Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SHOC2Q9UQ13 AC105429.2-201ENST00000610567 517 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SHOC2Q9UQ13 AC099669.2-201ENST00000616549 437 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SHOC2Q9UQ13 AL445567.2-201ENST00000618935 498 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SHOC2Q9UQ13 AC002550.2-201ENST00000621246 394 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SHOC2Q9UQ13 MIR6830-201ENST00000636015 70 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SHOC2Q9UQ13 OSBPL8-202ENST00000393249 7047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
SHOC2Q9UQ13 CCNH-206ENST00000508855 2391 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
SHOC2Q9UQ13 ZFYVE16-201ENST00000338008 6773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
SHOC2Q9UQ13 OR2H1-202ENST00000377133 3021 ntAPPRIS P1 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SHOC2Q9UQ13 SLC26A7-209ENST00000617078 5094 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SHOC2Q9UQ13 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
SHOC2Q9UQ13 DTWD2-201ENST00000304058 4365 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
SHOC2Q9UQ13 Z82217.1-201ENST00000625157 8149 ntBASIC4.21□□□□□ -1.73
SHOC2Q9UQ13 GTDC1-206ENST00000409214 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 RANBP6-201ENST00000259569 4576 ntAPPRIS P1 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 PCDH15-234ENST00000622048 6820 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 POLR2B-201ENST00000314595 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 LRRC69-201ENST00000343709 720 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 PRIM2-202ENST00000370687 909 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 AKAP14-204ENST00000371431 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 SNORA20.2-201ENST00000383922 131 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 AL078590.1-201ENST00000412602 479 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 AC008154.2-201ENST00000420268 414 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 RPS27AP12-201ENST00000429552 465 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 RPL29P29-201ENST00000448725 423 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 AC133473.1-201ENST00000455173 299 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 LINC00430-201ENST00000457672 597 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 AL645608.2-201ENST00000458555 471 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 RNA5SP246-201ENST00000458909 119 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 AC010618.1-201ENST00000469924 477 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 MCCC1-AS1-201ENST00000471731 765 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 AC023598.1-201ENST00000472521 361 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 CEACAMP10-202ENST00000495431 496 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 AC004704.1-201ENST00000511219 583 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 SNORA31.9-201ENST00000516429 84 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 RNU7-143P-201ENST00000516781 65 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 AC145141.2-201ENST00000518473 501 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 OR5AQ1P-201ENST00000527596 927 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 LINC02286-201ENST00000552425 285 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 SUB1P2-201ENST00000556401 297 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 HMGB1P33-201ENST00000563485 527 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 BLOC1S6-206ENST00000564765 706 ntTSL 4 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 AL360157.1-201ENST00000565962 87 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 AC092138.1-201ENST00000568659 472 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 AC022655.2-201ENST00000577280 318 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 AC104365.1-201ENST00000588835 394 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 AC068790.5-201ENST00000602741 355 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 AL136363.1-201ENST00000605349 337 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 AC097478.4-201ENST00000615968 522 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 LARP1BP1-201ENST00000506036 1359 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 HSP90AA5P-201ENST00000438353 2192 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 ZNF322-205ENST00000471278 2675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 ZNF705E-201ENST00000525199 3442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 ANKRD20A10P-201ENST00000457591 1515 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 KCNU1-201ENST00000399881 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 TNFAIP8-203ENST00000415806 1990 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 XIRP2-204ENST00000409273 12269 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 AC010186.3-201ENST00000537616 2508 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 AL390198.1-201ENST00000376445 320 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.390-201ENST00000383932 102 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.453-201ENST00000384223 109 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 TRAJ32-201ENST00000390505 66 ntAPPRIS P1 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 MIR1277-201ENST00000408536 78 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 MTCYBP24-201ENST00000420387 1106 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 NBDY-202ENST00000423617 543 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 AL355674.1-201ENST00000423681 648 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 AC000111.3-201ENST00000433478 193 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 AL356535.1-201ENST00000440335 398 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 AL662791.1-201ENST00000441992 928 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 AL136380.1-201ENST00000447970 162 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 TPT1P14-201ENST00000448018 505 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 NFU1P2-201ENST00000448700 469 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 AL160162.1-201ENST00000456715 442 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 AL390730.1-201ENST00000457106 692 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 RPS23P7-201ENST00000466210 444 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 AC097521.1-201ENST00000505488 567 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 RNU6-798P-201ENST00000516912 103 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 AC022616.3-201ENST00000523940 148 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 AC103798.1-201ENST00000532562 376 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 SNHG1-219ENST00000542112 780 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 AL163973.3-201ENST00000547093 430 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 GNRHR2P1-201ENST00000555315 631 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 LINC02562-201ENST00000561705 785 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 AC064805.2-201ENST00000582959 523 ntTSL 4 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 LINC01905-202ENST00000588139 459 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 AC027514.2-201ENST00000591014 637 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 AP000907.4-201ENST00000604143 237 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 AC083809.1-201ENST00000615051 472 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 AC010722.1-201ENST00000622595 582 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 AL356585.4-201ENST00000623078 1229 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 OR52H1-202ENST00000641796 1061 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 AL356489.2-201ENST00000566968 3528 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 ZNF616-201ENST00000330123 2563 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 HMGB1-204ENST00000399489 1727 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 LLPH-201ENST00000266604 7746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 NEDD4-201ENST00000338963 7019 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
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