Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 SNORD116-5-201ENST00000384462 95 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 TRAJ18-201ENST00000390519 66 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 RPS20P2-201ENST00000402520 389 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 RNA5SP129-201ENST00000410276 118 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 MTND1P21-201ENST00000412991 285 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 LINC01349-201ENST00000416343 497 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 LINC00276-201ENST00000417751 596 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 AL365338.1-201ENST00000422282 858 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 LINC00375-201ENST00000433074 601 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 HSFY6P-201ENST00000445573 403 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 AL451164.2-201ENST00000445932 597 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 AL590365.1-201ENST00000450788 243 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 NUTF2P7-201ENST00000453086 375 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 NANOGP10-201ENST00000453325 895 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 AC004930.1-201ENST00000470677 254 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 RPS4XP13-201ENST00000483219 789 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 RPS3AP50-201ENST00000487064 803 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 AC112204.1-201ENST00000502591 103 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 AC092608.1-201ENST00000503505 267 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 AC105313.1-201ENST00000509121 353 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 LINC02272-202ENST00000511399 607 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 MTND5P13-201ENST00000513046 1079 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 AC104619.2-201ENST00000514293 646 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 LINC01969-201ENST00000514468 455 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 AC117532.1-201ENST00000514638 323 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 MTCO2P32-201ENST00000514865 403 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 RNA5SP208-201ENST00000516156 78 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 RNU6-1231P-201ENST00000517185 103 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 HMGN1P28-201ENST00000521340 364 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 RGS5-206ENST00000527988 373 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 AC005225.1-201ENST00000553394 937 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 TMEM87A-212ENST00000568432 750 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 AC025272.1-201ENST00000569661 483 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 AC099489.2-201ENST00000574976 260 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 AC106796.1-201ENST00000577173 615 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 PPP3CB-AS1-206ENST00000595935 675 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 AC015726.1-201ENST00000602353 681 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 AC068790.3-201ENST00000602988 553 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 AL158063.1-201ENST00000615349 536 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 AC243312.2-201ENST00000623340 601 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 AC095031.1-201ENST00000623685 672 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 RNA5SP196-201ENST00000625967 102 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 AC073172.1-201ENST00000636967 851 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 IQCH-201ENST00000335894 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 VEPH1-203ENST00000392833 3979 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 POLK-201ENST00000241436 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 CCDC110-202ENST00000393540 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 THOC1-221ENST00000631280 2011 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 NUFIP2-201ENST00000225388 10850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 ADGRV1-201ENST00000405460 19557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 TAX1BP1-213ENST00000543117 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 RAD17-202ENST00000305138 3164 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 MIR372-201ENST00000362225 67 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 RN7SKP227-201ENST00000364445 330 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 C6orf62-201ENST00000378102 741 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 MEIG1-201ENST00000378240 507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 RNU6-432P-201ENST00000384196 109 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 CCNG1P1-201ENST00000406783 885 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 REV3L-IT1-201ENST00000411895 382 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 AL691426.1-201ENST00000416507 509 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 AL117339.2-201ENST00000430475 180 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 SNORA71B-202ENST00000439232 272 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 KATNBL1P3-201ENST00000443475 909 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 AL035701.1-201ENST00000444038 462 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 MIR217HG-201ENST00000446139 900 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 AC018731.1-201ENST00000447078 576 ntTSL 4 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 USP9YP12-201ENST00000450481 570 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 PCCA-AS1-203ENST00000455958 356 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 LINC01445-202ENST00000458615 679 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 AC092059.1-201ENST00000485347 429 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 AC068724.1-201ENST00000487100 792 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 AC080014.1-201ENST00000496877 1201 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 AC091965.2-201ENST00000512324 613 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 AC239802.1-201ENST00000531288 406 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 UTS2-201ENST00000054668 420 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 AC136188.1-201ENST00000546770 342 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 LINC01405-202ENST00000547607 674 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 AL157938.2-203ENST00000589540 931 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 AP001981.2-201ENST00000603241 418 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 AL451086.1-201ENST00000605596 223 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 AC068276.1-201ENST00000605793 379 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 SNORA62.6-201ENST00000606322 83 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 TMEM212-205ENST00000619900 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 AL591441.2-201ENST00000620059 535 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 AC012150.2-201ENST00000621300 544 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 BX088723.1-201ENST00000637785 708 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 ZNF826P-207ENST00000622273 1910 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 AC110597.3-202ENST00000583493 3289 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 LINC00648-202ENST00000555985 2885 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 AC009812.4-201ENST00000569134 1805 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 SERPINI2-201ENST00000264677 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 UFM1-201ENST00000239878 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 LINC00301-201ENST00000320202 852 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 C1orf100-202ENST00000366537 483 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
CSTF3Q12996 RNU6-213P-201ENST00000384051 104 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.1 ms