Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 RUVBL2-214ENST00000640699 153 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 MTUS1-202ENST00000297488 3731 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 AL158066.1-201ENST00000451298 3796 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 PARP11-201ENST00000228820 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 PARP11-203ENST00000427057 4406 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 GABRG2-214ENST00000639111 11735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 LCMT1-AS2-202ENST00000565214 5666 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 SGMS2-201ENST00000359079 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 PKHD1-202ENST00000371117 16282 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 MYB-226ENST00000528774 2277 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 MYNN-203ENST00000544106 4815 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 OR6Y1-202ENST00000641282 3702 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 WDR7-201ENST00000254442 14083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 STAU2-220ENST00000522695 2646 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 AC004057.1-202ENST00000356247 284 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 RNA5SP183-201ENST00000362452 119 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 RNU1-130P-201ENST00000363930 160 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 TRAJ32-201ENST00000390505 66 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 RNU4-6P-201ENST00000410804 122 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 AC007738.1-201ENST00000413892 348 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 LINC00276-201ENST00000417751 596 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 BX510359.3-201ENST00000422168 306 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 AC108075.1-201ENST00000424692 529 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 TXNIP-201ENST00000425134 1225 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 AL139148.1-201ENST00000427122 680 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 AL590666.1-201ENST00000428641 433 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 KCNIP1-205ENST00000434108 726 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 AL121957.1-202ENST00000437040 329 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 LINC00969-211ENST00000438608 525 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 AL162388.1-201ENST00000450912 352 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 AL645608.2-201ENST00000458555 471 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 RN7SL30P-201ENST00000488416 306 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 AC110794.1-201ENST00000505816 425 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 HIGD1AP13-201ENST00000509878 289 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 AC092542.1-201ENST00000513155 355 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 RNU6-120P-201ENST00000516077 103 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 AF186190.1-201ENST00000517470 480 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 AC022679.1-202ENST00000520251 376 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 AC025437.5-201ENST00000522769 314 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 AP001189.6-201ENST00000528781 831 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 LINC01269-201ENST00000553682 602 ntTSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 MIR4293-201ENST00000584305 78 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 NF1P5-201ENST00000588287 448 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 SLC14A2-AS1-204ENST00000592899 359 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 IMMP1LP3-201ENST00000604197 224 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 AL512329.2-201ENST00000607350 548 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 AP005432.2-201ENST00000608162 586 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 PLCE1P1-201ENST00000622094 305 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 LINC01232-203ENST00000625369 576 ntTSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 LINC00706-201ENST00000628989 699 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 AC055839.1-201ENST00000634467 498 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 SMC2-203ENST00000374793 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 CCPG1-202ENST00000425574 1945 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 FZD6-205ENST00000522566 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 RANBP3L-202ENST00000502994 2278 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 MED12L-201ENST00000273432 6401 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 LINC01289-201ENST00000519550 3712 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 SCN3A-203ENST00000409101 6599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 SMG1P3-204ENST00000520823 3194 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 DNAH6-202ENST00000389394 12795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 ALB-201ENST00000295897 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 ZNF33CP-201ENST00000432492 2030 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 PCDH15-209ENST00000395433 6942 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 WFDC9-201ENST00000326000 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 SNORA2.3-201ENST00000383920 135 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 RNU6-171P-201ENST00000384354 107 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 AL391417.1-201ENST00000404100 426 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 GALNT3-202ENST00000409882 2107 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 AF015720.1-201ENST00000412240 349 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 HNRNPDLP1-201ENST00000412834 550 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 AL139095.3-201ENST00000419672 1203 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 E2F6P2-201ENST00000420708 748 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 AL513365.2-201ENST00000423060 529 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 COX6CP13-201ENST00000428703 226 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 HMGB1P12-201ENST00000438594 598 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 H2AFZP6-201ENST00000444403 394 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 AL161629.1-201ENST00000446201 457 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 NRG3-AS1-201ENST00000448936 555 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 AL161630.1-201ENST00000450938 1299 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 AL445433.1-201ENST00000457507 257 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 AC116533.1-201ENST00000459748 321 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 AC091180.1-201ENST00000462104 372 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CHRNEQ04844 RPL21P8-201ENST00000465083 535 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84 ms