00000398986 522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 MIR320C1-201ENST00000408566 88 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 AC068533.1-201ENST00000418542 415 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 AC083875.1-201ENST00000419509 405 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 AL034347.1-201ENST00000420766 835 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 AL353678.1-201ENST00000422735 741 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
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