Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 AP002340.1-201ENST00000529298 285 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
PTPRDP23468 AC087623.1-201ENST00000533301 377 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
PTPRDP23468 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PTPRDP23468 LAMTOR5-AS1-203ENST00000585330 463 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
PTPRDP23468 AP003117.1-201ENST00000602771 554 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PTPRDP23468 LIPI-204ENST00000614229 1439 ntTSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
PTPRDP23468 RN7SKP226-201ENST00000364912 300 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PTPRDP23468 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PTPRDP23468 OR5H8-201ENST00000394191 1045 ntAPPRIS P1 BASIC2.01□□□□□ -2.09
PTPRDP23468 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PTPRDP23468 HMGB1P45-201ENST00000435986 653 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PTPRDP23468 AC003001.1-201ENST00000443247 1135 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
PTPRDP23468 AC023424.2-201ENST00000493479 777 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PTPRDP23468 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PTPRDP23468 AC139718.1-201ENST00000508010 300 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
PTPRDP23468 RN7SKP219-201ENST00000516825 296 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PTPRDP23468 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PTPRDP23468 ZNF436-AS1-205ENST00000518600 376 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
PTPRDP23468 RRAS2-205ENST00000529237 1278 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
PTPRDP23468 AC008083.2-201ENST00000546707 476 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PTPRDP23468 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PTPRDP23468 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PTPRDP23468 AP005057.1-201ENST00000583827 574 ntTSL 4 BASIC2.01□□□□□ -2.09
PTPRDP23468 AC069304.3-201ENST00000603938 1084 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PTPRDP23468 AC093673.2-201ENST00000609674 331 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PTPRDP23468 AC055764.2-201ENST00000610089 670 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PTPRDP23468 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PTPRDP23468 AP003122.6-201ENST00000623831 495 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PTPRDP23468 AP005901.5-201ENST00000545779 1796 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PTPRDP23468 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
PTPRDP23468 CKAP2P1-201ENST00000555477 2049 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PTPRDP23468 CCDC169-201ENST00000239859 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
PTPRDP23468 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PTPRDP23468 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PTPRDP23468 AL162414.1-201ENST00000426204 744 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
PTPRDP23468 AC008067.1-203ENST00000430876 359 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
PTPRDP23468 AL590399.3-201ENST00000438072 543 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
PTPRDP23468 AL590664.1-201ENST00000448065 339 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PTPRDP23468 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PTPRDP23468 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PTPRDP23468 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PTPRDP23468 AC008687.2-201ENST00000597865 520 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PTPRDP23468 AL353811.1-201ENST00000602851 736 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
PTPRDP23468 AL391834.1-201ENST00000609609 560 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PTPRDP23468 AC006249.1-201ENST00000621223 471 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PTPRDP23468 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PTPRDP23468 ZBTB8OS-202ENST00000373501 598 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
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PTPRDP23468 GNGT1-204ENST00000430875 628 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
PTPRDP23468 LPP-AS1-201ENST00000434996 494 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
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PTPRDP23468 FABP5P13-201ENST00000452144 328 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PTPRDP23468 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PTPRDP23468 PDCD10-216ENST00000492396 814 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
PTPRDP23468 RN7SKP277-201ENST00000516895 283 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PTPRDP23468 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PTPRDP23468 INPP4B-223ENST00000630044 354 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
PTPRDP23468 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
PTPRDP23468 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
PTPRDP23468 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPRDP23468 TSHB-201ENST00000256592 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPRDP23468 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPRDP23468 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPRDP23468 AC004994.1-201ENST00000447057 313 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPRDP23468 FO393415.3-201ENST00000456424 375 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPRDP23468 RPL30P11-201ENST00000495304 339 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
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PTPRDP23468 AC023200.1-201ENST00000519660 651 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPRDP23468 DEUP1-203ENST00000527307 767 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPRDP23468 AC090771.2-201ENST00000588794 571 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPRDP23468 AC013286.1-201ENST00000412137 381 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPRDP23468 AC244098.2-201ENST00000422068 99 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPRDP23468 ISCA1P6-201ENST00000427740 390 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPRDP23468 AC023347.2-201ENST00000433994 462 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
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PTPRDP23468 CYP3A43-210ENST00000444905 733 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPRDP23468 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPRDP23468 RBM43P1-201ENST00000476891 1081 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPRDP23468 FAM172BP-201ENST00000487497 1089 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPRDP23468 SNORD59.2-201ENST00000516873 68 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPRDP23468 RN7SKP234-201ENST00000517173 224 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPRDP23468 AL359233.1-201ENST00000554029 364 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPRDP23468 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPRDP23468 AC124283.4-201ENST00000581815 456 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPRDP23468 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPRDP23468 AL590410.1-201ENST00000617925 333 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPRDP23468 RAD51AP1-201ENST00000228843 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPRDP23468 OR8H1-201ENST00000313022 1038 ntAPPRIS P2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPRDP23468 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPRDP23468 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPRDP23468 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPRDP23468 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPRDP23468 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPRDP23468 AL157884.2-201ENST00000424177 551 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPRDP23468 TRIM60P3Y-201ENST00000432201 673 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPRDP23468 RPS26P56-201ENST00000444468 240 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPRDP23468 HRAT17-201ENST00000447785 547 ntTSL 4 BASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPRDP23468 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
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