Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 AC025244.2-201ENST00000509215 422 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXD8P13378 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXD8P13378 AP001880.2-201ENST00000538233 448 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXD8P13378 TRAV30-201ENST00000557168 337 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXD8P13378 GAPLINC-202ENST00000579007 643 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXD8P13378 MIR5096-201ENST00000583713 70 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXD8P13378 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXD8P13378 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXD8P13378 AC020634.1-201ENST00000608701 549 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXD8P13378 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXD8P13378 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXD8P13378 MIR6864-201ENST00000617935 70 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXD8P13378 AC067931.1-201ENST00000624190 671 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXD8P13378 PNPLA4-203ENST00000444736 2752 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXD8P13378 DST-205ENST00000370765 8999 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXD8P13378 SLC26A7-201ENST00000276609 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXD8P13378 MAPK10-304ENST00000641341 3984 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXD8P13378 LRRC19-201ENST00000380055 3609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXD8P13378 RFC1-201ENST00000349703 4859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXD8P13378 AL122126.1-201ENST00000546905 1318 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXD8P13378 FOXP2-209ENST00000393498 2617 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXD8P13378 ZBTB8A-202ENST00000373510 7075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXD8P13378 MFAP1-201ENST00000267812 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXD8P13378 COPB2-205ENST00000507777 3034 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXD8P13378 GPHN-204ENST00000543237 2459 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXD8P13378 ADAMDEC1-204ENST00000522298 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXD8P13378 C1orf54-201ENST00000369098 418 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXD8P13378 AL035079.1-201ENST00000405210 287 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXD8P13378 AC114755.2-201ENST00000413520 361 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXD8P13378 LINC00415-201ENST00000439079 435 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXD8P13378 AC000111.2-201ENST00000448200 210 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXD8P13378 AL365271.1-201ENST00000448909 603 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXD8P13378 AC117465.1-201ENST00000457125 522 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXD8P13378 AC010326.1-201ENST00000462726 602 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXD8P13378 MRPS33-209ENST00000496958 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXD8P13378 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXD8P13378 FTH1P24-201ENST00000503502 462 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXD8P13378 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXD8P13378 RN7SKP276-201ENST00000516242 268 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXD8P13378 snoU109.6-201ENST00000516831 118 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXD8P13378 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXD8P13378 OR8R1P-201ENST00000543943 764 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXD8P13378 LINC00644-201ENST00000555156 295 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXD8P13378 MIR5692C1-201ENST00000585309 91 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXD8P13378 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXD8P13378 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXD8P13378 TEK-205ENST00000615002 4666 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXD8P13378 RYR3-209ENST00000634418 15078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXD8P13378 AL445437.1-201ENST00000623157 3087 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXD8P13378 RYR3-201ENST00000389232 15552 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXD8P13378 SMG1P3-204ENST00000520823 3194 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXD8P13378 ALB-202ENST00000401494 1659 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXD8P13378 OR2A7-202ENST00000641841 2062 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXD8P13378 FAM35A-202ENST00000298786 3614 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXD8P13378 ISPD-AS1-202ENST00000438573 2252 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXD8P13378 RAPGEF2-201ENST00000264431 6949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXD8P13378 OR8J2-201ENST00000641465 2883 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXD8P13378 WEE2-201ENST00000397541 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXD8P13378 HIF1AN-201ENST00000299163 13011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXD8P13378 MYB-239ENST00000534121 2238 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXD8P13378 TMEM68-209ENST00000521229 2400 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXD8P13378 RALGAPA1P1-201ENST00000443361 6232 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXD8P13378 KATNA1-202ENST00000335647 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXD8P13378 TTBK2-201ENST00000267890 10905 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXD8P13378 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXD8P13378 RNU6-249P-201ENST00000363016 102 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXD8P13378 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXD8P13378 CARD16-202ENST00000375706 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXD8P13378 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXD8P13378 Y_RNA.493-201ENST00000384422 102 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXD8P13378 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXD8P13378 U3.30-201ENST00000391308 210 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXD8P13378 AL583834.1-201ENST00000406943 343 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXD8P13378 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXD8P13378 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXD8P13378 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXD8P13378 AL592494.1-201ENST00000437523 309 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXD8P13378 AC005871.1-201ENST00000450247 475 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXD8P13378 AL691482.1-201ENST00000453255 87 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXD8P13378 AL356981.1-201ENST00000454879 684 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXD8P13378 AC005008.1-201ENST00000456151 612 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXD8P13378 C10orf128-207ENST00000474718 614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXD8P13378 RN7SL432P-201ENST00000484057 298 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXD8P13378 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXD8P13378 AC008574.1-201ENST00000514240 433 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXD8P13378 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXD8P13378 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXD8P13378 AP001992.1-201ENST00000533875 723 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXD8P13378 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXD8P13378 AC104002.2-201ENST00000553919 318 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXD8P13378 AL160191.1-202ENST00000554008 576 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXD8P13378 SULT1C2P2-201ENST00000562517 294 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXD8P13378 AC124068.1-201ENST00000563131 678 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXD8P13378 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXD8P13378 AC104687.2-201ENST00000604442 342 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXD8P13378 LDHA-225ENST00000625635 141 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXD8P13378 ZNF345-216ENST00000640438 963 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXD8P13378 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXD8P13378 AC090826.1-202ENST00000562009 3337 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXD8P13378 LCLAT1-203ENST00000379509 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
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