Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 AC098820.1-201ENST00000453157 512 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 snoU109.4-201ENST00000458953 143 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 AP001992.1-205ENST00000462248 379 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 AC004930.1-201ENST00000470677 254 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 LINC02198-202ENST00000505371 526 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 SCOC-206ENST00000506322 687 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 OR6C73P-201ENST00000546432 358 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 AC093012.1-201ENST00000552999 446 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 AL160191.1-202ENST00000554008 576 ntTSL 4 BASIC3.9□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 AP005380.1-201ENST00000584896 547 ntTSL 4 BASIC3.9□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 AL669831.4-202ENST00000590817 238 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 AC008946.1-201ENST00000599756 421 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 AP001972.3-202ENST00000603012 375 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 AL022161.1-201ENST00000604390 213 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 AC012468.1-201ENST00000604888 430 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 AL596245.1-201ENST00000618994 362 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 AL732618.1-201ENST00000623251 301 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 AC073172.1-201ENST00000636967 851 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 FOXP2-227ENST00000638397 240 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 CCDC146-201ENST00000285871 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 ATXN3-248ENST00000558190 26812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 CCDC178-204ENST00000403303 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 MIPOL1-206ENST00000545536 2073 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 MTND4P16-201ENST00000466108 1367 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 PTPN22-211ENST00000538253 3575 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 LINC01094-203ENST00000504675 1985 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 AC006504.1-201ENST00000562493 3666 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 AGL-206ENST00000370165 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 FBXL13-204ENST00000436908 2577 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 TET2-204ENST00000413648 4973 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 BCLAF3-202ENST00000379682 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 RNU6-289P-201ENST00000364093 107 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 RNU6-777P-201ENST00000364265 104 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 RNU6-343P-201ENST00000364709 104 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 RNU4-91P-201ENST00000364778 135 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 RNU6-821P-201ENST00000390995 107 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 RPL17P50-201ENST00000396131 546 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 LARP1BP3-201ENST00000437229 869 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
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GRIK3Q13003 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 AC010261.1-201ENST00000514411 457 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
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GRIK3Q13003 AC090796.1-201ENST00000520370 567 ntTSL 4 BASIC3.89□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 AC037471.2-201ENST00000564941 598 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 LINC2194-202ENST00000567624 506 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 FOPNL-204ENST00000573396 735 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 BNIP3P23-201ENST00000599655 511 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 AP000403.1-201ENST00000603349 851 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 AL031775.1-201ENST00000607014 887 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
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GRIK3Q13003 AC011939.3-201ENST00000613686 466 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
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GRIK3Q13003 GABRG2-213ENST00000639046 3058 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 AC072062.1-210ENST00000628464 1315 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 FAR2-203ENST00000547116 1787 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 SETDB2-202ENST00000317257 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 LINC01416-201ENST00000563553 2310 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 AC092447.10-201ENST00000620607 1652 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 CSNK1G3-203ENST00000361991 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
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GRIK3Q13003 Y_RNA.493-201ENST00000384422 102 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 TRAV39-201ENST00000390466 331 ntAPPRIS P1 BASIC3.88□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 AL023581.1-201ENST00000423500 455 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 CYCSP46-201ENST00000423569 204 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 LAMTOR3P1-201ENST00000428620 370 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 LINC00189-202ENST00000431661 308 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 AL117341.1-201ENST00000437213 373 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 LSM1P1-201ENST00000438629 273 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 RBMY2UP-201ENST00000453474 324 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
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GRIK3Q13003 AC093110.1-201ENST00000456363 602 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
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GRIK3Q13003 ARNTL2-AS1-201ENST00000500498 804 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
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GRIK3Q13003 AC012229.1-201ENST00000558699 499 ntTSL 4 BASIC3.88□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 AC107954.1-201ENST00000565906 727 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 AC091489.2-201ENST00000566263 604 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 AC090615.1-201ENST00000577519 154 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 MIR7515HG-213ENST00000585872 758 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 AP001981.2-201ENST00000603241 418 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 ADPRM-204ENST00000609540 1138 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 AC006329.2-201ENST00000611491 394 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
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GRIK3Q13003 SNORA50A-202ENST00000629536 136 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 ZNF382-210ENST00000639288 834 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 AC006378.2-201ENST00000623178 2476 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 AC025164.2-202ENST00000499685 5699 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 PKN2-AS1-202ENST00000458097 3542 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 PABPC1P9-201ENST00000426076 1612 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 OR56A3-203ENST00000641160 4438 ntAPPRIS P1 BASIC3.88□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 MACC1-205ENST00000589011 2686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
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