Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 AL031119.1-201ENST00000404707 1879 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 ST7-212ENST00000422922 1887 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 DNAJC16-210ENST00000616884 5882 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 RBMS3-202ENST00000383766 2757 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 AC112198.2-201ENST00000426589 6996 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 AC016687.3-202ENST00000505018 2404 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 PRUNE2-207ENST00000428286 12437 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 PHTF2-208ENST00000450574 2516 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 ARHGAP18-201ENST00000368149 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 PSMA4-201ENST00000044462 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 FNIP1-201ENST00000307954 6366 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 IL18R1-202ENST00000334376 537 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 RNU6-903P-201ENST00000391270 109 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 U3.35-201ENST00000408405 208 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 CCDC126-203ENST00000410069 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 RNU4-6P-201ENST00000410804 122 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 BX323014.1-201ENST00000412876 237 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 TMSB10P2-201ENST00000416049 131 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 GAS5-208ENST00000425771 242 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 BX005214.1-201ENST00000427327 476 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 AP000695.2-201ENST00000428667 715 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 RPS20P5-201ENST00000434808 360 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 AL121974.1-201ENST00000437859 377 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 LINC01307-201ENST00000439146 474 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 RPL23AP93-201ENST00000440847 484 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 RPL7P52-201ENST00000449200 742 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 RNU6-1038P-201ENST00000516516 104 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 OR5M1-201ENST00000526538 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 AC010185.1-201ENST00000542489 456 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 AC096558.2-201ENST00000546678 506 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 AC118757.1-201ENST00000586982 453 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 AL590491.2-201ENST00000614608 499 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 MAP3K19-201ENST00000358371 3719 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 OR56A4-202ENST00000641156 3768 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 PSD3-201ENST00000286485 6665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 ZNF207-203ENST00000394670 13781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 GHR-207ENST00000537449 4419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 DSE-204ENST00000452085 10586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 USP9YP4-201ENST00000424401 1745 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 OR10Z1-202ENST00000641002 6323 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 A1CF-207ENST00000395495 9400 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 AC005005.4-201ENST00000623789 16698 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 BTBD10P1-201ENST00000549824 1352 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 PRG4-206ENST00000635041 4915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 Y_RNA.126-201ENST00000363382 111 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 VDAC1P9-201ENST00000412766 841 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 AF241725.1-201ENST00000416182 480 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 AL391807.1-202ENST00000419979 534 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 AC092811.1-201ENST00000428642 397 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 AL683807.1-202ENST00000432272 382 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 AL589765.3-201ENST00000446084 462 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 SNAP25-AS1-205ENST00000453544 368 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 RNU7-27P-201ENST00000459281 62 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 AC026410.2-201ENST00000460281 156 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 IGKV2-30-201ENST00000468494 390 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 RPL7L1P8-201ENST00000469911 741 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 AC104563.1-201ENST00000476147 376 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 AC008780.1-201ENST00000513392 409 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 RFPL4AP5-201ENST00000514977 504 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 RPS27AP18-201ENST00000515536 459 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 AC022882.1-201ENST00000532142 501 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 AP000857.1-201ENST00000532151 543 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 SULT1C2P1-202ENST00000562418 459 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 MIR99AHG-211ENST00000602323 475 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 ATP1B3P1-201ENST00000605365 821 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 LINC02098-201ENST00000608492 475 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 AC114781.5-201ENST00000615297 108 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 AP001005.3-201ENST00000622049 129 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 OR5B3-202ENST00000641865 1046 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 NSD1-204ENST00000439151 12892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 FOXP1-IT1-201ENST00000498714 3539 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 GABRG1-201ENST00000295452 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 GRIK2-204ENST00000369137 4272 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 ZNF567-203ENST00000585696 3734 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 DNAH6-202ENST00000389394 12795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 CTAGE5-208ENST00000553352 3441 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 FOXP2-205ENST00000393489 2285 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 SLCO1B7-201ENST00000421593 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 EPHA3-202ENST00000452448 2546 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.6 ms