Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 ALG6-201ENST00000263440 1895 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB23Q9ULC3 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB23Q9ULC3 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB23Q9ULC3 LINC01419-201ENST00000522365 1521 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB23Q9ULC3 ATP6V1G3-202ENST00000309309 678 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB23Q9ULC3 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB23Q9ULC3 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB23Q9ULC3 RNA5SP38-201ENST00000410750 119 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB23Q9ULC3 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB23Q9ULC3 TRIM60P5Y-201ENST00000413946 574 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB23Q9ULC3 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB23Q9ULC3 B3GALNT1P1-201ENST00000420569 975 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB23Q9ULC3 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB23Q9ULC3 LINC01802-201ENST00000438824 523 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB23Q9ULC3 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB23Q9ULC3 LINC00692-201ENST00000451284 932 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB23Q9ULC3 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB23Q9ULC3 AL358176.1-201ENST00000457477 357 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB23Q9ULC3 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB23Q9ULC3 AC009901.1-201ENST00000506703 541 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB23Q9ULC3 AC105914.1-201ENST00000511798 226 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB23Q9ULC3 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB23Q9ULC3 RPL7P20-201ENST00000520308 745 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB23Q9ULC3 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB23Q9ULC3 AP000916.1-201ENST00000533869 835 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB23Q9ULC3 OR8K4P-201ENST00000534608 872 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB23Q9ULC3 SYNE2-210ENST00000553455 674 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB23Q9ULC3 AL359238.1-201ENST00000557770 744 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB23Q9ULC3 AC023824.3-201ENST00000569003 562 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB23Q9ULC3 AC091132.5-202ENST00000587078 501 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB23Q9ULC3 AL590227.1-201ENST00000622616 315 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB23Q9ULC3 BTG3-AS1-201ENST00000626994 552 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB23Q9ULC3 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RAB23Q9ULC3 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
RAB23Q9ULC3 RNU6-1249P-201ENST00000363237 111 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RAB23Q9ULC3 RNVU1-3-201ENST00000364313 161 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RAB23Q9ULC3 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RAB23Q9ULC3 MIR649-201ENST00000384843 97 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RAB23Q9ULC3 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RAB23Q9ULC3 UBE2V1P15-201ENST00000407776 448 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RAB23Q9ULC3 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RAB23Q9ULC3 AL117337.1-201ENST00000412789 444 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RAB23Q9ULC3 AL445183.3-201ENST00000414168 502 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RAB23Q9ULC3 BX276092.3-201ENST00000424182 230 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RAB23Q9ULC3 AC092839.2-201ENST00000431130 377 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RAB23Q9ULC3 AL354977.1-201ENST00000438147 679 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RAB23Q9ULC3 AC092170.1-201ENST00000440211 356 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RAB23Q9ULC3 LINC01004-201ENST00000445184 686 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RAB23Q9ULC3 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RAB23Q9ULC3 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RAB23Q9ULC3 OR6C68-201ENST00000548615 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RAB23Q9ULC3 AL035071.2-201ENST00000565572 459 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RAB23Q9ULC3 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RAB23Q9ULC3 OR4H6P-202ENST00000603819 340 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RAB23Q9ULC3 AC128687.1-201ENST00000605304 619 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RAB23Q9ULC3 AC007275.1-201ENST00000621243 671 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RAB23Q9ULC3 AC098679.5-201ENST00000624394 571 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RAB23Q9ULC3 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RAB23Q9ULC3 RNU1-35P-201ENST00000362782 153 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RAB23Q9ULC3 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RAB23Q9ULC3 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RAB23Q9ULC3 DEFB133-201ENST00000398721 186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
RAB23Q9ULC3 RPL7P8-201ENST00000411964 730 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RAB23Q9ULC3 AC233981.1-201ENST00000423224 461 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RAB23Q9ULC3 AL035410.1-201ENST00000427409 427 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RAB23Q9ULC3 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RAB23Q9ULC3 AL021393.1-201ENST00000456740 539 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RAB23Q9ULC3 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RAB23Q9ULC3 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RAB23Q9ULC3 OTUD4-208ENST00000509620 864 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
RAB23Q9ULC3 SNORA76.2-201ENST00000517095 137 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RAB23Q9ULC3 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RAB23Q9ULC3 HPRT1P3-201ENST00000539521 576 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RAB23Q9ULC3 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RAB23Q9ULC3 AC079362.1-201ENST00000546865 525 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RAB23Q9ULC3 AL356804.1-201ENST00000553791 448 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RAB23Q9ULC3 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RAB23Q9ULC3 AC090409.2-202ENST00000585706 604 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RAB23Q9ULC3 AC063944.1-210ENST00000593837 519 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RAB23Q9ULC3 AC100814.1-201ENST00000606963 623 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RAB23Q9ULC3 AC112503.2-201ENST00000609005 552 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RAB23Q9ULC3 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RAB23Q9ULC3 TRAPPC13-208ENST00000505553 1410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
RAB23Q9ULC3 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
RAB23Q9ULC3 AP000526.1-201ENST00000603308 1388 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RAB23Q9ULC3 AC008432.1-201ENST00000615912 1320 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RAB23Q9ULC3 GMFB-208ENST00000554908 6721 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
RAB23Q9ULC3 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
RAB23Q9ULC3 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
RAB23Q9ULC3 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RAB23Q9ULC3 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RAB23Q9ULC3 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RAB23Q9ULC3 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RAB23Q9ULC3 AL357078.2-201ENST00000416486 427 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RAB23Q9ULC3 DUTP6-201ENST00000425573 462 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RAB23Q9ULC3 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RAB23Q9ULC3 AL162725.2-201ENST00000430545 748 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
RAB23Q9ULC3 MUPP-201ENST00000438111 566 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RAB23Q9ULC3 MTCO3P43-201ENST00000440974 771 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RAB23Q9ULC3 AL589963.1-201ENST00000449282 727 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
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