Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Length 568 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 AF250324.2-201ENST00000608299 610 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 STARD13-AS-239ENST00000609588 982 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 AC023043.4-201ENST00000612081 449 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 AL109811.3-202ENST00000612387 651 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 AC090970.3-201ENST00000612566 866 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 TMBIM4-213ENST00000613669 851 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 AC022306.2-201ENST00000617563 647 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 AL731566.2-201ENST00000618971 317 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 AL158209.2-201ENST00000619266 216 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 CAPZA2-214ENST00000628758 525 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 AP003171.2-202ENST00000634657 355 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 OR5B3-202ENST00000641865 1046 ntAPPRIS P1 BASIC3.66□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 AC004520.1-201ENST00000608362 1413 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 USP26-201ENST00000370832 3642 ntAPPRIS P1 BASIC3.66□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 THUMPD3P1-201ENST00000506556 1480 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 ADAT2-203ENST00000606514 6651 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 TNPO1P3-201ENST00000436471 2662 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 ADGRV1-201ENST00000405460 19557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 PCDH15-208ENST00000395432 6901 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 KIF15-203ENST00000425755 3460 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 RAD17-202ENST00000305138 3164 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 AC008725.1-201ENST00000605123 2263 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 RNF111-206ENST00000559209 5278 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 PNISR-201ENST00000369239 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 FOXP2-224ENST00000635534 4290 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 RNF38-203ENST00000353739 4945 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 C1D-201ENST00000355848 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 KCNJ16-203ENST00000392671 3981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 SPRR2C-201ENST00000290702 219 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 Y_RNA.296-201ENST00000364930 108 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 AKR1C1-201ENST00000380859 858 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 RPS20P2-201ENST00000402520 389 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 GSTA9P-201ENST00000406231 611 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 FCF1P10-201ENST00000407590 479 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 SPA17P1-201ENST00000416656 452 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 PIGFP2-201ENST00000421400 651 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
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TRAF3Q13114 FAM111B-202ENST00000411426 3344 ntTSL 4 BASIC3.65□□□□□ -1.83
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TRAF3Q13114 LYST-201ENST00000389793 13480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 PRO1804-201ENST00000623780 2050 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 ZNF99-201ENST00000397104 3114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 OR10J1-203ENST00000642080 3503 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
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TRAF3Q13114 U8.3-201ENST00000363321 132 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 C9orf92-201ENST00000380683 359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 Y_RNA.554-201ENST00000384672 102 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 OR5H8-201ENST00000394191 1045 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 RPL31P1-201ENST00000398116 372 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
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TRAF3Q13114 RNU2-8P-201ENST00000410727 190 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 AC127526.1-201ENST00000417526 366 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 RPL31P45-201ENST00000419532 356 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 RPS12P23-201ENST00000419579 400 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 AC092017.2-201ENST00000427600 362 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 LINC01850-201ENST00000429916 357 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 AL356277.3-201ENST00000432484 618 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
TRAF3Q13114 ZNF385D-AS2-201ENST00000436306 424 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
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